Yeastract
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Go Back > View Contact/Credits     Tutorial     Help

 

Locus Information

Standard Name CCH1
Systematic Name YGR217W
Strain S288c
Description Voltage-gated high-affinity calcium channel involved in calcium influx in response to some environmental stresses as well as exposure to mating pheromones; interacts and co-localizes with Mid1p, suggesting Cch1p and Mid1p function together
External source Open in SGD external link
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq
>CCH1 YGR217W
ATGCAGGGGAGAAAAAGGACGCTTACGGAACCATTTGAGCCAAATACCAATCCATTTGGG
GACAATGCAGCAGTAATGACGGAAAATGTTGAGGATAACAGCGAAACAGATGGTAACCGT
CTAGAATCAAAACCACAAGCTTTGGTCCCACCAGCTTTAAATATCGTGCCACCAGAGAGC
AGCATCCACAGTACTGAAGAAAAAAAAGGTGACGAGTACAATGGAAATGATAAAGATAGC
TCCTTAATCTCCAACATATTTCGTACTCGTGTCGGAAGGAGTAGTCATGAAAACTTGAGC
AGGCCTAAACTCTCACTTAAAACAGCATCATTTGGTGCCGCTGAATCTTCCCGGCGTAAT
GTTTCACCCTCTACAAAATCTGCCAAGTCTAGTTCGCAGTATATTGATTTAAATGATGAA
AGGCTACGCAGGCGTAGCTTCAGTAGTTATAGCCGATCATCTAGTAGGCGTGTTTCTAAT
TCACCAAGCTCAACGGATAGGCCTCCACGGTCGGCAAAGGTTTTATCGCTAATTGCCGCT
GATGATATGGATGATTTTGAAGATTTGCAAAAGGGATTTAAAAGTGCAATAGACGAAGAG
GGCCTGACATGGCTACCCCAATTAAAATCAGAAAAAAGCCGTCCTGTATCAGACGTTGGA
GAAGATAGAGGAGAAGGAGAACAAGAATCTATACCTGACGTTCATACACCCAATGTAGGA
GCAAGCGCTACTCCAGGATCAATTCATCTAACACCCGAACCCGCGCAGAATGGTTCGGTA
TCTGAGGGTCTAGAAGGCTCTATTAATAATTCAAGAAAGAAACCCAGTCCAAAGTTTTTT
CATCATTTATCACCGCAAAAAGAAGATAAAGACCAAACAGAAGTTATTGAGTATGCTGAA
GACATTCTAGATTTTGAAACCCTTCAAAGAAAACTGGAATCAAGGCCCTTTGTGCTTTAT
GGACATTCTCTTGGGGTTTTCTCGCCTACGAATCCGCTAAGAATAAAAATTGCTCGTTTT
TTGTTGCATAGGCGGTATTCGTTACTTTACAACACTTTGTTAACATTTTATGCCATTCTC
CTGGCGATAAGGACATATAACCCTCACAATGTGGTTTTTTTATACCGTTTCTCTAACTGG
ACCGACTATTTCATTTTTATTTTATCAGCTTGCTTTACAGGCAATGATATTGCTAAAATA
ATTGCGTTTGGATTTTGGGACGATTCTGAAATGTTTAAAGCCTATGGACGTGAGTATAAA
TCAATCTTACAGAGATCTGGAATTATGAAACTATACATATATCTGAGAGAAAAGTATGGT
AGAAAGCTAATAGATTTCATTATTCCATTTAGGATCATATCGCCGGGAGAAGAGACAAAA
TATCAACGAAGTTCGTTGAGTACTTCCCTGACGAAACCTTATGGGGCAAAGGAAAATCAG
AGGCCTTTTGGCACCCCAAGAGCCTTTGCGAGATCATCGTGGAATAGAATAGATCTGGTA
TCTTCTGTCAGTTTTTGGCTAGGTATGTTTTTATCCATAAAAAGTTATGATACAAAAACA
GGCATAAGAATATTCAAGCCCCTTGCTATATTAAGGATTCTTCGACTTGTAAACGTGGAT
ACTGGTATGCCCTCAATTCTAAGGGGATTGAAATATGGTATCCCACAGTTGGTAAATGTT
AGTTCAATGCTAGTTTACTTTTGGATTTTCTTTGGGATTTTGGGAGTACAGATTTTTCAG
GGCTCTTTTCGAAGACAATGTGTATGGTTTAACCCTGAAGATCCTACCGATACTTACCAG
TACGATATGCAATTCTGTGGTGGTTACCTAGATCCAGTAACAAAACGAAAACAAAATTAT
ATCTATGAAGACGGATCAGAAGGTTCTGTTTCAAAAGGCTTTCTTTGCCCACAATATTCG
AAATGTGTTTCCAATGCCAACCCCTACAACGGCAGAATTAGTTTTGATAATATTGTTAAT
TCCATGGAGCTCGTTTTTGTCATTATGAGTGCGAATACTTTTACTGACTTAATGTACTAT
ACGATGGATTCGGATGAAATGGCTGCCTGTTTGTTTTTTATTGTTTGCATCTTTGTTTTA
ACTATCTGGCTGCTAAATCTACTCATTGCAGTGTTGGTATCATCTTTTGAAATAGCCAAT
GAGGAGTACAAAAAGAAAAAGTTCATATATGGTTCTAGAAAGACAGGTTATGTTGCTCGC
ATAGTAACAGGCTACTGGAAATATTTTAAGCTTAAGGCGAATCAGACAAAATTCCCAAAT
TGGTCCCAAAAAGGACTAGCTATTTATTCCCACGTTGAGTTTATCTTTGTCATACTTATT
ATTTGCGATATAGGTATGCGCGCCTCTGTTAAAGTATCGACTTCGGCAAACTGTAACAAT
ATCCTTCTAAAAACTGACAGGGGAATTTCGATTGTTCTCTTCATCGAATCACTGGCAAGG
TTAGTATTATATCTGCCCAATATGTGGAAGTTTTTAACAAAACCTAGTTACGTTTACGAT
TTTATTATATCAATTATTACTCTGGTTATTAGTTGCCTGGCTGTTGAAGGGGTTCTAGGA
CATATGTATGCCTGGCTATCCATATTCCACATATCCAGATTTTACAGGGTGATTATTTCT
TTCAATTTAACAAAAAAACTATGGAAACAAATATTGAGTAATGGTGTTATGATTTGGAAC
TTATCGTCTTTTTACTTTTTTTTCACCTTTTTGGTTGCTATAATCATGGCTGTGTATTTC
GAAGGCGTGATTCCTCCAGAAGAAATGGCAGACCAGCCATTTGGAATGTATTCACTACCG
AATTCATTTCTTTCTTTGTTTATAATAGGTTCAACTGAAAATTGGACGGATATCCTATAT
GCCCTCCAAAAACACTCACCAAACATCTCCTCAACTTTTTTTTGCTCAGTATTTTTTATT
ATATGGTTTCTACTATCCAACTCAGTGATCTTGAACATTTTCATTGCCCTAATATCAGAA
AGCATGGAAGTGAAAGAAGAAGAAAAACGACCACAGCAAATTAAGCATTATCTTAAGTTC
GTCTATCCTCAGAAAATACAAGAATATACACACGCTAGTTTGGTTGCGAGAATTCGTAAA
AAATTCTTTGGAGGTCATAGGAACGAAGATACAAGAGATTTTAAGCAATTTCTTATGAGA
GGAACCGCGATAATGAACATAGCGCAGAATATGGGGGAGTTGGCCGATGAATTCAAAGAG
CCACCTTCAGAAAACCTATTTAAAAAGGGCTTATCAAAGCTCACAATTGGGGTTCCGTCA
CTAAAAAGGCTGAGAATGTTTGCTAATAATCCATTTTATAAAAATAGTGACGTTGTGTTT
ACAGAAACGAACGATATAAATGGGAGGACGTATATCTTGGAGTTGAATGAGTACGAGGAT
GAGAAGCTAGATTATTTAAAAAAGTACCCTTTATTCAATTACTCATATTATTTCTTTTCT
CCTCAGCATAGATTTCGAAGGTTCTGTCAACGCTTGGTACCACCAAGCACTGGAAAAAGG
ACTGATGGATCACGATTTTTCGAGGATAGCACTGATCTATACAATAAAAGGAGCTATTTT
CATCATATTGAAAGAGATGTATTTGTATTCATTTTCGCACTTGCCACCATTTTACTAATT
GTTTGCTCATGTTATGTTACGCCTCTATATCGTATGCATCACAAGATGGGAACTTGGAAT
TGGTCCTCGGCGTTAGATTGCGCCTTCATTGGTGCCTTCTCAATTGAATTTATCGTGAAA
ACAGTAGCTGACGGATTTATATATTCTCCAAATGCTTACCTGAGGAATCCATGGAACTTT
ATTGATTTTTGTGTCCTAATCTCAATGTGGATTAATTTAATTGCATACCTAAAAAACAAT
GGAAATTTGTCTAGGATTTTCAAGGGATTGACAGCCCTGAGGGCCCTCAGATGCCTCACG
ATCAGTAACACAGCTCGTCAAACATTTAACCTAGTTATGTTTGATGGTTTAAATAAAATT
TTTGAAGCTGGGTTGATTTCACTCAGTTTGCTATTTCCATTTACAGTTTGGGGCTTAAGC
ATTTTTAAAGGCCGTTTAGGTACTTGCAATGACGGAAGTTTGGGCCGTGCAGATTGTTAC
AATGAATATTCAAATTCCGTTTTTCAATGGGATATCATGTCTCCAAGGGTTTACCAGCAA
CCATATCTTCATTTGGACTCTTTCGCAAGCGCTTTTAGTTCATTATACCAAATCATTTCT
TTGGAAGGATGGGTTGATTTGTTGGAAAATATGATGAATAGTTCAGGAATAGGTACACCC
GCTACGGTAATGGGTTCAGCAGGGAATGCTTTATTCCTCGTTCTGTTTAATTTTTTAAGT
ATGGTTTTCATCCTGAACTTGTTTGTTTCATTCATTGTTAACAACCAAGCAAGGACAACA
GGAAGCGCTTACTTTACCATTGAGGAAAAGGCGTGGCTGGAATCCCAGAAACTTTTATCT
CAGGCCAAGCCAAAAGCTATCCCAAATTTAATTGAGTTATCAAGAGTTAGGCAATTTTTC
TATCAACTTGCAGTGGAGAAAAAAAATTTCTACTACGCATCGTTTCTTCAGGTAGTACTT
TATTTGCACATAATCATGCTCCTGAGTCGAAGCTACAATCCAGGAAACTTGATAGGTTAT
CAAGGTGTTTATTTTATGTTTTCCACTAGTGTTTTTTTAATTCAAGAGGCACTTCACATG
TGCGGTGAAGGACCAAGATTATATTTTAGGCAAAAATGGAACAGCATACGACTCAGTATC
ATAATTATAGCCTTTATTATGAACGCTGTAGCATTCCACGTTCCAGCCTCTCACTATTGG
TTCCACAATATAAAGGGGTTTTTCCTGTTAGTGATATTTTTGTTTATTATTCCTCAAAAT
GACACACTAACTGAACTATTAGAAACCGCAATGGCAAGCTTACCGCCTATTCTATCATTG
ACCTACACTTGGGGGGTTTTATTTTTAGTATATGCTATTGCTTTGAATCAAATCTTCGGC
CTAACAAGGTTAGGGAGTAATACGACCGATAACATAAATTTTAGAACTGTAATCAAATCC
ATGATTGTTCTGTTTAGATGTAGTTTTGGTGAGGGCTGGAATTATATCATGGCCGACCTA
ACTGTGTCAGAACCTTATTGCTCCTCTGATGATAATTCAACCTATACGGACTGTGGATCA
GAGACATATGCCTATTTGTTATTAATGTCGTGGAATATTATTTCCATGTATATTTTTGTG
AATATGTTTGTTTCGTTGATTATTGGTAATTTCAGTTATGTTTACCGTAGCGGTGGATCT
CGCTCTGGCATCAACAGATCGGAGATAAAAAAATACATTGAAGCTTGGTCCAAATTTGAT
ACTGATGGAACTGGCGAGCTTGAGCTGTCCTACCTCCCAAGAATAATGCATTCATTTGAC
GGTCCTCTTTCATTTAAAATTTGGGAAGGTAGATTGACAATAAAAAGTCTAGTCGAGAAC
TACATGGAGGTTAACCCAGATGATCCATATGACGTCAAAATAGACCTGATCGGACTGAAC
AAAGAGCTGAATACGATTGATAAAGCAAAGATCATACAGAGGAAGTTACAGTACAGAAGA
TTTGTACAAAGCATTCACTATACGAATGCTTATAATGGATGTATCAGATTCTCGGATTTG
TTATTACAAATACCTCTCTATACAGCTTATTCTGCAAGGGAATGTCTAGGTATTGATCAA
TATGTCCATCATCTATATATCCTGGGTAAAGTGGACAAGTACTTAGAAAATCAAAGAAAC
TTCGATGTATTGGAGATGGTGGTAACAAGATGGAAATTTCATTGCAGGATGAAACGTACC
ATTGAACCCGAATGGGATGTTAAAGATCCCACAGTATCGTCTCACATTTCGAATATAAAC
GTAAATCTGGAACCTGCTCCAGGAATTTTAGAAAGAGAACCTATTGCGACACCTAGAATG
GACTACGGTGTTAACAATTTTATGTGGTCTCCGAGAATGAATCAAGACTCTACGATGGAG
CCCCCGGAAGAACCAATAGATAATAATGACGATAGCGCAAATGATCTAATTGATAGATAA
Promoter Sequence
Download FASTA
>CCH1 YGR217W
TCTTTTTCCACCATAGAGCCAACATTCTGTATGTTATCCTTCTTATTAATACGCTCATAC
TGTACTGGGAAATAGCAAATTTGTTGACAACGAAGATCGATTTGCTGGACAAATGCCGAG
TAATTTACCAACTGAAAGTGCGAATAATTTAATAACGAGGATACGAGACTAGCAATAGAG
CAGATCACAAAAGTCAAATAAAAACCAATTTTTGCGACCATTTTATAAATACAAGTAGAT
GAACACCAAGCTGCGACACTATTAAGCATAGTACCCCTCAAATTTTCCTGTGATGTTTGA
ATAAACGGGTAAAGCTCATTTAATGCTTTACAATATGCGGGGAATAGATTAATGATGTTC
AAAGTTTCACTCAATTTCTTATTATCTCTCTTGTATCTTGGATGTTGCTCTAATTTAGAA
TAGTTCAGAGTTTCACCCACACTACTATGAAGACCAACTTCTTTTTCTGGTATGATGAGC
GAGATGGGATCAGAAGAATAGAATTGCATAAATTTCAGCTTGGGTATTCTAAAATGGACA
TTACAGGGATCAGCAACTTTGTAGTTCCAACCCTCCGCTCCATTGTTCTTAGTAGCTACC
ACTGAATAAGGGGGCCGTATGCTTACTTCTTCTAAATACTGAGGTTCGCAAACACCTAAG
ACAACAAAATGCGTCTTCTCAAATGAAATTGCCAAAGCTACCTGAGGTCCTTGAGCTGCG
GAATTCTCGAACAAGGATTCGTATGGCCAGAAAATGTAATTTGGCATGTCATTTAACTGT
ATAAAACCGCCCCTGAATTCGAAGGTTCCTGTTCACAGAGGAATTTTCATTCTTTTTGGT
ATTATGTTCTGGTAGGTTTTTTTCATATTCTACATTTCGGCATTCTCACTGAAAATAAAT
ATAGATGAGATAGAAGATCATGAATCAATGGTTGGTGACAAGCTAACATAAGGAAAATCA
AAATACACGGCATTACTAAATAGAATATATTGTTAGTACT
Chr coordinates Chr VII from 924696-930815
w3c xhtml validator w3c css validator