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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name YNCQ0017W
Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -881 -790 -762 -753 -692 -565 -542 -509 -507 -502 -500 -493 -491 -489 -487 -480 -478 -476 -474 -472 -466 -461 -459 -291 -277 -189
>YNCQ0017W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ATGGAGTAATAATAATAATAATAATAAAATAAAGGATCTGTAGCTTAATAGTAAAGTACC
ATTTTGTCATAATGGAGGATGTCAGTGCAAATCTGATTAGATTCGTATATTTATACTTAA
TATA
AAAAAAATAAATAATAATCTTTTTTATTATTATATTTATTAATAATAAATTATTTT
GTTATTATTATTAATTTATATTAATATTTTATATAAATTATTTATTTAATCTTTCATTAT
ATA
TTTAATATATTATTAATATTAATTAATATTTTATAATAAATAAATAAAATAAAATAA
ATATTTTAATATAATACTCCTTCGGGGTTCGGTCCCCCTCCCATTAGTATAGTATAGGGA
GGGGTCCCTCACTCCTTCGGGGTCCCCGCCGGGGCGGGGACTTATTTTTATATTTATTAA
TAATAATTAATTTTTATATAAATTTATTATTTCTTACAATATATTTATTACTATTATTTT
TTAATAATCTTATATAan>TAATATAan>TAAAATATAan>TAan>TAan>TATTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAAATATAA
TATAan>TA
TTATTATAAATATTTATAATCTTATTAATTAATTAGATTATATTATATTATATT
AGATCATATTATATTATATTATATTATATTATATTATTATTATTAATATTTTTATTTTTA
TTTTATATTTAATAGTAAAAAATCATAATTTTATAATTTATTAATTATTATATAATTTCA
TTAATATATTTCTTCTTTTTATTTATTTATTTATTACTTATTAATAGTTCCGGGGCCCGG
CCACGGGAGCCGGAACCCCGAAAGGAAAATAATATAAAAAATAATTATAATTTATTATAA
TTTATTAATTTATTAATTTATTAATTTATTTATTAATTTATTAATTTATTTATTATTATA
TTTTTTTTAATAAAGGAAAATTAACTATAGGTAAAGTGGATTATTTGCTAAGTAATTGAA
TTGTAAATTCTTATGAGTTCGAATCTCATATTTTCCGTAT
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -99 -271 -287 -332 -366 -371 -376 -381 -386 -401 -406 -411 -453 -455 -468 -470 -472 -474 -476 -481 -483 -485 -487 -496 -503 -505 -536 -561 -587 -747 -756 -758 -786 -799 -841 -890
>YNCQ0017W	Upstream Sequence Complementary Strand
TACCTCATTATTATTATTATTATTATTTTATTTCCTAGACATCGAATTATCATTTCATGG
TAAAACAGTATTACCTCCTACAGTCACGTTTAGACTAATCTAAGCATATAAATATGAATT
ATATTTTTTTTATTTATTATTAGAAAAAATAATAATATAAATAATTATTATTTAATAAAA
CAATAATAATAATTAAATATAATTATAAAATATATTTAATAAATAAATTAGAAAGTAATA
TATA
AATTATATAATAATTATAATTAATTATAAAATATTATTTATTTATTTTATTTTATT
TATAAAATTATATTATGAGGAAGCCCCAAGCCAGGGGGAGGGTAATCATATCATATCCCT
CCCCAGGGAGTGAGGAAGCCCCAGGGGCGGCCCCGCCCCTGAATAAAAATATAAATAATT
ATTATTAATTAAAAATATATTTAAATAATAAAGAATGTTATATAAATAATGATAATAAAA
AATTATTAGAATATAan>TATTATATATTTTATATAan>TAan>TAan>TAATATAan>TAan>TAan>TAan>TATTTATATT
ATATAan>TAATAATATTTATAAATATTAGAATAATTAATTAATCTAATATAATATAATATAA
TCTAGTATAATATAATATAATATAATATAATATAATAATAATAATTATAAAAATAAAAAT
AAAATATAAATTATCATTTTTTAGTATTAAAATATTAAATAATTAATAATATATTAAAGT
AATTATATAAAGAAGAAAAATAAATAAATAAATAATGAATAATTATCAAGGCCCCGGGCC
GGTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTTCCTTTTATTATATTTTTTATTAATATTAAATAATATT
AAATAATTAAATAATTAAATAATTAAATAAATAATTAAATAATTAAATAAATAATAATAT
A
AAAAAAATTATTTCCTTTTAATTGATATCCATTTCACCTAATAAACGATTCATTAACTT
AACATTTAAGAATACTCAAGCTTAGAGTATAAAAGGCATA
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