S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

YNCQ0012W

Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -880 -878 -876 -871 -869 -867 -862 -860 -858 -771 -769 -767 -756 -754 -748 -746 -707 -697 -640 -638 -636 -634 -632 -630 -623 -621 -619 -588 -576 -574 -480 -478 -458 -440 -435 -433 -431 -429 -427 -418 -284 -123 -121 -119 -94 -88 -86 -84 -82 -80 -78 -76 -74 -23 -21

>YNCQ0012W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TATATTATTTTTTTTAATAACTATCTAATTAATAGCTATTTTGGTGGAATTGGTAGACAC
GATACTCTTAAGATGTATTACTTTACAGTATGAAGGTTCAAGTCCTTTAAATAGCAATAA
ATATAan>TAan>TAATATAan>TAan>TAATATAan>TAan>TAAATGAGTCGTAGACTAATAGGTAAGTTACCAAA
ATTTGAGTTTGGAGTTTGTTTGTTCGAATCAAACCGATTCAATATTATAATATAan>TAan>TATT
ATTTATATAan>TAAATATAan>TAATTATACTCCTATTTTTATATTAATTAATTAATAATATATG
ATAATATAAAAATTATTGAATTATTAACTCTTATTAATAATAATAATAATCATAATAATA
ATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAGTATATAan>TAan>TAAAAGTTTTATTATATTATATTATATTATATATTT
ATTTATATAan>TAATTCTTATTAATTGAAAAAAGAATAATTAATAATCTTATTAAAAAAATA
AATACTTTCATTTTATTTTATTTTATTTAATTTAATTATAATATAan>TAAATATTAAAAAAA
GGATATAAGTTTTTTATAAGATATAATATAan>TAan>TAan>TAan>TATTAAATATAAAGAAGTTAATAT
TTATATTTTAATTATAAAATGTTAATACTCCTTTGGGGACTTATTAATTAAATTATTAAT
TAATAATAATTTATGATTTATAAATAATAAATAAAGGAATAAGTATCAATTAATTAATAT
ATTATATTTAATATTTTATATTTAATATTTAATATTTAATATTTTAAGTTCCGGGGCCCG
GCCACGGGAGCCGGAACCCCGAAAGGAGTAGTATTAATTATGGATAGTGAGGGTGGATTT
AATCCTTTTGTTATGTTATTAATTAATTAATTAATTTATATAan>TAan>TAAAATATTTTAATTA
ATTTTTATATAAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TATTAATAATAGTCCGGCCCGCCCCGTGGGG
CGGACCCCAAAGGAGTAATATAan>TATTATGTATAAACAATA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -15 -17 -68 -70 -72 -74 -76 -78 -80 -82 -90 -115 -117 -119 -259 -273 -278 -394 -421 -423 -425 -427 -429 -474 -570 -572 -582 -584 -589 -594 -599 -615 -617 -619 -626 -628 -630 -632 -634 -701 -720 -742 -750 -752 -761 -763 -765 -854 -856 -863 -865 -872 -874 -995

>YNCQ0012W	Upstream Sequence Complementary Strand
ATATAATAAAAAAAATTATTGATAGATTAATTATCGATAAAACCACCTTAACCATCTGTG
CTATGAGAATTCTACATAATGAAATGTCATACTTCCAAGTTCAGGAAATTTATCGTTATT
TATATAan>TATTATATAan>TATTATATAan>TATTTACTCAGCATCTGATTATCCATTCAATGGTTT
TAAACTCAAACCTCAAACAAACAAGCTTAGTTTGGCTAAGTTATAATATTATATAan>TAan>TAA
TAAATATAan>TATTTATATATTAATATGAGGATAAAAATATAATTAATTAATTATTATATAC
TATTATATTTTTAATAACTTAATAATTGAGAATAATTATTATTATTATTAGTATTATTAT
TATATAan>TAan>TAan>TAan>TATCATATAan>TAan>TATTTTCAAAATAATATAATATAATATAATATAan>TAAA
TAAATATAan>TATTAAGAATAATTAACTTTTTTCTTATTAATTATTAGAATAATTTTTTTAT
TTATGAAAGTAAAATAAAATAAAATAAATTAAATTAATATTATATATTTATAATTTTTTT
CCTATATTCAAAAAATATTCTATATTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAATTTATATTTCTTCAATTATA
AATATAAAATTAATATTTTACAATTATGAGGAAACCCCTGAATAATTAATTTAATAATTA
ATTATTATTAAATACTAAATATTTATTATTTATTTCCTTATTCATAGTTAATTAATTATA
TAATATAAATTATAAAATATAAATTATAAATTATAAATTATAAAATTCAAGGCCCCGGGC
CGGTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTTCCTCATCATAATTAATACCTATCACTCCCACCTAAA
TTAGGAAAACAATACAATAATTAATTAATTAATTAAATATAan>TAan>TATTTTATAAAATTAAT
TAAAAATATATTTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAATTATTATCAGGCCGGGCGGGGCACCCC
GCCTGGGGTTTCCTCATTATATAan>TAATACATATTTGTTAT