Yeastract
Please fill in here our
user satisfaction survey
Thank you!
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name Q0010
Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -999 -987 -982 -964 -948 -946 -913 -908 -906 -844 -842 -840 -838 -811 -809 -807 -787 -758 -738 -684 -665 -656 -632 -630 -628 -626 -611 -609 -607 -605 -603 -601 -599 -597 -595 -593 -578 -535 -524 -522 -520 -410 -381 -352 -333 -230 -209 -207 -198 -124 -122 -109 -87 -70 -68 -58 -56 -54 -52 -50 -43 -41 -22 -14 -12 -10
>Q0010    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AATATAAAAATAAATATAATATAATTTAGGATAATTATATAAAATATTTATTATATAan>TAG
TTTTTATAAAGAGTTTTAAAAGTGATAATATAATATAan>TAATATTTATAAGTTCCGGGGCC
CGGCCACGGGAGCCGGAACCCCGAAAGGAGTTATTTATATAan>TAan>TAan>TAATTATAATCTTAT
TAATTATTTATATAan>TAan>TATTTAATATTATTTTTATATAATTTTATATTAAAGTATTATAA
TTATATATTTAATATTATTTTTATATAATTTTATATTATTTATTTATTTATTTATTTATT
TAAAAATATTATAATCATATATTTAATATTATTTAATATATTTTATATATTATATCTTTT
ATTGATTTATATAan>TAan>TAan>TAGATTTAATAAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAAATATTCA
TTATATATTTATTATTATTATTATTATTTATTACTATTTTTTATTATATATTAATAATAT
ATAan>TA
TTATTAGTTATGGGTATCCTAATAGTATATTATTATTTTTAATAATAATTTATGA
TTTATGTATAATAAATAAGTAGGGAATCGGTACGAATATCGAAAGGAGTTATATATTATT
AATTATTTATAATTATTTTATATATTATTAATTATTTATAATTATTTTATATATTTATAA
TTATTTTATATAGATAGGTTAGATAGGATAGATAGTATAGATAGGGGTCCCATTTATTAT
TTACAATAATAATTATTAATGGGACCCGGATATCTTATTGTTATTAATTTATATATTATT
CATTATTATTAATATAan>TATTTAATATAATTAAATATTATATTATATTATATTATATTATT
TATTAAAAAAAAATCTATTACTTATTTTTTTTATTAATATAan>TAAATTATTTATATAATTT
ATCATTTTTATTTATATATTATTATTTTTTATATAan>TAAATTAATATAan>TAan>TAan>TAan>TATTATA
TATA
CTTTTTTTTTTATAATATATCTATATAan>TAan>TAAATAA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -6 -8 -10 -16 -37 -39 -44 -46 -48 -50 -52 -64 -66 -81 -83 -105 -118 -164 -169 -174 -179 -201 -203 -224 -226 -329 -346 -348 -375 -377 -404 -406 -485 -514 -516 -518 -529 -531 -572 -574 -589 -591 -593 -595 -597 -599 -601 -603 -605 -622 -624 -626 -628 -645 -650 -652 -659 -678 -724 -734 -752 -754 -773 -783 -801 -803 -805 -807 -834 -836 -838 -840 -902 -942 -944 -960
>Q0010	Upstream Sequence Complementary Strand
TTATATTTTTATTTATATTATATTAAATCCTATTAATATATTTTATAAATAATATAan>TATC
AAAAATATTTCTCAAAATTTTCACTATTATATTATATATTATAAATATTCAAGGCCCCGG
GCCGGTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTTCCTCAATAAATATAan>TAan>TAan>TATTAATATTAGAATA
ATTAATAAATATAan>TAan>TAan>TAAATTATAATAAAAATATATTAAAATATAATTTCATAATATT
AATATAan>TAAATTATAATAAAAATATATTAAAATATAATAAATAAATAAATAAATAAATAA
ATTTTTATAATATTAGTATATAAATTATAATAAATTATATAAAATATAan>TAATATAGAAAA
TAACTAAATATAan>TAan>TAan>TATCTAAATTATTTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TATTTATAAGT
AATATAan>TAAATAATAATAATAATAATAAATAATGATAAAAAATAATATAan>TAATTATTATA
TATAan>TA
ATAATCAATACCCATAGGATTATCATATAATAATAAAAATTATTATTAAATACT
AAATACATATTATTTATTCATCCCTTAGCCATGCTTATAGCTTTCCTCAATATAan>TAATAA
TTAATAAATATTAATAAAATATAan>TAATAATTAATAAATATTAATAAAATATAan>TAAATATT
AATAAAATATATCTATCCAATCTATCCTATCTATCATATCTATCCCCAGGGTAAATAATA
AATGTTATTATTAATAATTACCCTGGGCCTATAGAATAACAATAATTAAATATAan>TAATAA
GTAATAATAATTATATAan>TAAATTATATTAATTTATAATATAATATAATATAATATAATAA
ATAATTTTTTTTTAGATAATGAATAAAAAAAATAATTATATATTTAATAAATATATTAAA
TAGTAAAAATAAATATAan>TAATAATAAAAAATATAan>TATTTAATTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAATAT
ATA
TGAAAAAAAAAATATTATATAGATATAan>TAan>TATTTATT
w3c xhtml validator w3c css validator