S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

CSS3

Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -914 -842 -674 -607 -308 -255

>CSS3    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
GCTCATTTAATATTAGGTATTTTGCCCATGTCATTTTTGTGCAAGTCATTTTCTCCTTTG
GAACTAAATTTTCTTTAAAATATCTCATATACAAAAAATCCTAACTCACAAGTTAATGTT
TTCCATCATAAGTAGACGTTTATTTAAAACATGTTATTATATATTGATCCACTCTTTGCA
GTGTCGTTTTCCTACAAAAATTAGATACTTAATCTTGAGGAGTGTAGAAATAAGTGAAGG
CGACATAAAGATAGAGAAACAGCCATGAAATTTAGTGAAAGCTGACACTCAAGAATTAGG
AATGTAATAAGATAATGAATCACAACATATAAAATGGAAAGTGAAGTAATAATACTATTC
TATAGAATAATCGACGATCCTTCATGAATTGCTATATATCTGAGGAGAACTTCTAGCATA
TCCTGCATACCTAATATTATAGCCTTCAATAATAATGAAAATCCTAACAATTATCCAATT
ATTCACCAAATTCTCTATTTCAACAGTAGTATTATGGCATTGATTATATTGCAAGCTATA
GATTCGATTTCATGAATTCATAACACTCTAAAAGAGAACTTCTGCAATACTCTGTACAAA
TAACATTATTACTTTTACTAAAAATAGATTTCCGGACACTAACTTTTGAATTCTTATCAA
AGCAGTCGAATGCCGCGTCCTACGGTTTATGTATATAGATTTAAAAATACACGTTAAAGA
CTGTTTTCTCCATAATTCTTGTTTAATATACCTATGAACATAAGCGAGTCAATCAAACTC
GGGAGTAAAATGCTTTAAGGCACGCCGCTTAACCTTTTAAAATACATGTCTGAACATTAT
GTAACCAAACTAAAATTGCTTTTAAATGGATCCGCGCAATATCTAAAAACATTAACTATA
AAGGATAAAAATTTTGGACAAAAAATAGCAGTAGCATGTTTGCTTCCTAAGCGTTTGAAG
TCAAAACCATTTTTAAAAGGGTAGAGAGGCTTAGTAAAAA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -304 -471 -601 -603 -836 -838

>CSS3	Upstream Sequence Complementary Strand
CGAGTAAATTATAATCCATAAAACGGGTACAGTAAAAACACGTTCAGTAAAAGAGGAAAC
CTTGATTTAAAAGAAATTTTATAGAGTATATGTTTTTTAGGATTGAGTGTTCAATTACAA
AAGGTAGTATTCATCTGCAAATAAATTTTGTACAATAATATAan>TAACTAGGTGAGAAACGT
CACAGCAAAAGGATGTTTTTAATCTATGAATTAGAACTCCTCACATCTTTATTCACTTCC
GCTGTATTTCTATCTCTTTGTCGGTACTTTAAATCACTTTCGACTGTGAGTTCTTAATCC
TTACATTATTCTATTACTTAGTGTTGTATATTTTACCTTTCACTTCATTATTATGATAAG
ATATCTTATTAGCTGCTAGGAAGTACTTAACGATATAan>TAGACTCCTCTTGAAGATCGTAT
AGGACGTATGGATTATAATATCGGAAGTTATTATTACTTTTAGGATTGTTAATAGGTTAA
TAAGTGGTTTAAGAGATAAAGTTGTCATCATAATACCGTAACTAATATAACGTTCGATAT
CTAAGCTAAAGTACTTAAGTATTGTGAGATTTTCTCTTGAAGACGTTATGAGACATGTTT
ATTGTAATAATGAAAATGATTTTTATCTAAAGGCCTGTGATTGAAAACTTAAGAATAGTT
TCGTCAGCTTACGGCGCAGGATGCCAAATACATATATCTAAATTTTTATGTGCAATTTCT
GACAAAAGAGGTATTAAGAACAAATTATATGGATACTTGTATTCGCTCAGTTAGTTTGAG
CCCTCATTTTACGAAATTCCGTGCGGCGAATTGGAAAATTTTATGTACAGACTTGTAATA
CATTGGTTTGATTTTAACGAAAATTTACCTAGGCGCGTTATAGATTTTTGTAATTGATAT
TTCCTATTTTTAAAACCTGTTTTTTATCGTCATCGTACAAACGAAGGATTCGCAAACTTC
AGTTTTGGTAAAAATTTTCCCATCTCTCCGAATCATTTTT