S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

YNCQ0004W

Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -992 -910 -908 -881 -876 -874 -825 -676 -670 -659 -635 -633 -631 -629 -627 -625 -623 -594 -587 -581 -562 -560 -558 -556 -548 -546 -530 -528 -526 -515 -495 -486 -484 -473 -448 -385 -383 -364 -334 -332 -330 -322 -320 -318 -316 -314 -312 -28 -26 -24 -22 -20 -5

>YNCQ0004W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TATTAAAAATATAATTAACAAGAATAAATAGTCCGTGGGATCGAACCCCCTTTTTTATTT
AATATTTAATATTTAAAGAAGGAATTGTTTATATAan>TATTAATATCTTATTTGGGGATTAA
TATAATATAan>TAAGTTTTGGATACCAGGCCAAAGACCGGAATCCCAAAAGGAGATTATATA
AATATTATTTATCTCCCTTTTTTAATATTATAATAATTTTATTAAAAATAAAATAATAAT
AATAATTATAATTTATAATAACAATTATAATAATTTAATTAATTAATTAATTAATTAATT
AATTAATTAATTAATTAATAATAAATATAAATATAAAAAGAATATAATTTATAATAAATA
AATTTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TATTAAATAAAATATTTACTTCATTAATATAAAATATAAA
TATATTTAATTAATAAGTATATAan>TAan>TAan>TAATAATATAan>TAATAACCTATTTATATAan>TAan>TAA
TCTTAATATAATTATAAGAAATATTATATAAGTAATATAan>TAAAAATAATATAAAATAATT
ATAATTCAATTTATATATTAATAGTTCCGGGGCCCGGCCACGGGAGCCGGAACCCCGAAA
GGAGGAATAAGATAAATATAan>TAAATTATATTAATAAATATAAATTTTAAATGAATTAATA
AAATTAATATAan>TAan>TATGTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TATTAAAAATATTTAATTATTTTTAGGAA
GGAGTGATAGATCCCTTTGGGGGACCGAACCCCTATTTAAGAAGGAGTGCGGGACCCCGT
GGGAACCGAACCCCTTTTTTATTTAAAGAAGAAGTTTTATTTTATTTTATTTTATTTTAT
TTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTAATTTAATTTTAATTAGGTTAAT
AAATAGTAATAATAAACTTAATAATAATAATAATAATTTTATTTTTATAATTTATTAATA
ATAATAATAATTATATAan>TAan>TAan>TAan>TATTATTAATAAATATA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -14 -16 -18 -20 -22 -24 -306 -308 -310 -312 -314 -316 -318 -324 -326 -328 -370 -379 -442 -444 -480 -491 -522 -524 -526 -542 -552 -554 -556 -558 -575 -617 -619 -621 -623 -625 -627 -629 -631 -821 -870 -902 -904 -906

>YNCQ0004W	Upstream Sequence Complementary Strand
ATAATTTTTATATTAATTGTTCTTATTTATCAGGCACCCTAGCTTGGGGGAAAAAATAAA
TTATAAATTATAAATTTCTTCCTTAACAAATATAan>TAan>TAATTATAGAATAAACCCCTAATT
ATATTATATATTCAAAACCTATGGTCCGGTTTCTGGCCTTAGGGTTTTCCTCTAATATAT
TTATAATAAATAGAGGGAAAAAATTATAATATTATTAAAATAATTTTTATTTTATTATTA
TTATTAATATTAAATATTATTGTTAATATTATTAAATTAATTAATTAATTAATTAATTAA
TTAATTAATTAATTAATTATTATTTATATTTATATTTTTCTTATATTAAATATTATTTAT
TTAAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAATTTATTTTATAAATGAAGTAATTATATTTTATATTT
ATATAAATTAATTATTCATATAan>TAan>TAan>TATTATTATATATTATTGGATAAATATAan>TAan>TATT
AGAATTATATTAATATTCTTTATAATATATTCATTATATATTTTTATTATATTTTATTAA
TATTAAGTTAAATATAan>TAATTATCAAGGCCCCGGGCCGGTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTT
CCTCCTTATTCTATTTATATATTTAATATAATTATTTATATTTAAAATTTACTTAATTAT
TTTAATTATATAan>TAan>TACATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAATTTTTATAAATTAATAAAAATCCTT
CCTCACTATCTAGGGAAACCCCCTGGCTTGGGGATAAATTCTTCCTCACGCCCTGGGGCA
CCCTTGGCTTGGGGAAAAAATAAATTTCTTCTTCAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATA
AAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAATTAAATTAAAATTAATCCAATTA
TTTATCATTATTATTTGAATTATTATTATTATTATTAAAATAAAAATATTAAATAATTAT
TATTATTATTAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAATAATTATTTATAT