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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name SPG3
Promoter Sequence

Consensus
YTGAT: -815 -657 -344 -285 -215
>SPG3    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TAATGGAGGCAATAAAAATAGGAGGAAGGGCTCTTTCACAACAGAACTATCATGCAGGAA
TGCTAATAACTCCTTTTTACCTTATACACCATTGGTACTGGTTGCTTTGAAAAATGGGAA
ACTTGAACTACTATCTACTCCACAAGCTACCAATTTGTTGTTAAAGAGAGGTGACTTGGT
TATTATTGATGGTGACCGTGGAAGGGATTTAGTATTGGTTGTTGAGCCCTCTGTCGATTT
GAATTTAGCATTATTTATAAATTTTCTGAAAAAGAAAATTCACTTTGACTCTTTAATTAC
AAGTGAGTCACAGCACTATCGCAATGATGAGTTTATTCAAATGTTGATTGACTCAAAAAA
TGGGCAAAAGAAAAAATTAAATCCCAAATTGTATGATGTTGTTGAATTAACTGAGTTAAT
CATACCATCTAAACAAGTCTTACGTTTTGCCACCCCGTGGGAGGTAACAACGAATTTGCA
CAATAAATTTGAAGATGAATTAAAAGCCTTGCATATTGCTCAGAGTAAATTACAAGCGTT
AAATGATAATTCAAAATCTCAAAATACAAATGACAGTTCTTCCAATAATTTTACGAATGC
TGCAACTTATTCAAAGCCTAAATTGAATATCAAGATTTTAAACGCAGAATTCCAATTTGA
T
AGAAAGAAATTAACGTTTTACTACGTTTGTGAGGAGAGAAATGATTTTAGAGACTTGAT
AAAAGAGCTGTTCAAATATTACAAGACAAGAATTTGGTTGTGTGCCATCCCGAATAATCT
GTCTATTGATTCTAAGTATTATGATAAACAACAAAAAGAGCTGAAATTATATCAAAACAT
AGTAAAAAATTACAATGCTGAAGATTTAATGAATGTCAATGAGTTTTCGCAGAACAGGGG
GAATAACAGAGTTAATTTTGCACCTCCGTTGAACGAAATTGAACTCGACAACTTTCAGAT
TGCTGTGTATGAAGAATTAGTTCACGAATTATTTCATTAA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
YTGAT: -165 -367
>SPG3	Upstream Sequence Complementary Strand
ATTACCTCCGTTATTTTTATCCTCCTTCCCGAGAAAGTGTTGTCTTGATAGTACGTCCTT
ACGATTATTGAGGAAAAATGGAATATGTGGTAACCATGACCAACGAAACTTTTTACCCTT
TGAACTTGATGATAGATGAGGTGTTCGATGGTTAAACAACAATTTCTCTCCACTGAACCA
ATAATAACTACCACTGGCACCTTCCCTAAATCATAACCAACAACTCGGGAGACAGCTAAA
CTTAAATCGTAATAAATATTTAAAAGACTTTTTCTTTTAAGTGAAACTGAGAAATTAATG
TTCACTCAGTGTCGTGATAGCGTTACTACTCAAATAAGTTTACAACTAACTGAGTTTTTT
ACCCGTTTTCTTTTTTAATTTAGGGTTTAACATACTACAACAACTTAATTGACTCAATTA
GTATGGTAGATTTGTTCAGAATGCAAAACGGTGGGGCACCCTCCATTGTTGCTTAAACGT
GTTATTTAAACTTCTACTTAATTTTCGGAACGTATAACGAGTCTCATTTAATGTTCGCAA
TTTACTATTAAGTTTTAGAGTTTTATGTTTACTGTCAAGAAGGTTATTAAAATGCTTACG
ACGTTGAATAAGTTTCGGATTTAACTTATAGTTCTAAAATTTGCGTCTTAAGGTTAAACT
ATCTTTCTTTAATTGCAAAATGATGCAAACACTCCTCTCTTTACTAAAATCTCTGAACTA
TTTTCTCGACAAGTTTATAATGTTCTGTTCTTAAACCAACACACGGTAGGGCTTATTAGA
CAGATAACTAAGATTCATAATACTATTTGTTGTTTTTCTCGACTTTAATATAGTTTTGTA
TCATTTTTTAATGTTACGACTTCTAAATTACTTACAGTTACTCAAAAGCGTCTTGTCCCC
CTTATTGTCTCAATTAAAACGTGGAGGCAACTTGCTTTAACTTGAGCTGTTGAAAGTCTA
ACGACACATACTTCTTAATCAAGTGCTTAATAAAGTAATT
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