S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

YNCQ0023W

Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -991 -983 -978 -973 -963 -952 -949 -944 -924 -920 -915 -912 -900 -897 -894 -885 -874 -859 -852 -844 -841 -792 -789 -768 -763 -743 -728 -721 -715 -710 -705 -689 -684 -558 -555 -541 -537 -526 -521 -518 -514 -511 -508 -505 -465 -462 -459 -456 -451 -440 -433 -430 -427 -422 -419 -414 -390 -387 -376 -328 -321 -317 -314 -308 -291 -287 -284 -280 -273 -250 -246 -217 -214 -210 -207 -204 -187 -184 -179 -153 -133 -129 -125 -122 -107 -100 -90 -72 -62 -41 -36 -24 -12

>YNCQ0023W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TATAAAATTATATTTATATATTA>TAATA>TAATTAAATATATTATAAATTTAATAan>ATT>TAA
TAAAAATATTCTTTTTATAATTn>ATTA>TAATAan>ATTAAATAAATAATAan>ATAan>ATAAGAATAAT
TAATGTATAATTTTTTTATAAATATTATATATTTTTATATTAan>ATAGTTCCGGGGCCCGGC
CACGGGAGCCGGAACCCCGAAAGGAGAAATATTAan>ATAAAATAAAATAAAATTATAATA>TA
ATTAAATTATAAGAATTATATTTACTCCTTTTATAATTTATATTTATAATA>TAATA>TAAT
ATAAAATAAATATAATA>TAATATAAAATAAATATAATGTAATAGGTATTCACTCCTCTTT
GGGGTTCCGATCCCCCATACGGATACGGATACGGATACGAATACGGATACGGATACGGAT
ACGGGGGGCCGTCCCCCAGAACTTAATAan>TTATATCTTAAATAATTn>AATATAAATATAATA
</span>TATTAan>TTTn>AATAan>ATAan>ATAan>ATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATTAAATAAATAAT
AATAan>TTAan>TTA>TAATTACTTTTTAATAAATAATAan>TTAan>ATA>TAATAan>TTA>TATTAGTATTATA
AATAGACTTTTTATTAan>TTTTATATATAATATAGTCCGGCCCGCCCCCGCGGGGCGGACCC
CGAAGGAGTAATATATTATATAATTn>ATTAan>TTTTTAATTATAAATAAAATATAATTn>ATTAan>T
TTn>ATTATATAATTTATATAAATATATATATATATTTn>ATTATATATATAAATATAAATATA
AATATAATAan>ATTn>AATAan>ATAan>TTAAAGTTTTATATATATTAan>ATA>TATTATAAAAGGTTTATA
TATATATATAATAAGATAAGTAATAAATTAATTn>AATTn>AATAan>ATATAAAAATATATATTAT
ATATTATGTTTTATTTATATATATATATATATTATGTATTATTATATAAATATATATATA
TATTA>TATTATAAGTAATAATAAGTATTATATTATATATA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -5 -10 -17 -20 -29 -34 -47 -55 -58 -65 -93 -100 -107 -115 -118 -121 -125 -129 -134 -146 -172 -177 -180 -197 -200 -203 -206 -210 -215 -221 -227 -239 -256 -273 -280 -283 -289 -294 -300 -310 -313 -321 -326 -369 -383 -401 -412 -415 -420 -423 -426 -429 -433 -449 -452 -455 -458 -461 -465 -469 -474 -478 -482 -486 -490 -494 -498 -501 -504 -507 -514 -519 -524 -530 -533 -537 -548 -551 -666 -670 -677 -682 -687 -691 -698 -703 -708 -741 -750 -755 -761 -766 -772 -777 -782 -785 -788 -837 -852 -855 -877 -887 -890 -893 -896 -900 -904 -908 -913 -916 -931 -937 -945 -956 -961 -965 -971 -976 -989

>YNCQ0023W	Upstream Sequence Complementary Strand
ATATTTTAATATAAATATATAATA>TTATATTAATTn>TATA>TAATATTTAAATTATTAAATT
ATTTTTATAAGAAAAATATTAATAan>ATA>TTATTn>AATTn>TATTn>TATTan>ATTan>ATTan>ATTCTTATTA
ATTACATATTAAAAAAATATTTATAan>ATATATAAAAATATAATTATCAAGGCCCCGGGCCG
GTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTTCCTCTTTATAan>ATTan>ATT>TTATT>TTATTTTAATA>TTATAT
TAATT>TAATATTCTTAATATAAATGAGGAAAATATTAAATATAAATATTATA>TTATA>TTA
TATTTTATTn>TATA>TTATA>TTATATTTTATTn>TATATTACATTATCCATAAGTGAGGAGAAA
CCCCAAGGCTAGGGGGTATGCCTATGCCTATGCCTATGCTTATGCCTATGCCTATGCCTA
TGCCCCCCGGCAGGGGGTCTTGAATTATAan>ATATAGAATTTATTn>AATTan>ATATTTATA>TTAT
A>TAATAAATTATTan>ATTan>ATTan>ATTn>TATTn>TATTn>TATTn>TATTn>TATTn>TATT>TAATTn>TATTn>TATTan>A
TTATAan>ATAan>ATATTAATGAAAAATTATTn>TATTan>ATAan>ATTan>ATA>TTATAan>ATATAATCATAATAT
TTATCTGAAAAATAATAAAATATATATTATATCAGGCCGGGCGGGGGCGCCCCGCCTGGG
GCTTCCTCATTATA>TAATATATTAATAan>ATAAAAATTAATATTTATT>TTATATTAATAan>ATA
AATAATATATTAAATATATTTATATATATATATAAATAATATATATATTTATATTTATAT
TTATA>TTATTn>AATTan>ATTan>ATAan>ATTTCAAAATATATATAATTan>ATA>TAATATTTTCCAAATAT
ATATATATATTATTCTATTCATTATT>TAATTn>AATTn>AATTan>ATTan>ATATTTTTATATATAATA
TATAATACAAAATAAATATATATATATATATAATACATAATAan>ATATATTTATATATATAT
ATAATA>TAATATTCATTATTan>ATTCATAATA>TAATATATAT