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Orthologs
Standard Name
YHL009W-B Systematic Name
YHL009W-B Strain
S288c Description
Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes; transcribed/translated as one unit; polyprotein is processed to make a nucleocapsid-like protein (Gag), reverse transcriptase (RT), protease (PR), and integrase (IN); similar to retroviral genes External sources
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>YHL009W-B YHL009W-B
ATGGCGACCCCAGTGAGGGATGAAACAAGAAATGTTATTGACGACAACATTTCTGCGCGG
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ATTACCAATGACAAAACCTTACTGCATAATTACGAAGACAGTAATCGCAGTACACGATTT
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GGATCACCAGTACAAACAGTTAATAAAAGTGCCTTCTTAAACAAAGAATTCAGTTCTTTG
AACATGAAAAGAAAACGGAAAAGACACGATAAAAACAATAGTCTAACAAGCTATGAATTA
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ACAGTTTCAGCACAAAAAATTAGAGCCATATATTATAATGAAGCTATTTCAAAAAATCCT
GACCTCAAAGAAAAACATGAATACAAACAGGCATATCATAAAGAATTACAGAATTTAAAA
GATATGAAGGTATTTGATGTCGATGTGAAGTACAGTAGATCAGAAATCCCTGATAATTTA
ATAGTACCCACCAACACGATATTCACAAAGAAAAGAAATGGGATTTATAAGGCTAGGATA
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TCAGAAGAAGAGTTTAGACAAGGTGTTCTAAAGCTACAACAATTACTAGGTGAACTAAAC
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GCTATAACTGATGCATCAGTTGGATCAGAATATGATGCTCAATCAAGGATTGGAGTTATA
TTATGGTACGGTATGAATATTTTTAATGTTTATTCTAACAAGAGCACAAACAGATGTGTA
TCATCAACAGAAGCAGAGCTTCATGCCATTTATGAAGGCTATGCAGACTCAGAAACGTTG
AAGGTAACATTAAAGGAGCTAGGAGAAGGAGACAATAATGACATTGTCATGATCACTGAC
TCAAAGCCAGCCATTCAAGGATTAAATCGCAGCTATCAACAACCAAAAGAGAAATTCACT
TGGATAAAAACTGAAATAATAAAAGAAAAAATTAAAGAGAAGAGTATAAAACTGTTAAAA
ATTACCGGCAAAGGTAATATTGCTGATTTACTAACAAAACCAGTATCAGCATCTGATTTT
AAAAGATTTATACAAGTATTAAAAAATAAAATAACATCACAGGATATTTTGGCCTCAACA
GACTATTGA Promoter Sequence
Download FASTA
>YHL009W-B YHL009W-B
GTTTGCTCGCTCAATAGGTCTGGTTGTTGTTTTATACATTTGCTATCTTCTTGGAATAGA
CTATTTCTGATACAACAATCCTCCTCTTGGCATTGAGGGTTAATAAATTTCATGAATCCG
CTGGTATTATCATCCATATTAGAAGGCGTCATAACAATTGCTTCAGCCTTATTCTTCGTT
AGTTTATACTGGAAGTAAAGCAAACACCTACTGCCCCTTTTATCGAAATGATAAACAAAT
AAGAAAGCTCAGAGGGCCTCCGGTAATATTCAAATCGATCTGTTTTATAATGCTTATTGA
ATAATAATGCCGTTGCTGTACTCTTAACATAAAGCTACGAAAATCCACTATACATTTTTC
TAAAGAAAAAAAAAAAATTCAAAAAAAATTGATTTCGCCCAGGATCGAACTGGGGACGTT
CTGCGTGTTAAGCAGATGCCATAACCGACTAGACCACGAAACCAAATTCTTATTGATTAT
GTTGTATTACGGGCTCGAGTAATACCGGAGTGTCTTGACAATCCTAATACAAACAGTCTT
AGGGAAGTAACCAGTTGTCAAAACAGTTTATCAGATTAATTCACGGAATGTTACTTATCT
TATATATATTATATAAAATATGAATCATACTGTTGGAACGAGAGTAATTGATAGTGACAT
GAGTTGCTATGGTAACAATCTAATGCTTACATCGTATATTAATGTACAACTCGTATACGT
TTAAGTGTGATTGCGCCTATTGCAGAAGGAATGTTAAACGAGAAGCTCAGACAATACTGA
AGCGGTGTTAAAGACCTATTAGTTGAACATGTTATGGTAGGTACATATATGAGGAATATG
AGTCGTCACATCAATGTATAGTAACTACCGGAATCACTATTATATTGGTCATAATTAATA
TGACCAATCGGCGTGTGTTTTATATACCTCTCTTATTTAGTATAAGAAGATCAGTACTCA
CTTCTTCATTAATACTAATTTTTTACCTCTAATTATCAAC
Chr coordinates
Chr VIII from 85909-86994,86996-91318
