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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name Q0297
Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -982 -971 -966 -964 -962 -954 -952 -940 -899 -892 -827 -717 -706 -684 -668 -663 -653 -631 -629 -576 -574 -572 -570 -568 -566 -545 -540 -528 -526 -473 -438 -436 -407 -391 -384 -351 -349 -327 -296 -287 -227 -225 -211 -202 -182 -99 -97 -95 -80 -48 -38
>Q0297    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TATAGGAAGTTAATAATAATATAAATATTATATAATATAan>TAan>TATGTATATAan>TATTATATT
ATATAATTAATTTTCTCCTTTTGTATTTACATCTTAATAAAATATAAAATATAAAATGTT
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AATATAan>TAan>TAAAAAGTCATTATATAAATTTAATTATAATTTAAATAAATTTTATATAAAT
TAATATAATATTAATAAAGTAATTAGTATAAATAAATAAT
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -44 -76 -91 -93 -176 -178 -207 -212 -221 -247 -281 -323 -345 -369 -380 -385 -401 -432 -469 -522 -560 -562 -564 -566 -568 -570 -572 -577 -623 -625 -627 -647 -649 -678 -700 -711 -821 -823 -936 -941 -946 -948 -950 -956 -958 -960 -967
>Q0297	Upstream Sequence Complementary Strand
ATATCCTTCAATTATTATTATATTTATAATATATTATATAan>TAan>TACATATAan>TAan>TAATATAA
TATA
TTAATTAAAAGAGGAAAACATAAATGTAGAATTATTTTATATTTTATATTTTACAA
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