S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

AI5_ALPHA

Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -998 -980 -958 -956 -954 -946 -944 -942 -940 -938 -936 -934 -932 -921 -914 -870 -868 -866 -829 -827 -825 -804 -755 -714 -712 -710 -704 -683 -681 -679 -677 -672 -667 -662 -653 -651 -649 -647 -645 -643 -637 -635 -633 -631 -626 -624 -604 -560 -548 -496 -494 -469 -456 -429 -411 -376 -374 -372 -370 -361 -341 -339 -337 -335 -333 -331 -301 -292 -290 -288 -286 -255 -231 -194 -131 -111 -50 -21 -19

>AI5_ALPHA    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TTATATATTTAATACTAAAAATATAACTACATTACTTTTTTAATATAan>TAan>TAACAATATAan>T
ATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TATTAATTATATAAAATATAATACTCTATATTAAATATTATTTTTATCA
ATATTTATTTATATAan>TAan>TAATAATAATAATAATAATCAATATTAATTATTTATATAan>TAan>TA
AGATTAATATTATTTAATATATTATGAATAATTTAATTAATAAATCTTTAAATATTATCA
TAAAAATATAAATTAAATAATTTCTTATTTATAATAAAGAATAATAATATAan>TAan>TAAATAT
AATAAAGAATGTAAATAATATAan>TAan>TAan>TAATATAATATAATATAAAAAATATAan>TAan>TAan>TAan>TA
>TAAATATAan>TAan>TAan>TAATATAan>TAGATAATAATATTTTTATATAATTTATTTTATTATTAAGT
AATAAATAATAAAAAAATCAATATATTAAATAATATATTTATATTAGTTCGGTTTAGTTG
GTATTTTGTAATGAGTAAAAAGTAATATAan>TAATATTAAATAATAAGTATTGATATAAGTA
ATAGATATAATAATAATATTATTAATATTTTATATAAATAATATTAATAATATAGATTAT
GAAAGAGAGTATTAATATCATTAAATATAan>TAan>TAan>TATGTTATATAATTTAAATGATTTTAA
TATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TATTATATTATAGATTATGATACATTTATATAAATAATATAan>TAan>TAan>TAA
AAATTAATTATACTATTACTTTATAATATAATAATATTTATTTATAAAGATATAAAAGAA
TTGTTTAAAGTTATAACTAAAATATTATATAGTATTCATTAATAATTAATATTATAAATT
CAACTATTGTTATATTTATAAATAGAATAATATATTATTATCCTTTAAGATATAACAATA
ATTATTTAAATTAAATTAAATTAAATTTAATTAATTTTTTTTTTTAATGAATATAATAAT
AATAATATTATTAAAATTAATATAan>TAAAAAAAAAGTAAAA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -15 -125 -145 -190 -282 -284 -286 -297 -320 -325 -327 -329 -331 -333 -335 -357 -364 -366 -368 -370 -425 -490 -536 -542 -554 -600 -620 -627 -629 -631 -639 -641 -643 -645 -647 -673 -675 -677 -706 -708 -798 -821 -823 -825 -862 -864 -866 -898 -917 -926 -928 -930 -932 -934 -936 -938 -940 -950 -952 -992 -994

>AI5_ALPHA	Upstream Sequence Complementary Strand
AATATAan>TAAATTATGATTTTTATATTGATGTAATGAAAAAATTATATAan>TATTGTTATATA
>TATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAATTAATATATTTTATATTATGAGATATAATTTATAATAAAAATAGT
TATAAATAAATATAan>TAan>TATTATTATTATTATTATTAGTTATAATTAATAAATATAan>TAan>TAT
TCTAATTATAATAAATTATATAATACTTATTAAATTAATTATTTAGAAATTTATAATAGT
ATTTTTATATTTAATTTATTAAAGAATAAATATTATTTCTTATTATTATATAan>TATTTATA
TTATTTCTTACATTTATTATATAan>TAan>TATTATATTATATTATATTTTTTATATAan>TAan>TAan>TAan>T
ATTTATATAan>TAan>TATTATATATCTATTATTATAAAAATATATTAAATAAAATAATAATTCA
TTATTTATTATTTTTTTAGTTATATAATTTATTATATAAATATAATCAAGCCAAATCAAC
CATAAAACATTACTCATTTTTCATTATATATTATAATTTATTATTCATAACTATATTCAT
TATCTATATTATTATTATAATAATTATAAAATATATTTATTATAATTATTATATCTAATA
CTTTCTCTCATAATTATAGTAATTTATATAan>TAan>TAan>TACAATATATTAAATTTACTAAAATT
ATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAATATAATATCTAATACTATGTAAATATATTTATTATATAan>TAan>TATT
TTTAATTAATATGATAATGAAATATTATATTATTATAAATAAATATTTCTATATTTTCTT
AACAAATTTCAATATTGATTTTATAATATATCATAAGTAATTATTAATTATAATATTTAA
GTTGATAACAATATAAATATTTATCTTATTATATAATAATAGGAAATTCTATATTGTTAT
TAATAAATTTAATTTAATTTAATTTAAATTAATTAAAAAAAAAAATTACTTATATTATTA
TTATTATAATAATTTTAATTATATATTTTTTTTTCATTTT