S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

YNCQ0005W

Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -950 -940 -920 -875 -873 -871 -830 -828 -822 -813 -794 -745 -668 -666 -664 -646 -637 -606 -593 -583 -556 -551 -549 -539 -537 -383 -367 -353 -279 -150 -122 -120 -118 -116 -114 -109

>YNCQ0005W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TTTATATTATTAATAATAATAATTTATAAATATTGTTATAATAAACATTTATATAAATAA
ATATAAATTACCATAATAAGATATATTATTTATTAATAATAAAAATATTTATTAATAAAT
AAGAAATATAan>TAan>TATTATGATAATATTTATTAATAAATAATAAATTCTTTATATAan>TAAAT
ATATTAAATATATTTAATTGAACACAATATAATTTTTATTGTATTATTCATTTAATAATA
TTAATATTAATATTAATATAATATTAGTGAACATCTCCTTTCGGGGTTCCGGCTCCCGTG
GCCGGGCCCCGGAACTATTAATATTTAATAAAATATAan>TAan>TAATTTATAATTTTCATATAA
TTAATATAATAATTAGGTTTATAAATAAATTATAATATATTATAACAATATAATAAAATA
TATTATAAATCTATCTATCTATCTATATAATATAan>TAAATTTATATAan>TACATTAATAATAT
TTAATTATAATTATTTAAATATTTAATTTATTAATATTCCCCGCGGGCGCCAATCCGGTT
GTTCACCGGATTGGTCCCGCGGGGTTTATATTATTTAAATATTAAATATTAAATAATAAT
TTATATTATATTAATAAATATAATAAATTAAAAATATATGATTAATTATATAATAATAAT
AATAATTATTTTAATATTATAATTTATAAAATTAATTATATTAATTATATTAATTCTTAT
TATATAATAATTATTAATAATAATTTATTTTAAGAAAGGAGTGAGGGACCCCCTCCCGTT
AGGGAGGGGGACCGAACCCCGAAGGAGAAAATAAATTAATAAAAGTTTAAAAGTTCTTAT
ATTAATAATTATATAATATTATATTAAAGATTTTTATAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAATATATTTA
TAGTTCCGGGGCCCGGCCACGGGAGCCGGAACCCCGAAAGGAGTTTATTTAATATTTATA
TTTATATTAATATTTATATTTATATTTATATTCCTCTTAA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -9 -15 -21 -33 -39 -103 -110 -112 -114 -116 -136 -146 -158 -275 -290 -299 -349 -361 -389 -394 -429 -533 -535 -545 -552 -577 -600 -660 -662 -807 -816 -824 -826 -865 -867 -869 -914 -946 -993

>YNCQ0005W	Upstream Sequence Complementary Strand
AAATATAATAATTATTATTATTAAATATTTATAACAATATTATTTGTAAATATATTTATT
TATATTTAATGGTATTATTCTATATAATAAATAATTATTATTTTTATAAATAATTATTTA
TTCTTTATATAan>TAan>TAATACTATTATAAATAATTATTTATTATTTAAGAAATATAan>TATTTA
TATAATTTATATAAATTAACTTGTGTTATATTAAAAATAACATAATAAGTAAATTATTAT
AATTATAATTATAATTATATTATAATCACTTGTAGAGGAAAGCCCCAAGGCCGAGGGCAC
CGGCCCGGGGCCTTGATAATTATAAATTATTTTATATAan>TATTAAATATTAAAAGTATATT
AATTATATTATTAATCCAAATATTTATTTAATATTATATAATATTGTTATATTATTTTAT
ATAATATTTAGATAGATAGATAGATATATTATATATTTAAATATAan>TATGTAATTATTATA
AATTAATATTAATAAATTTATAAATTAAATAATTATAAGGGGCGCCCGCGGTTAGGCCAA
CAAGTGGCCTAACCAGGGCGCCCCAAATATAATAAATTTATAATTTATAATTTATTATTA
AATATAATATAATTATTTATATTATTTAATTTTTATATACTAATTAATATATTATTATTA
TTATTAATAAAATTATAATATTAAATATTTTAATTAATATAATTAATATAATTAAGAATA
ATATATTATTAATAATTATTATTAAATAAAATTCTTTCCTCACTCCCTGGGGGAGGGCAA
TCCCTCCCCCTGGCTTGGGGCTTCCTCTTTTATTTAATTATTTTCAAATTTTCAAGAATA
TAATTATTAATATATTATAATATAATTTCTAAAAATATTATATAan>TAan>TAan>TATTATATAAAT
ATCAAGGCCCCGGGCCGGTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTTCCTCAAATAAATTATAAATAT
AAATATAATTATAAATATAAATATAAATATAAGGAGAATT