S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

YNCQ0011W

Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -999 -995 -991 -987 -983 -962 -947 -938 -935 -916 -907 -904 -893 -878 -867 -842 -837 -817 -812 -804 -784 -778 -761 -752 -743 -740 -737 -734 -731 -725 -708 -704 -698 -680 -668 -652 -649 -635 -616 -607 -604 -601 -597 -589 -583 -571 -555 -552 -549 -536 -531 -528 -525 -465 -460 -457 -450 -446 -443 -394 -391 -388 -368 -365 -352 -347 -341 -331 -256 -250 -247 -241 -238 -235 -232 -229 -226 -222 -217 -212 -207 -203 -197 -190 -187 -184 -181 -177 -170 -166 -157 -148 -145 -136 -121 -23 -14

>YNCQ0011W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TTTATTTn>ATTTn>ATTTn>ATTTn>ATTTATTCAATATATAAAAATAATTATAAAAAGATTATTAA
AAATAATAan>ATTTAATGATAAATATATATTATATATATTAan>ATATAAAAATAATAAATATAA
ATATATTATGTAAATATTATATAAATTTGTATATGTATATATTA>TAATAATGTTATATAA
GTAATAATA>TAATAAAATATTTTATGTAATTTATATATATTTATAATTATAAAATAAAAA
TATTATAAATAATAAAATTAATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATTTTAATAAAATAAATTATATATTTn>AA
TTTTATTATGAAGTTTATACTTAATATAAATTATATTTCCTTTATAAATTATTAan>ATATAT
CCTTTTTAATTAAATAAAATAAAAATATTATAAATATTAan>ATAan>ATTn>AATTTTTTATTTATA
TTTATATATATATTAAAGATTAAATATATTAan>TTAan>ATACTAATTTATAATT>TATTAan>TTAan>AT
AAATAGTCCGGCCCGCCCCCTGCGGGGCGGACCCCGAAGGAGTTCGACTTAAATTATAAT
T>TAATAan>ATTTTTATTTn>ATTAan>ATAGTTTCGGGGCCCGGCCACGGGAGTCGGAACCCCGAAA
GGAGTTTTATTAan>TTAan>ATATAAAAAGAGTAAGGATAATAan>ATAAATTCTTTTAATT>TATTTT
TAATAAAATATAATTTTAAAATAGTTTTTATAGTCCGGCCCGCCCCGCGGGGGGGGGCGG
ACCCCGAAGGAGTTCGGTCTGGCATTAATTATAATAan>ATTATATTAan>ATAan>TTAan>TTAan>TTAan>TTT
ATTA>TATTA>TAATA>TATTTn>ATTTATATTTTATAATAan>TTAan>ATAan>ATTn>ATTTTATATTTn>AATA
AATATAATATATATATTAan>TTTTTTTTAATAACTATCTAATTAATAGCTATTTTGGTGGAA
TTGGTAGACACGATACTCTTAAGATGTATTACTTTACAGTATGAAGGTTCAAGTCCTTTA
AATAGCAATAAATATATATAATATATATAATATATATAAA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -7 -16 -25 -117 -129 -141 -150 -155 -159 -173 -177 -180 -183 -205 -210 -215 -222 -225 -228 -231 -234 -239 -243 -248 -329 -334 -358 -361 -381 -384 -387 -439 -453 -463 -518 -521 -524 -545 -548 -553 -564 -593 -597 -600 -603 -609 -612 -618 -623 -627 -642 -645 -648 -666 -673 -691 -708 -713 -718 -727 -730 -733 -736 -739 -745 -748 -754 -757 -763 -770 -800 -805 -810 -813 -830 -835 -860 -863 -871 -876 -882 -886 -889 -897 -900 -909 -916 -931 -934 -940 -954 -958

>YNCQ0011W	Upstream Sequence Complementary Strand
AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAGTTATATATTTTTATTn>AATATTTTTCTAATAATT
TTTATTan>ATTAAATTACTATTTATATATAATATATATAATTan>ATATTTTTATTan>ATTn>TATATT
TATA>TAATACATTTATAan>ATATATTTAAACATATACATATATAATA>TTATTACAATATATT
CATTATTan>ATA>TTATT>TTATAAAATACATTAAATATATATAAATATTAATATTTTATTTTT
ATAan>ATATTTATTan>ATTTTAATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTAAAATTATT>TTATT>TAATATATAAATT
AAAATAATACTTCAAATATGAATTATATTTAATATAAAGGAAATATTTAATAan>ATTan>ATATA
GGAAAAATTAATTn>TATT>TTATTTTTATAan>ATATTTATAan>ATTan>ATTn>AATTAAAAAATAAATAT
AAATATATATATAATTTCTAATTTATA>TAATAan>ATTATGATTAAATATTAAATAATAan>ATTan>A
TTTATCAGGCCGGGCGGGGGACGCCCCGCCTGGGGCTTCCTCAAGCTGAATTTAATATTA
AATTATTAAAAATAAATAATTATCAAAGCCCCGGGCCGGTGCCCTCAGCCTTGGGGCTTT
CCTCAAAATAATAan>ATTan>ATATTTTTCTCATTCCTATTATTan>ATTTAAGAAAATTAAATAAAA
ATTATT>TTATATTAAAATTTTATCAAAAATATCAGGCCGGGCGGGGCGCCCCCCCCCGCC
TGGGGCTTCCTCAAGCCAGACCGTAATTAATA>TTATTn>AATA>TAATTan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAAA
TAATA>TAATA>TTATATAAATAAATATAAAATATTATAan>ATTan>ATTn>AATAAAATATAAATTAT
TTATA>TTATATATATAATAAAAAAAATTATTGATAGATTAATTATCGATAAAACCACCTT
AACCATCTGTGCTATGAGAATTCTACATAATGAAATGTCATACTTCCAAGTTCAGGAAAT
TTATCGTTATTTATATATATTATATATATTATATATATTT