S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

YNCQ0014W

Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -995 -983 -981 -887 -885 -865 -847 -842 -840 -838 -836 -834 -825 -691 -530 -528 -526 -501 -495 -493 -491 -489 -487 -485 -483 -481 -430 -428 -328 -326 -324 -322 -290 -288 -277 -269 -267 -265 -263 -261 -195

>YNCQ0014W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ATATTATATATTTATTTATATAan>TAATTCTTATTAATTGAAAAAAGAATAATTAATAATCT
TATTAAAAAAATAAATACTTTCATTTTATTTTATTTTATTTAATTTAATTATAATATAan>TA
AATATTAAAAAAAGGATATAAGTTTTTTATAAGATATAATATAan>TAan>TAan>TAan>TATTAAATATA
AAGAAGTTAATATTTATATTTTAATTATAAAATGTTAATACTCCTTTGGGGACTTATTAA
TTAAATTATTAATTAATAATAATTTATGATTTATAAATAATAAATAAAGGAATAAGTATC
AATTAATTAATATATTATATTTAATATTTTATATTTAATATTTAATATTTAATATTTTAA
GTTCCGGGGCCCGGCCACGGGAGCCGGAACCCCGAAAGGAGTAGTATTAATTATGGATAG
TGAGGGTGGATTTAATCCTTTTGTTATGTTATTAATTAATTAATTAATTTATATAan>TAan>TAA
AATATTTTAATTAATTTTTATATAAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TATTAATAATAGTCCGGC
CCGCCCCGTGGGGCGGACCCCAAAGGAGTAATATAan>TATTATGTATAAACAATAGAGAATA
TTGTTTAATGGTAAAACAGTTGTCTTTTAAGCAACCCATGCTTGGTTCAACTCCAGCTAT
TCTCATAATATTATATAan>TAan>TAan>TATTTCCCTTTCTAAAAATAATAATAATTATATAan>TAATA
ATAATATAATTATATAan>TAan>TAan>TAan>TATTATAATAATAATAATAATAATAATAATAAATAATA
ATAATTATTTTTATTAATAATATTAATATATTATAATTATTAATAAATATTAATAAAAAT
AGCTCTCTTAGCTTAATGGTTAAAGCATAATACTTCTAATATTAATATTCCATGTTCAAA
TCATGGAGAGAGTAATTATATTATATTAATAATCCCCCCCCCATTTTTAATTAAATTAAG
AAGTTTAATTTACTATTTAATAATAAATGAAATAATAATA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -74 -79 -189 -255 -257 -259 -261 -263 -265 -284 -286 -316 -318 -320 -322 -324 -422 -424 -475 -477 -479 -481 -483 -485 -487 -489 -497 -522 -524 -526 -666 -680 -685 -801 -828 -830 -832 -834 -836 -881 -977 -979 -989 -991

>YNCQ0014W	Upstream Sequence Complementary Strand
TATAATATAan>TAAATAAATATAan>TATTAAGAATAATTAACTTTTTTCTTATTAATTATTAGA
ATAATTTTTTTATTTATGAAAGTAAAATAAAATAAAATAAATTAAATTAATATTATATAT
TTATAATTTTTTTCCTATATTCAAAAAATATTCTATATTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAATTTATAT
TTCTTCAATTATAAATATAAAATTAATATTTTACAATTATGAGGAAACCCCTGAATAATT
AATTTAATAATTAATTATTATTAAATACTAAATATTTATTATTTATTTCCTTATTCATAG
TTAATTAATTATATAATATAAATTATAAAATATAAATTATAAATTATAAATTATAAAATT
CAAGGCCCCGGGCCGGTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTTCCTCATCATAATTAATACCTATC
ACTCCCACCTAAATTAGGAAAACAATACAATAATTAATTAATTAATTAAATATAan>TAan>TATT
TTATAAAATTAATTAAAAATATATTTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAATTATTATCAGGCCG
GGCGGGGCACCCCGCCTGGGGTTTCCTCATTATATAan>TAATACATATTTGTTATCTCTTAT
AACAAATTACCATTTTGTCAACAGAAAATTCGTTGGGTACGAACCAAGTTGAGGTCGATA
AGAGTATTATAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAAAGGGAAAGATTTTTATTATTATTAATATAan>TATTAT
TATTATATTAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAATATTATTATTATTATTATTATTATTATTTATTAT
TATTAATAAAAATAATTATTATAATTATATAATATTAATAATTATTTATAATTATTTTTA
TCGAGAGAATCGAATTACCAATTTCGTATTATGAAGATTATAATTATAAGGTACAAGTTT
AGTACCTCTCTCATTAATATAATATAATTATTAGGGGGGGGGTAAAAATTAATTTAATTC
TTCAAATTAAATGATAAATTATTATTTACTTTATTATTAT