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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name VAM6
Promoter Sequence

No match found!		 
>VAM6    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TATGAAGATATTCAGGCAAGTTTCAATAATATAGAATCTCCTAGAAAGAGAAATAATGAG
ATATGGGGATGTGATATCTATTCTGATGACTCAGACCCAATACTAGTTTTAAGACATTGC
GGGTTCAAAATTGGAGCGCCTTCTGGTGGCTCATTTCACAAATTGAGAAGAACCCCTGTA
AATGTAACTAATCAAGATAATGTTACAGGTAACCTTCCCCTACTGGAAGGCACACCTTTT
GATCTAGAGGTGGAGTTGTTGTTTTTGCCTACTCTACAAAAGTATCCTAGCGTAAAAAGA
TTTGATATAACATCGCGGGAATGGGGATCGGAAGCCACCGTTATACACGATGGACTGAGT
TACGGTATCTATAGTATTGTCATTAAGCAAAGACTAGATAGAGATAAACCTCATGAACCA
AACGGGTATATTAAAAATTTAAAATGGACCTAAGGAAAGACATAATATTGGTCGTCCTTC
TTTCCCTTCCAACCTTAGTTGGCGCCATGTGTGTATTTAATTTAATTCAAAATATCATTC
TGCTGCGCTACTTCTGTATTATTGCTTTGAGGAATATACGATGCGTTGTACTATATAACA
AAAGCTTCACTTTATAAGTTTCTATAACTGGATAGTTTGGTTGTCTCACTCTCCTGCAAA
TTCATACTCTTCTTCCATACATTAACATGCCGTCCTAGGTGCTTGCTTTTTTAATTAGAC
TGGTTATAATATGTGTAACTAAGCCATTTTCGGGGCCCTCAGATTATATTAATTCCGAAT
CGGTAGTAAACGATATTTTATGAAAAGGACCCCAGGGCGCCAAACAAAACGTGGACTGTG
ACAAACTCTGCCAAAAGTCAAGCTCTAATCGTGTAAATCTTACCAATTGAGAGCGATTCC
TGTAATTAGGTTTACGGCTGTTCAATTATCTTTTCAACCGGACGGGTCTTATATTGATCA
GCAAAAACCCTTCAAAATATCAATTTATACCAAAAATTAA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
RGGGG: -779 -823 
>VAM6	Upstream Sequence Complementary Strand
ATACTTCTATAAGTCCGTTCAAAGTTATTATATCTTAGAGGATCTTTCTCTTTATTACTC
TATACCCCTACACTATAGATAAGACTACTGAGTCTGGGTTATGATCAAAATTCTGTAACG
CCCAAGTTTTAACCTCGCGGAAGACCACCGAGTAAAGTGTTTAACTCTTCTTGGGGACAT
TTACATTGATTAGTTCTATTACAATGTCCATTGGAAGGGGATGACCTTCCGTGTGGAAAA
CTAGATCTCCACCTCAACAACAAAAACGGATGAGATGTTTTCATAGGATCGCATTTTTCT
AAACTATATTGTAGCGCCCTTACCCCTAGCCTTCGGTGGCAATATGTGCTACCTGACTCA
ATGCCATAGATATCATAACAGTAATTCGTTTCTGATCTATCTCTATTTGGAGTACTTGGT
TTGCCCATATAATTTTTAAATTTTACCTGGATTCCTTTCTGTATTATAACCAGCAGGAAG
AAAGGGAAGGTTGGAATCAACCGCGGTACACACATAAATTAAATTAAGTTTTATAGTAAG
ACGACGCGATGAAGACATAATAACGAAACTCCTTATATGCTACGCAACATGATATATTGT
TTTCGAAGTGAAATATTCAAAGATATTGACCTATCAAACCAACAGAGTGAGAGGACGTTT
AAGTATGAGAAGAAGGTATGTAATTGTACGGCAGGATCCACGAACGAAAAAATTAATCTG
ACCAATATTATACACATTGATTCGGTAAAAGCCCCGGGAGTCTAATATAATTAAGGCTTA
GCCATCATTTGCTATAAAATACTTTTCCTGGGGTCCCGCGGTTTGTTTTGCACCTGACAC
TGTTTGAGACGGTTTTCAGTTCGAGATTAGCACATTTAGAATGGTTAACTCTCGCTAAGG
ACATTAATCCAAATGCCGACAAGTTAATAGAAAAGTTGGCCTGCCCAGAATATAACTAGT
CGTTTTTGGGAAGTTTTATAGTTAAATATGGTTTTTAATT