|
|
Locus Information
|
|
| Standard Name |
AI2 |
|---|
| Systematic Name |
Q0055 |
|---|
| Strain |
S288c |
|---|
| Description |
Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA; encoded by a mobile group II intron within the mitochondrial COX1 gene |
|---|
| External sources |
Open in SGD 
Open in KEGG
|
|---|
|
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq |
>AI2 Q0055
ATGGTACAAAGATGATTATATTCAACAAATGCAAAAGATATTGCAGTATTATATTTTATG
TTAGCTATTTTTAGTGGTATGGCAGGAACAGCAATGTCTTTAATCATTAGATTAGAATTA
GCTGCACCTGGTTCACAATATTTACATGGTAATTCACAATTATTTAATGTTTTAGTAGTT
GGTCATGCTGTATTAATGATTTTCTGTGCGCCGTTTCGCTTAATTTATCACTGTATTGAA
GTGTTAATTGATAAACATATCTCTGTTTATTCAATTAATGAAAACTTTACCGTATCATTT
TGGTTCTGATTATTAGTAGTAACATACATAGTATTTAGATACGTAAACCATATGGCTTAC
CCAGTTGGGGCCAACTCAACGGGGACAATAGCATGCCATAAAAGCGCTGGAGTAAAACAG
CCAGCGCAAGGTAAGAACTGTCCGATGGCTAGGTTAACGAATTCCTGTAAAGAATGTTTA
GGGTTCTCATTAACTCCTTCCCACTTGGGGATTGTGATTCATGCTTATGTATTGGAAGAA
GAGGTACACGAGTTAACCAAAAATGAATCATTAGCTTTAAGTAAAAGTTGACATTTGGAG
GGCTGTACGAGTTCAAATGGAAAATTAAGAAATACGGGATTGTCCGAAAGGGGAAACCCT
GGGGATAACGGAGTCTTCATAGTACCCAAATTTAATTTAAATAAAGTGAGATACTTTAGT
ACTTTATCTAAATTAAATGCAAGGAAGGAAGACAGTTTAGCGTATTTAACAAAGATTAAT
ACTACGGATTTTTCCGAGTTAAATAAATTAATAGAAAATAATCATAATAAACTTGAAACC
ATTAATACTAGAATTTTAAAATTAATGTCAGATATTAGAATGTTATTAATTGCTTATAAT
AAAATTAAAAGTAAGAAAGGTAATATATCTAAAGGTTCTAATAATATTACCTTAGATGGG
ATTAATATTTCATATTTAAATAAATTATCTAAAGATATTAACACTAATATGTTTAAATTT
TCTCCGGTTAGAAGAGTTGAAATTCCTAAAACATCTGGAGGATTTAGACCTTTAAGTGTT
GGAAATCCTAGAGAAAAAATTGTACAAGAAAGTATGAGAATAATATTAGAAATTATCTAT
AATAATAGTTTCTCTTATTATTCTCATGGATTTAGACCTAACTTATCTTGTTTAACAGCT
ATTATTCAATGTAAAAATTATATGCAATACTGTAATTGATTTATTAAAGTAGATTTAAAT
AAATGCTTTGATACAATTCCACATAATATGTTAATTAATGTATTAAATGAGAGAATCAAA
GATAAAGGTTTCATAGACTTATTATATAAATTATTAAGAGCTGGATATGTTGATAAAAAT
AATAATTATCATAATACAACTTTAGGAATTCCTCAAGGTAGTGTTGTCAGTCCTATTTTA
TGTAATATTTTTTTAGATAAATTAGATAAATATTTAGAAAATAAATTTGAGAATGAATTC
AATACTGGAAATATGTCTAATAGAGGTAGAAATCCAATTTATAATAGTTTATCATCTAAA
ATTTATAGATGTAAATTATTATCTGAAAAATTAAAATTGATTAGATTAAGAGACCATTAC
CAAAGAAATATGGGATCTGATAAAAGTTTTAAAAGAGCTTATTTTGTTAGATATGCTGAT
GATATTATCATTGGTGTAATGGGTTCTCATAATGATTGTAAAAATATTTTAAACGATATT
AATAACTTCTTAAAAGAAAATTTAGGTATGTCAATTAATATAGATAAATCCGTTATTAAA
CATTCTAAAGAAGGAGTTAGTTTTTTAGGGTATGATGTAAAAGTTACACCTTGAGAAAAA
AGACCTTATAGAATGATTAAAAAAGGTGATAATTTTATTAGGGTTAGACATCATACTAGT
TTAGTTGTTAATGCCCCTATTAGAAGTATTGTAATAAAATTAAATAAACATGGCTATTGT
TCTCATGGTATTTTAGGAAAACCCAGAGGGGTTGGAAGATTAATTCATGAAGAAATGAAA
ACCATTTTAATGCATTACTTAGCTGTTGGTAGAGGTATTATAAACTATTATAGATTAGCT
ACCAATTTTACCACATTAAGAGGTAGAATTACATACATTTTATTTTATTCATGTTGTTTA
ACATTAGCAAGAAAATTTAAATTAAATACTGTTAAGAAAGTTATTTTAAAATTCGGTAAA
GTATTAGTTGATCCTCATTCAAAAGTTAGTTTTAGTATTGATGATTTTAAAATTAGACAT
AAAATAAATATAACTGATTCTAATTATACACCTGATGAAATTTTAGATAGATATAAATAT
ATGTTACCTAGATCTTTATCATTATTTAGTGGTATTTGTCAAATTTGTGGTTCTAAACAT
GATTTAGAAGTACATCACGTAAGAACATTAAATAATGCTGCCAATAAAATTAAAGATGAT
TATTTATTAGGTAGAATGATTAAGATAAATAGAAAACAAATTACTATCTGTAAAACATGT
CATTTTAAAGTTCATCAAGGTAAATATAATGGTCCAGGTTTATAA |
|---|
Promoter Sequence
Download FASTA
|
>AI2 Q0055
TTATATATTTAATACTAAAAATATAACTACATTACTTTTTTAATATATATAACAATATAT
ATATATATATATATTAATTATATAAAATATAATACTCTATATTAAATATTATTTTTATCA
ATATTTATTTATATATATAATAATAATAATAATAATCAATATTAATTATTTATATATATA
AGATTAATATTATTTAATATATTATGAATAATTTAATTAATAAATCTTTAAATATTATCA
TAAAAATATAAATTAAATAATTTCTTATTTATAATAAAGAATAATAATATATATAAATAT
AATAAAGAATGTAAATAATATATATATAATATAATATAATATAAAAAATATATATATATA
TAAATATATATATAATATATAGATAATAATATTTTTATATAATTTATTTTATTATTAAGT
AATAAATAATAAAAAAATCAATATATTAAATAATATATTTATATTAGTTCGGTTTAGTTG
GTATTTTGTAATGAGTAAAAAGTAATATATAATATTAAATAATAAGTATTGATATAAGTA
ATAGATATAATAATAATATTATTAATATTTTATATAAATAATATTAATAATATAGATTAT
GAAAGAGAGTATTAATATCATTAAATATATATATATGTTATATAATTTAAATGATTTTAA
TATATATATATATATTATATTATAGATTATGATACATTTATATAAATAATATATATATAA
AAATTAATTATACTATTACTTTATAATATAATAATATTTATTTATAAAGATATAAAAGAA
TTGTTTAAAGTTATAACTAAAATATTATATAGTATTCATTAATAATTAATATTATAAATT
CAACTATTGTTATATTTATAAATAGAATAATATATTATTATCCTTTAAGATATAACAATA
ATTATTTAAATTAAATTAAATTAAATTTAATTAATTTTTTTTTTTAATGAATATAATAAT
AATAATATTATTAAAATTAATATATAAAAAAAAAGTAAAA
|
|---|
| Chr coordinates |
Chr Mito from 13818-13986,16435-18830 |
|---|
|
|
|
|
