Yeastract
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Download     Tutorial     Help

 

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name RPS13
Promoter Sequence

No match found!
>RPS13    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TTTTTTCGCGGACAAAAGAAGAACATGTCAACGCCAACCCCCTAGGTGATTTTGTTAGAC
AAAAGCGAATTAGGATCAGGGTCTGTTAAACTTTAAATGGATTATCAATTCTTTTGTTCA
CTGATTTTGAATTTATCAGCTACCATTGATTTAAACCCATTATTTAGTTTTGCAATTGCG
TCCTCAAAGCATCGAGCAAACAATCATGTCGAACCTCTACAAAATTGGAACTGAAACTAG
AAATAAAATCAAGAAGTTTCGTACATCTACAGCAAGAACCGACTCCATAAAAGCTTTATC
AATAAAGATCGAACCAAAACCGTCCTATGAGATAATTGTCGATGAAGACGAACAAGAAGA
GCTAGACGAAATTGAAGATTTGAGCGAATTAGCCGAGATCCTACCTGATAACTCACCTAG
ATTTGTACTAACTGCATATCCAACAACAACAAAAGATGGGTTCAAACAGACTCCCTTAGT
TCTAGTATATTGGAAGCCAATGACGGTCGTTTCACAGGAATGGAAGATGCTTTATGCCGG
CGCATTAGAAATGATCAGAGAGGAGTGCGGTACTTTTAAATTGATAGAGGTTTCTTCAGG
TTTGGAGGATGACTCAGACGTTGAAGAATTGAGGGAGCAATTAGAAAATTGTTAGTATAG
TCTATCTTAAACACTAAACTACCTCCTATAATCATGTAGTGTACTTTAAACATTTTTTTA
TCTTCATAGCAATAATATAAGCCTTTTACCACCCATAAACCATAAAGTAGACCCAAACAT
TTTTAAAAAAATTTTACGTTATAATTTTTTCTTTGTCGTTTTTTCTGAGCGCGCAAAGTA
GCGGTGAAATTTTGATACGAATGAGATTTCCACTTCTGTACAGATGGAAATTTATGTTGG
CCGACATATATCACAGTCGTGATTGAATTAACAATTTCTTTCTCATTAATATTTATTCTA
AACGGTTAACCACTAAATCAATCAACAACAATCAGTCAAA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
RGGGG: -957 -958
>RPS13	Upstream Sequence Complementary Strand
AAAAAAGCGCCTGTTTTCTTCTTGTACAGTTGCGGTTGGGGGpan>ATCCACTAAAACAATCTG
TTTTCGCTTAATCCTAGTCCCAGACAATTTGAAATTTACCTAATAGTTAAGAAAACAAGT
GACTAAAACTTAAATAGTCGATGGTAACTAAATTTGGGTAATAAATCAAAACGTTAACGC
AGGAGTTTCGTAGCTCGTTTGTTAGTACAGCTTGGAGATGTTTTAACCTTGACTTTGATC
TTTATTTTAGTTCTTCAAAGCATGTAGATGTCGTTCTTGGCTGAGGTATTTTCGAAATAG
TTATTTCTAGCTTGGTTTTGGCAGGATACTCTATTAACAGCTACTTCTGCTTGTTCTTCT
CGATCTGCTTTAACTTCTAAACTCGCTTAATCGGCTCTAGGATGGACTATTGAGTGGATC
TAAACATGATTGACGTATAGGTTGTTGTTGTTTTCTACCCAAGTTTGTCTGAGGGAATCA
AGATCATATAACCTTCGGTTACTGCCAGCAAAGTGTCCTTACCTTCTACGAAATACGGCC
GCGTAATCTTTACTAGTCTCTCCTCACGCCATGAAAATTTAACTATCTCCAAAGAAGTCC
AAACCTCCTACTGAGTCTGCAACTTCTTAACTCCCTCGTTAATCTTTTAACAATCATATC
AGATAGAATTTGTGATTTGATGGAGGATATTAGTACATCACATGAAATTTGTAAAAAAAT
AGAAGTATCGTTATTATATTCGGAAAATGGTGGGTATTTGGTATTTCATCTGGGTTTGTA
AAAATTTTTTTAAAATGCAATATTAAAAAAGAAACAGCAAAAAAGACTCGCGCGTTTCAT
CGCCACTTTAAAACTATGCTTACTCTAAAGGTGAAGACATGTCTACCTTTAAATACAACC
GGCTGTATATAGTGTCAGCACTAACTTAATTGTTAAAGAAAGAGTAATTATAAATAAGAT
TTGCCAATTGGTGATTTAGTTAGTTGTTGTTAGTCAGTTT