Locus Information
Locus Info
Protein Info
GO Info
Orthologs
Standard Name
SNU114
Systematic Name
YKL173W
Alias
GIN10
Strain
S288c
Description
GTPase component of U5 snRNP involved in mRNA splicing via spliceosome; binds directly to U5 snRNA; proposed to be involved in conformational changes of the spliceosome; similarity to ribosomal translocation factor EF-2
External sources
Open in SGD
Open in KEGG
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq
>SNU114 YKL173W
ATGGAAGGTGACGATTTATTCGATGAGTTTGGAAATTTGATCGGAGTTGATCCTTTTGAC
TCGGATGAAGAAGAAAGTGTGCTGGATGAGCAAGAACAATATCAAACCAATACGTTTGAG
GGGAGCGGCAACAACAATGAGATTGAGAGCAGACAACTTACCTCGTTAGGAAGTAAAAAG
GAACTTGGAATTTCCTTAGAGCACCCTTATGGTAAGGAAGTGGAAGTATTAATGGAAACT
AAGAACACACAGTCACCACAGACTCCACTGGTAGAGCCGGTTACAGAACGAACAAAGTTG
CAAGAGCATACAATTTTTACACAATTAAAAAAAAACATTCCGAAGACTAGATATAATCGA
GACTATATGTTATCAATGGCTAACATTCCGGAGAGGATAATAAATGTTGGTGTCATTGGA
CCTCTTCACTCAGGTAAGACCTCTTTGATGGATCTCCTAGTAATCGACTCACACAAACGC
ATACCAGATATGTCTAAGAATGTAGAACTTGGATGGAAACCGCTAAGATACCTGGATAAT
TTGAAACAAGAGATTGACCGGGGTCTTTCCATTAAACTTAATGGTTCCACTCTACTCTGC
ACCGATTTAGAATCCAAGTCTAGAATGATAAACTTTTTGGATGCACCAGGGCATGTTAAT
TTTATGGATGAAACGGCAGTCGCACTTGCAGCAAGTGATTTGGTTTTAATCGTGATAGAT
GTTGTAGAAGGTGTTACATTTGTGGTAGAGCAATTGATAAAACAAAGTATTAAAAATAAT
GTAGCAATGTGTTTTGTTATAAATAAACTCGACAGATTGATTCTAGATTTAAAGTTGCCA
CCAATGGACGCATACTTGAAGTTAAATCATATAATTGCAAATATCAATTCCTTTACGAAG
GGAAACGTGTTTTCACCAATAGACAATAACATAATATTTGCGTCTACAAAGCTGGGCTTC
ACATTCACTATCAAGGAATTTGTTTCTTATTATTACGCCCACTCCATACCTTCTTCTAAG
ATAGACGACTTTACCACAAGGCTATGGGGTAGCGTATATTACCATAAAGGTAATTTCAGG
ACAAAACCATTTGAAAATGTAGAGAAGTACCCGACTTTCGTTGAATTTATCCTCATCCCG
CTTTATAAAATATTTTCCTACGCTTTATCTATGGAGAAAGATAAATTAAAGAATTTGTTA
AGGTCTAACTTTAGAGTTAATTTAAGTCAAGAGGCCCTCCAGTACGATCCGCAACCTTTT
TTAAAACACGTTCTACAGTTAATATTTAGGCAACAAACCGGTCTTGTAGATGCGATAACC
AGATGTTATCAACCATTTGAATTATTCGACAATAAGACAGCTCATCTTTCAATTCCAGGA
AAATCTACACCAGAAGGCACTCTTTGGGCTCATGTACTGAAAACTGTGGATTACGGTGGA
GCAGAGTGGTCCCTTGTACGGATATACTCTGGACTTTTGAAGAGAGGGGATACAGTACGT
ATACTTGATACATCACAATCTGAATCTCGCCAAAAAAGACAGTTGCATGATATCTCAAAG
ACGGAAACCTCCAACGAAGATGAAGATGAAGATGACGAAACGCCTTCATGTGAGGTCGAA
GAAATTGGCTTATTAGGTGGCAGATATGTCTATCCGGTTCATGAAGCACACAAAGGACAG
ATAGTATTAATAAAAGGTATTTCAAGTGCATATATTAAATCCGCGACGTTGTACTCTGTA
AAGAGTAAGGAGGACATGAAACAGCTAAAATTTTTCAAACCTTTAGATTATATTACCGAG
GCAGTTTTCAAAATTGTTCTTCAACCTTTACTGCCAAGGGAATTACCCAAGTTATTGGAT
GCCCTGAACAAAATTTCGAAATACTACCCAGGCGTTATTATTAAAGTTGAGGAATCTGGA
GAACATGTAATACTAGGAAATGGAGAGCTGTATATGGACTGTTTGTTGTATGATCTAAGA
GCGAGTTATGCAAAGATAGAAATTAAAATATCTGATCCTTTAACTGTTTTTTCTGAAAGT
TGCTCAAATGAATCGTTCGCTTCAATACCTGTAAGTAATTCGATATCTCGCCTTGGTGAG
GAAAATTTACCAGGTCTGTCGATTAGTGTAGCCGCTGAACCAATGGACTCTAAAATGATT
CAGGATTTGAGCAGGAACACATTGGGAAAGGGTCAAAACTGCTTGGATATTGACGGAATA
ATGGACAACCCAAGGAAACTATCCAAAATATTGAGAACCGAGTATGGGTGGGATTCGTTG
GCATCAAGAAACGTTTGGTCTTTTTATAATGGCAACGTGTTGATTAATGACACTTTGCCA
GATGAAATCAGTCCTGAATTATTATCCAAATATAAGGAACAAATAATACAAGGATTTTAC
TGGGCTGTAAAAGAGGGGCCTTTGGCAGAAGAACCAATTTATGGTGTACAGTATAAATTG
TTATCGATCTCAGTACCTTCCGACGTAAACATTGACGTTATGAAAAGTCAAATTATTCCG
CTAATGAAAAAAGCCTGTTACGTTGGCTTACTGACAGCAATCCCAATTTTATTGGAACCC
ATCTATGAAGTTGACATCACGGTCCACGCCCCCTTGCTGCCAATAGTAGAGGAACTTATG
AAGAAGAGACGTGGAAGCAGGATATACAAAACAATAAAAGTGGCAGGGACACCATTGTTG
GAGGTTCGTGGACAAGTTCCGGTTATTGAATCTGCAGGATTCGAGACAGATTTGAGATTA
TCTACGAATGGTCTTGGTATGTGTCAGCTGTACTTTTGGCACAAGATATGGAGGAAGGTT
CCTGGTGATGTTTTGGATAAAGATGCGTTTATTCCAAAATTGAAACCCGCACCTATCAAC
AGTTTAAGTCGTGATTTCGTGATGAAAACAAGAAGGCGGAAGGGTATTTCTACAGGTGGA
TTTATGTCAAATGATGGTCCTACGCTTGAAAAGTATATAAGCGCTGAATTATACGCTCAA
TTAAGAGAAAATGGCTTAGTACCGTGA
Promoter Sequence
Download FASTA
>SNU114 YKL173W
CTTCAAAGATCGAAATTTACCTTTGTGGAATACTAGTAGAAGAATATCAATAAATATAAT
GGCATATATGATCCAATAAACACAGACTTTGTTTATTGTTTCAATAAATCTTGCAAATTT
CAAATTCACGAGGCCTACAACAGTCACAACTAAGTAAAATACAATGACTGTGTAAAAAAT
CAAGTGTGCCTCGGATATTAGGTTGGAGTTCGTCATCAGAATCAAAGAAATGGTAAGTTG
AGCGCCTGCAAAAGTAATACTGGTACTCATAGTCCAATTCCCTATGAGCATTAACCAGCC
AGTGTACCACGAACATACTAATTTCAATTTCTCCGGGGCCAACATGGCACTCCCAACATG
CAGTTCCATCGGAAATTTTGAAACAATCTCACCAAGAGAAAGCGACGAAAACCATATACA
CACTCCACTGATTAAAAAACCTAGCATTATAGTTAACGGACCACCATTAATTAGCCCAAT
GGCCATACTAGTGCACATTCCTAAAACGGGACTCATTAGTCCTAAACCGAGACCGACAAT
AGAACCTCTTGACAATAACGATTTATCCAACACCTGATCATAATTGAAATGCTCGGCCTC
CTCGTTCTCTTGACTGTCATCTTCATGAACAATGGTGTGCAAGTTATCAAACAAACCATT
CGGATCGAAATGAACGATATTCTCCCTTATATTATCAGCCAGTAGCGTATACTCTGGCAT
TTTTCATTTATTTGACTTATTTTTATTTATTTTATTGTACAATGGCAAACAAATACACGG
ACTGGTATGTTCTTCGTCAAATTGATGATCTGTTCTTTTGGCTTATCCTTATGGGATGAT
TAATGATTGTTAAAGCCTCATTGCGGAAATTTTAATGCCGGAAAGGCCTGAAAAATTTCA
AAGTGGCAGAAAACAAGGCTTTGGGGCATTACTTGCCAACGGCTGACGATTGCTAGCTGC
TTTTACAGAAGCGATACACAATAGCTCCTAACATAGCAAA
Chr coordinates
Chr XI from 122517-125543