Yeastract
Please fill in here our
user satisfaction survey
Thank you!
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name Q0144
Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -903 -901 -899 -775 -683 -641 -639 -634 -632 -630 -622 -556 -535 -533 -504 -236 -207 -155 -150 -54 -52 -50
>Q0144    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ACTCCTTTTGAGATTCACACCTATTTTATTAAAAATAGGTATTCACTTAATTAAATTAAA
TTAAATTAAATTAAATTATGGATAATTTATTTAATAAATATAan>TAan>TATTAATTATAAAATA
ATAGTCCGGCCCGCCCCGCGGGGCGGACCCCGAAAGAGTCTGCCCCTTTTTATTTAATAT
TTAATATTTAATATTTAATATTTAATATTTAATATTTAAAGAAGGATATATTTATAATTT
ATCATAATATTATTTAATAAGAAATTATTAATTAATTAATTAATTAATTTATTTATTGTT
TATATTTATTAATATTAATATAATAAAAATGTAAAATACTTAATATTATTAATATTATTA
TATAan>TA
ATATAan>TAan>TAATAATATATTATATTTATATCTCCTTTATTCCTTTTTCCCCCGAT
GGGGACTTATTATATTATATTATTATATATTTCTTCGATAACTTTATATAan>TATTTTATTT
TTATAAAAAAATATTTATATATTATTATTTACAATAATAATTATTAATAGTCCGGCCCGT
CCCGCGGGGGGGAACCGAAGGAGTGCGGGACCCCGTGGGAACCGCATCCCTTTTTATTTT
TAATTAAGAAGGAGTGAGGGACCCCGTGGGGACCGAACCCCGAAGGAGTCTTTTTTCTAT
TTATTAATAATAACTATAAATTATATTTAAAATAATAATTTACTTGTTATAATCTTAATG
TTCCGGGGCCCGGCCACGGGAGCCGGAACCCCGAAAGGAGAAGTATATAAATATTTACTT
GTTATAATTTATTATATATTTATAACCTCCTTCTTAAAATTATCTTTACTTTATAATAAA
AATTAATATAATATAATCTGATAATAATCGAATTTTATTATATTTAATTTAATTAATAAT
AGACAATTATTATTATTATTTTACTTATTAATATTAATTTAGATTTATATAan>TAan>TAAATAT
TATTAATTTTATATTAATTTTTTATTAATTATTTATTTTT
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -26 -46 -48 -50 -117 -201 -203 -232 -314 -498 -500 -527 -529 -531 -550 -552 -560 -565 -605 -611 -616 -626 -628 -635 -637 -695 -769 -893 -895 -897
>Q0144	Upstream Sequence Complementary Strand
TGAGGAAAACTCTAAGTGTGGATAAAATAATTTTTATCCATAAGTGAATTAATTTAATTT
AATTTAATTTAATTTAATACCTATTAAATAAATTATTTATATAan>TAan>TAATTAATATTTTAT
TATCAGGCCGGGCGGGGCGCCCCGCCTGGGGCTTTCTCAGACGGGGAAAAATAAATTATA
AATTATAAATTATAAATTATAAATTATAAATTATAAATTTCTTCCTATATAAATATTAAA
TAGTATTATAATAAATTATTCTTTAATAATTAATTAATTAATTAATTAAATAAATAACAA
ATATAAATAATTATAATTATATTATTTTTACATTTTATGAATTATAATAATTATAATAAT
ATAan>TA
TTATATAan>TATTATTATATAATATAAATATAGAGGAAATAAGGAAAAAGGGGGCTA
CCCCTGAATAATATAATATAATAATATAan>TAAAGAAGCTATTGAAATATAan>TAan>TAAAATAAA
AATATTTTTTTATAAATATAan>TAATAATAAATGTTATTATTAATAATTATCAGGCCGGGCA
GGGCGCCCCCCCTTGGCTTCCTCACGCCCTGGGGCACCCTTGGCGTAGGGAAAAATAAAA
ATTAATTCTTCCTCACTCCCTGGGGCACCCCTGGCTTGGGGCTTCCTCAGAAAAAAGATA
AATAATTATTATTGATATTTAATATAAATTTTATTATTAAATGAACAATATTAGAATTAC
AAGGCCCCGGGCCGGTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTTCCTCTTCATATATTTATAAATGAA
CAATATTAAATAATATAan>TAAATATTGGAGGAAGAATTTTAATAGAAATGAAATATTATTT
TTAATTATATTATATTAGACTATTATTAGCTTAAAATAATATAAATTAAATTAATTATTA
TCTGTTAATAATAATAATAAAATGAATAATTATAATTAAATCTAAATATAan>TAan>TATTTATA
ATAATTAAAATATAATTAAAAAATAATTAATAAATAAAAA
w3c xhtml validator w3c css validator