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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name LDB17
Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -662 -553 -383 -381 -379
>LDB17    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TACAAAATGATTTAATTCACAAAATCCAGAATGATAACAACCTGAAAAAATTAGAAAGCC
AAGAATCTTTAGTAAAATTGTTTACTACGAATGAGTTGATGAGATGGCCAATTGTTCAAA
AAACCTATGAGCCCGTCTTAAATGAGGATGATTTGGCATTTGGTGGAGAAGCTAATAAGC
ATCACTGGGAAGATTTACAAAAAAGGGTCATCGAGCACAATTTAAGAGTCATTTCCGAAT
ACTATTCCAGAATTACTTTACTAAGATTGAATGAATTGCTGGACCTAACGGAGAGCCAGA
CGGAAACATACATCAGTGATTTGGTAAACCAGGGCATCATATACGCTAAAGTTAATCGCC
CAGCCAAAATCGTGAATTTTGAAAAACCAAAAAACTCAAGCCAATTATTGAACGAATGGT
CACATAATGTTGACGAACTATTAGAACATATAGAAACAATAGGCCATTTAATTACAAAAG
AGGAAATCATGCACGGTTTGCAAGCTAAATGAAGAGATTTTCGAGTAAGTGTCGGATTAT
CTCAGATCCGGTTTTGATTTTAAATCTGTTACTAATCGAAATGTGTATTTACGTACGTGA
GATAAAATTATCTATGCATATAan>TAan>TAACTCAAATGGAAAATGGCCACGTATTGCTCTCAT
TCTCTTCACTTGCTTACACAAAACATAAGGTGACAATTAATGGAATTTTAGTTTTTCAAT
TTTTCAGGGGAAAGAAGACACCCAAAAAAAAAGTGAAAAGTCAAAACGGTAAACTGTTTA
TGGTATTTAAATGACATTAATAGCAGCGTAAAGAGTCATTTTTTCGTTTGATTAGCAAAA
CTCTGAACATTAATTACTACACCTATAGACATATCTTTAAACAGTGAAATATTTTTTTCA
TTTAGTAAACAAGAATTAAACTTTGAATATTTTTTTTTCGATTAACTTATGTCACTTTAG
CCTATACTTTCTTCGAACATTTTTCCTTTCATTTTGACTC
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -375 -377
>LDB17	Upstream Sequence Complementary Strand
ATGTTTTACTAAATTAAGTGTTTTAGGTCTTACTATTGTTGGACTTTTTTAATCTTTCGG
TTCTTAGAAATCATTTTAACAAATGATGCTTACTCAACTACTCTACCGGTTAACAAGTTT
TTTGGATACTCGGGCAGAATTTACTCCTACTAAACCGTAAACCACCTCTTCGATTATTCG
TAGTGACCCTTCTAAATGTTTTTTCCCAGTAGCTCGTGTTAAATTCTCAGTAAAGGCTTA
TGATAAGGTCTTAATGAAATGATTCTAACTTACTTAACGACCTGGATTGCCTCTCGGTCT
GCCTTTGTATGTAGTCACTAAACCATTTGGTCCCGTAGTATATGCGATTTCAATTAGCGG
GTCGGTTTTAGCACTTAAAACTTTTTGGTTTTTTGAGTTCGGTTAATAACTTGCTTACCA
GTGTATTACAACTGCTTGATAATCTTGTATATCTTTGTTATCCGGTAAATTAATGTTTTC
TCCTTTAGTACGTGCCAAACGTTCGATTTACTTCTCTAAAAGCTCATTCACAGCCTAATA
GAGTCTAGGCCAAAACTAAAATTTAGACAATGATTAGCTTTACACATAAATGCATGCACT
CTATTTTAATAGATACGTATATAan>TATTGAGTTTACCTTTTACCGGTGCATAACGAGAGTA
AGAGAAGTGAACGAATGTGTTTTGTATTCCACTGTTAATTACCTTAAAATCAAAAAGTTA
AAAAGTCCCCTTTCTTCTGTGGGTTTTTTTTTCACTTTTCAGTTTTGCCATTTGACAAAT
ACCATAAATTTACTGTAATTATCGTCGCATTTCTCAGTAAAAAAGCAAACTAATCGTTTT
GAGACTTGTAATTAATGATGTGGATATCTGTATAGAAATTTGTCACTTTATAAAAAAAGT
AAATCATTTGTTCTTAATTTGAAACTTATAAAAAAAAAGCTAATTGAATACAGTGAAATC
GGATATGAAAGAAGCTTGTAAAAAGGAAAGTAAAACTGAG
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