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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name LOC1
Promoter Sequence

Consensus
CACGTK: -598 -405
>LOC1    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
GGCCTGTTTACGAAATGGCAAATGATATACCATTATTGTTATATGATTGTAAATTTCCTG
AAATGGATTGGCAAGAACCTACTGTAGATGACTATAAGGCAATAAAATTCACGACAGCTA
CTGAAGCATTGACGTTACACTACGAACTTAAGGCCGCAGTATGCAATATTTTTAAAGATG
TTTTGCCCACAGCAAATACAAACAACTTCTCAAAGACAATTATTAATTTGGGCGATGGAA
GAGGTAAAGTAGTCGGTACCTATGTGAAACTAGAGGATAGAAGCGTTATGGAACCTGTCG
AAGTTGTTAATGCTAAATACTCCAAGAAAAAGAACAACAAAAATAAGTAAAATAATATAT
AAACCTGTATAATATAACCTTGAAGACTATATTTCTTTTCATCACGTGCTATAAAAATAA
TTATAATTTAAATTTTTTAATATAAATATATAAATTAAAAATAGAAAGTAAAAAAAGAAA
TTAAAGAAAAAATAGTTTTTGTTTTCCGAAGATGTAAAATAGGTTGAAAGTTAGAAATTA
GTATTATAATAGCAAAAAAAATTTAAAGTTAGAAATTAGAATTTAAGGCTCTACACACGT
T
TACGATGATATTGGACGACCGACACGAAAAGACAGTTTTAGGCTTTCTTTTGTCTTGCT
CTTGCGTTGAAAGTACGTAATTTCCATTCGATTACTTACTCAACACTTGATATAGAGACC
AACTATAAAATAAACTGTTTGGGAAGGAAAGCAGAACTCTTGTAATTACCTCATCTCATT
ATCAAGAAGCAAAATTTTAACTATGTATTTTGACCTTATTTTTGTACTCCACTTTTTTTT
TTTAGTTTTTTTTAGTTATTTTTTAATTTTGAAGTAACGGCGATGAGGTGAAGTTTTTTT
TAAACTGAAAAAGAAGATCGAATGCAAACCATAAATTAGAGATCTAATTGAGGTAAAATT
ATAAGGTTAGATATCTGTAAATCTATACAATTAAGGAAAG
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
CACGTK: -592
>LOC1	Upstream Sequence Complementary Strand
CCGGACAAATGCTTTACCGTTTACTATATGGTAATAACAATATACTAACATTTAAAGGAC
TTTACCTAACCGTTCTTGGATGACATCTACTGATATTCCGTTATTTTAAGTGCTGTCGAT
GACTTCGTAACTGCAATGTGATGCTTGAATTCCGGCGTCATACGTTATAAAAATTTCTAC
AAAACGGGTGTCGTTTATGTTTGTTGAAGAGTTTCTGTTAATAATTAAACCCGCTACCTT
CTCCATTTCATCAGCCATGGATACACTTTGATCTCCTATCTTCGCAATACCTTGGACAGC
TTCAACAATTACGATTTATGAGGTTCTTTTTCTTGTTGTTTTTATTCATTTTATTATATA
TTTGGACATATTATATTGGAACTTCTGATATAAAGAAAAGTAGTGCACGATATTTTTATT
AATATTAAATTTAAAAAATTATATTTATATATTTAATTTTTATCTTTCATTTTTTTCTTT
AATTTCTTTTTTATCAAAAACAAAAGGCTTCTACATTTTATCCAACTTTCAATCTTTAAT
CATAATATTATCGTTTTTTTTAAATTTCAATCTTTAATCTTAAATTCCGAGATGTGTGCA
AATGCTACTATAACCTGCTGGCTGTGCTTTTCTGTCAAAATCCGAAAGAAAACAGAACGA
GAACGCAACTTTCATGCATTAAAGGTAAGCTAATGAATGAGTTGTGAACTATATCTCTGG
TTGATATTTTATTTGACAAACCCTTCCTTTCGTCTTGAGAACATTAATGGAGTAGAGTAA
TAGTTCTTCGTTTTAAAATTGATACATAAAACTGGAATAAAAACATGAGGTGAAAAAAAA
AAATCAAAAAAAATCAATAAAAAATTAAAACTTCATTGCCGCTACTCCACTTCAAAAAAA
ATTTGACTTTTTCTTCTAGCTTACGTTTGGTATTTAATCTCTAGATTAACTCCATTTTAA
TATTCCAATCTATAGACATTTAGATATGTTAATTCCTTTC
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