S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

YNCQ0023W

Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -985 -975 -965 -854 -765 -712 -707 -702 -691 -686 -681 -670 -534 -528 -523 -424 -380 -378 -373 -330 -323 -293 -275 -266 -260 -258 -256 -254 -252 -241 -239 -237 -231 -225 -219 -191 -189 -181 -163 -161 -159 -157 -155 -119 -111 -109 -102 -84 -82 -80 -78 -76 -74 -57 -51 -49 -47 -45 -43 -7 -5

>YNCQ0023W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TATAAAATTATATTTATATATTATAATATAATTAAATATATTATAAATTTAATAATTTAA
TAAAAATATTCTTTTTATAATTATTATAATAATTAAATAAATAATAATAATAAGAATAAT
TAATGTATAATTTTTTTATAAATATTATATATTTTTATATTAATAGTTCCGGGGCCCGGC
CACGGGAGCCGGAACCCCGAAAGGAGAAATATTAATAAAATAAAATAAAATTATAATATA
ATTAAATTATAAGAATTATATTTACTCCTTTTATAATTTATATTTATAATATAATATAAT
ATAAAATAAATATAATATAATATAAAATAAATATAATGTAATAGGTATTCACTCCTCTTT
GGGGTTCCGATCCCCCATACGGATACGGATACGGATACGAATACGGATACGGATACGGAT
ACGGGGGGCCGTCCCCCAGAACTTAATATTATATCTTAAATAATTAATATAAATATAATA
TATTATTTAATAATAATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATTAAATAAATAAT
AATATTATTATAATTACTTTTTAATAAATAATATTAATATAATATTATATTAGTATTATA
AATAGACTTTTTATTATTTTATATAan>TAATATAGTCCGGCCCGCCCCCGCGGGGCGGACCC
CGAAGGAGTAATATATTATATAATTATTATTTTTAATTATAAATAAAATATAATTATTAT
TTATTATATAATTTATATAAATATAan>TAan>TAan>TAan>TATTTATTATATAan>TAan>TAAATATAAATATA
AATATAATAATTAATAATATTAAAGTTTTATATAan>TATTAATATATTATAAAAGGTTTATA
TATAan>TAan>TAan>TAATAAGATAAGTAATAAATTAATTAATTAATAATATAAAAATATAan>TATTAT
ATATTATGTTTTATTTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TATTATGTATTATTATATAAATATAan>TAan>TAan>TA
>TATTATATTATAAGTAATAATAAGTATTATATTATATAan>TA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -1 -3 -8 -32 -37 -39 -41 -43 -45 -53 -68 -70 -72 -74 -76 -78 -80 -96 -98 -103 -105 -151 -153 -155 -157 -159 -175 -183 -185 -187 -233 -235 -237 -246 -248 -250 -252 -254 -262 -271 -319 -324 -374 -376 -410 -517 -546 -717 -739 -840 -848 -850 -959 -979 -981 -987

>YNCQ0023W	Upstream Sequence Complementary Strand
ATATTTTAATATAAATATAan>TAATATTATATTAATTTATATAATATTTAAATTATTAAATT
ATTTTTATAAGAAAAATATTAATAATATTATTAATTTATTTATTATTATTATTCTTATTA
ATTACATATTAAAAAAATATTTATAATATAan>TAAAAATATAATTATCAAGGCCCCGGGCCG
GTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTTCCTCTTTATAATTATTTTATTTTATTTTAATATTATAT
TAATTTAATATTCTTAATATAAATGAGGAAAATATTAAATATAAATATTATATTATATTA
TATTTTATTTATATTATATTATATTTTATTTATATTACATTATCCATAAGTGAGGAGAAA
CCCCAAGGCTAGGGGGTATGCCTATGCCTATGCCTATGCTTATGCCTATGCCTATGCCTA
TGCCCCCCGGCAGGGGGTCTTGAATTATAATATAGAATTTATTAATTATATTTATATTAT
ATAATAAATTATTATTATTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAATTTATTTATTA
TTATAATAATATTAATGAAAAATTATTTATTATAATTATATTATAATATAATCATAATAT
TTATCTGAAAAATAATAAAATATAan>TATTATATCAGGCCGGGCGGGGGCGCCCCGCCTGGG
GCTTCCTCATTATATAATATATTAATAATAAAAATTAATATTTATTTTATATTAATAATA
AATAATATATTAAATATATTTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAAATAATATAan>TAan>TATTTATATTTATAT
TTATATTATTAATTATTATAATTTCAAAATATAan>TAan>TAATTATATAATATTTTCCAAATAT
ATAan>TAan>TAan>TATTATTCTATTCATTATTTAATTAATTAATTATTATATTTTTATATAan>TAATA
TATAATACAAAATAAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAATACATAATAATATATTTATATAan>TAan>TAan>T
ATAATATAATATTCATTATTATTCATAATATAATATAan>TAT