Yeastract
Please fill in here our
user satisfaction survey
Thank you!
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

Back to top top

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name YNCQ0013W
Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -996 -994 -955 -945 -888 -886 -884 -882 -880 -878 -871 -869 -867 -836 -824 -822 -728 -726 -706 -688 -683 -681 -679 -677 -675 -666 -532 -371 -369 -367 -342 -336 -334 -332 -330 -328 -326 -324 -322 -271 -269 -169 -167 -165 -163 -131 -129 -118 -110 -108 -106 -104 -102 -36 
>YNCQ0013W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ATAAATATAan>TAATTATACTCCTATTTTTATATTAATTAATTAATAATATATGATAATATA
AAAATTATTGAATTATTAACTCTTATTAATAATAATAATAATCATAATAATAATATAan>TAan>T
ATAan>TAan>TAGTATATAan>TAan>TAAAAGTTTTATTATATTATATTATATTATATATTTATTTATAT
ATAATTCTTATTAATTGAAAAAAGAATAATTAATAATCTTATTAAAAAAATAAATACTTT
CATTTTATTTTATTTTATTTAATTTAATTATAATATAan>TAAATATTAAAAAAAGGATATAA
GTTTTTTATAAGATATAATATAan>TAan>TAan>TAan>TATTAAATATAAAGAAGTTAATATTTATATTT
TAATTATAAAATGTTAATACTCCTTTGGGGACTTATTAATTAAATTATTAATTAATAATA
ATTTATGATTTATAAATAATAAATAAAGGAATAAGTATCAATTAATTAATATATTATATT
TAATATTTTATATTTAATATTTAATATTTAATATTTTAAGTTCCGGGGCCCGGCCACGGG
AGCCGGAACCCCGAAAGGAGTAGTATTAATTATGGATAGTGAGGGTGGATTTAATCCTTT
TGTTATGTTATTAATTAATTAATTAATTTATATAan>TAan>TAAAATATTTTAATTAATTTTTAT
ATAAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TATTAATAATAGTCCGGCCCGCCCCGTGGGGCGGACCCC
AAAGGAGTAATATAan>TATTATGTATAAACAATAGAGAATATTGTTTAATGGTAAAACAGTT
GTCTTTTAAGCAACCCATGCTTGGTTCAACTCCAGCTATTCTCATAATATTATATAan>TAan>TA
>TATTTCCCTTTCTAAAAATAATAATAATTATATAan>TAATAATAATATAATTATATAan>TAan>TAan>T
ATATTATAATAATAATAATAATAATAATAATAAATAATAATAATTATTTTTATTAATAAT
ATTAATATATTATAATTATTAATAAATATTAATAAAAATA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -30 -96 -98 -100 -102 -104 -106 -125 -127 -157 -159 -161 -163 -165 -263 -265 -316 -318 -320 -322 -324 -326 -328 -330 -338 -363 -365 -367 -507 -521 -526 -642 -669 -671 -673 -675 -677 -722 -818 -820 -830 -832 -837 -842 -847 -863 -865 -867 -874 -876 -878 -880 -882 -949 -968 -990 
>YNCQ0013W	Upstream Sequence Complementary Strand
TATTTATATATTAATATGAGGATAAAAATATAATTAATTAATTATTATATACTATTATAT
TTTTAATAACTTAATAATTGAGAATAATTATTATTATTATTAGTATTATTATTATATAan>TA
>TATAan>TATCATATAan>TAan>TATTTTCAAAATAATATAATATAATATAATATAan>TAAATAAATATA
>TATTAAGAATAATTAACTTTTTTCTTATTAATTATTAGAATAATTTTTTTATTTATGAAA
GTAAAATAAAATAAAATAAATTAAATTAATATTATATATTTATAATTTTTTTCCTATATT
CAAAAAATATTCTATATTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAATTTATATTTCTTCAATTATAAATATAAA
ATTAATATTTTACAATTATGAGGAAACCCCTGAATAATTAATTTAATAATTAATTATTAT
TAAATACTAAATATTTATTATTTATTTCCTTATTCATAGTTAATTAATTATATAATATAA
ATTATAAAATATAAATTATAAATTATAAATTATAAAATTCAAGGCCCCGGGCCGGTGCCC
TCGGCCTTGGGGCTTTCCTCATCATAATTAATACCTATCACTCCCACCTAAATTAGGAAA
ACAATACAATAATTAATTAATTAATTAAATATAan>TAan>TATTTTATAAAATTAATTAAAAATA
TATTTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAATTATTATCAGGCCGGGCGGGGCACCCCGCCTGGGG
TTTCCTCATTATATAan>TAATACATATTTGTTATCTCTTATAACAAATTACCATTTTGTCAA
CAGAAAATTCGTTGGGTACGAACCAAGTTGAGGTCGATAAGAGTATTATAATATAan>TAan>TAan>T
ATAAAGGGAAAGATTTTTATTATTATTAATATAan>TATTATTATTATATTAATATAan>TAan>TAan>TA
>TATAATATTATTATTATTATTATTATTATTATTTATTATTATTAATAAAAATAATTATTA
TAATTATATAATATTAATAATTATTTATAATTATTTTTAT
w3c xhtml validator w3c css validator