S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

AI5_BETA

Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -949 -947 -945 -919 -812 -810 -808 -806 -804 -802 -660 -631 -608 -369 -367 -348 -346 -293 -260 -258 -256 -254 -252 -250 -231 -229 -227 -225 -223 -221 -219 -183 -149 -147 -145 -143 -136 -47

>AI5_BETA    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ATGATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTTATTTATTATTTACTTTTTTGATATAan>TAan>TA
GAGGCAAACTCGAGGAAAACCATATAATTAGAATAAGTAATAATTATATGACAACCGTCG
AACTAAATCATATTCAAGAAATTAATATGTAAAAGCGTAGAGATTAGACGCCTCTGGTTA
TCTAAGTAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TATTATATGATAACATAAGGTATAATCCAATGAGATCAG
TAATGATTTTAAAACAATAATTTTGTTTTAAGTATTAATAATAATATTAATATTCGACCT
CTTAATTGAGGATATTATAATCATAATTTTTTATATTATAATATAAAATTTAACTAGCTA
GATAATATTATATAAAAAAAAAAAATAATATTATATAAATTAATTAAAATAATTTTTATT
AATTGAAACTGAAATGTTTTAAAGTTAAATAAAAGAGCTCTAATCCATGGTGGTTCAATT
AGATTAGCACTACCTATGTTATATGCAATTGCATTCTTATTCTTATTCACAATGGGTGGT
TTAACTGGTGTTGCCTTAGCTAACGCCTCATTAGATGTAGCATTCCACGATATTAATTTA
ATAAGTGTCGTGCTTAAAATTCACTAAAATAATATAan>TAATAAATTATAATAAATATAan>TAA
AAAAAATAAAAAAAATAAAAAAAAATTAATATCTTATGATTAATTTTATATAAATAAAAA
TTTATTAAATATTATTGGTTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TATTAATAATAAAAAAATATAan>TAan>TAan>TA
>TATAan>TAGCTAACGGGGAAACTCTTATAATTATTATTTATATAATAAATAAGACAATCCCG
TGATAACTTTAATATAan>TAan>TAan>TATTATATATTAAAGTATTGTAGAGACTAAACGTGAATGA
TTTTAATATTATTTAAATATTAAAATTAAGAGATAGTCCAATCTTATATGTAAATATAAG
TTAATACCAAAAAAAAAATAATATTATTTTGACTTATTAT

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -51 -130 -132 -137 -139 -141 -143 -179 -215 -217 -219 -221 -223 -225 -244 -246 -248 -250 -252 -254 -256 -289 -342 -363 -496 -604 -627 -664 -791 -796 -798 -800 -802 -804 -806 -891 -941 -943

>AI5_BETA	Upstream Sequence Complementary Strand
TACTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAAATAAATAATAAATGAAAAAACTATATAan>TAT
CTCCGTTTGAGCTCCTTTTGGTATATTAATCTTATTCATTATTAATATACTGTTGGCAGC
TTGATTTAGTATAAGTTCTTTAATTATACATTTTCGCATCTCTAATCTGCGGAGACCAAT
AGATTCATTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAATATACTATTGTATTCCATATTAGGTTACTCTAGTC
ATTACTAAAATTTTGTTATTAAAACAAAATTCATAATTATTATTATAATTATAAGCTGGA
GAATTAACTCCTATAATATTAGTATTAAAAAATATAATATTATATTTTAAATTGATCGAT
CTATTATAATATATTTTTTTTTTTTATTATAATATATTTAATTAATTTTATTAAAAATAA
TTAACTTTGACTTTACAAAATTTCAATTTATTTTCTCGAGATTAGGTACCACCAAGTTAA
TCTAATCGTGATGGATACAATATACGTTAACGTAAGAATAAGAATAAGTGTTACCCACCA
AATTGACCACAACGGAATCGATTGCGGAGTAATCTACATCGTAAGGTGCTATAATTAAAT
TATTCACAGCACGAATTTTAAGTGATTTTATTATATATTATTTAATATTATTTATATATT
TTTTTTATTTTTTTTATTTTTTTTTAATTATAGAATACTAATTAAAATATATTTATTTTT
AAATAATTTATAATAACCAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAATTATTATTTTTTTATATAan>TAan>TAan>T
ATAan>TATCGATTGCCCCTTTGAGAATATTAATAATAAATATATTATTTATTCTGTTAGGGC
ACTATTGAAATTATATAan>TAan>TAan>TAATATAan>TAATTTCATAACATCTCTGATTTGCACTTACT
AAAATTATAATAAATTTATAATTTTAATTCTCTATCAGGTTAGAATATACATTTATATTC
AATTATGGTTTTTTTTTTATTATAATAAAACTGAATAATA