S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

BI2

Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -995 -993 -991 -989 -987 -985 -961 -915 -913 -908 -862 -797 -775 -770 -768 -760 -691 -675 -641 -608 -582 -571 -512 -388 -383 -198 -196 -180 -178 -147 -139 -137 -135 -123 -121 -119 -117 -115 -113 -91 -89 -81 -62 -60 -58

>BI2    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
CAATTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TATTTTTTTTTAATACAAATAATATATTCATAATAATAAATA
CCGATTGTTATTATACTATAATAAAATATAan>TAATATATTTTTCATTATAATATTTTTAAA
TAAATATTATAATAAATTATATAAATAATATTTATGTATAATAATAATAATAATAATTGT
TATTAATTAATTCTATAATTATTATATATTTAATTTTTTTTTTTAATATAATATAan>TAATA
ATATAATTTATTTTATTTTTTTTTATAGTTCCGGGGCCCGGTCACGGGAGCCGGAACCCC
GAAAGGAGAATATAAATTAATAATAATATAAATAACATATTAACAATAAATTATTGTTAA
TATAATAATAATAATAACAATATTAATAAATAATATAAAAATTATTAATATTATATTTAT
ATAATATTAATATAAAAATCTTTCATAATATTAATTATTATTAAATAATAATGATATCAT
TAATATTAATATAATCGTCAATATTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATT
TATTTATTATTAAATAAATATTTTTAAATATTATATTATATTATTAACTTTTTATTAAAA
AAATTAATAATGATATAATATAATTAATATTATCCACGGGACCAATGACCAACCCAGTAG
TTGACCGGATTGGCGCCCGCGAGGTTTATATTTAATAAATAATAATAATAATATTAATAA
AATCTATTAACTTTTTTTTTTAATGGATTATATTAATGAAAAAAAAATGAGAAATATCTT
TTTTTTTTAATAATTATAATTTATATAan>TAATAAAATATGTATATAan>TAATAAAAAAATAGT
TTTTAATATTATAATATAATTATATAan>TAan>TAATTATAAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAATAAGTAT
TAATTAATAATATAan>TATTTATATATTTTTTATTAATTAATATAan>TAan>TAAAATATTAGTAAT
AAATAATATTATTAATATTTTATAAATAAATAATAATAAT

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -54 -56 -75 -77 -83 -85 -109 -111 -113 -115 -117 -131 -133 -135 -174 -176 -192 -194 -247 -309 -419 -424 -578 -584 -764 -791 -793 -858 -902 -909 -955 -979 -981 -983 -985 -987 -989 -991

>BI2	Upstream Sequence Complementary Strand
GTTAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAAAAAAAAATTATGTTTATTATATAAGTATTATTATTTAT
GGCTAACAATAATATGATATTATTTTATATATTATATAAAAAGTAATATTATAAAAATTT
ATTTATAATATTATTTAATATATTTATTATAAATACATATTATTATTATTATTATTAACA
ATAATTAATTAAGATATTAATAATATAan>TAAATTAAAAAAAAAAATTATATTATATATTAT
TATATTAAATAAAATAAAAAAAAATATCAAGGCCCCGGGCCAGTGCCCTCGGCCTTGGGG
CTTTCCTCTTATATTTAATTATTATTATATTTATTGTATAATTGTTATTTAATAACAATT
ATATTATTATTATTATTGTTATAATTATTTATTATATTTTTAATAATTATAATATAAATA
TATTATAATTATATTTTTAGAAAGTATTATAATTAATAATAATTTATTATTACTATAGTA
ATTATAATTATATTAGCAGTTATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAA
ATAAATAATAATTTATTTATAAAAATTTATAATATAATATAATAATTGAAAAATAATTTT
TTTAATTATTACTATATTATATTAATTATAATAGGTGCCCTGGTTACTGGTTGGGTCATC
AACTGGCCTAACCGCGGGCGCTCCAAATATAAATTATTTATTATTATTATTATAATTATT
TTAGATAATTGAAAAAAAAAATTACCTAATATAATTACTTTTTTTTTACTCTTTATAGAA
AAAAAAAATTATTAATATTAAATATAan>TATTATTTTATACATATAan>TATTATTTTTTTATCA
AAAATTATAATATTATATTAATATAan>TAan>TATTAATATTTATATAan>TAan>TAan>TAan>TATTATTCATA
ATTAATTATTATATAan>TAAATATAan>TAAAAAATAATTAATTATATAan>TATTTTATAATCATTA
TTTATTATAATAATTATAAAATATTTATTTATTATTATTA