S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

YNCQ0020W

Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -997 -991 -985 -894 -889 -887 -885 -870 -868 -866 -864 -862 -860 -858 -856 -854 -819 -786 -781 -729 -727 -697 -682 -616 -585 -574 -572 -565 -559 -557 -555 -529 -523 -515 -513 -511 -509 -507 -505 -503 -501 -469 -467 -465 -239 -223 -215 -213 -107 -105 -103 -101 -95 -73 -57 -51 -49 -47 -45 -24 -22 -20 -18 -16 -8 -6

>YNCQ0020W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ATAATATAAATATAAATATAATGGGGTTATAGTTAAATTTGGTAGAACGACTGCGTTGCA
TGCATTTAATATGAGTTCAAGTCTCATTAACTCCAATAATTATATTATATAATATAan>TAan>TA
TTAATAAATTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAAATATTAAATAAATATTATATTAATAAAT
AATATAAATTATCTAATCGAAGGAGATATTTATAATATAATATAAATATTTTAATAAATT
AATAAATATTATATTAATAAATAATTAATAAATATAan>TAAATTATAATAAATTTTAATATT
ATTATATAAATTAATTAAATATAATAATTAATGAAATAGAAACTATAATTCAATTGGTTA
GAATAGTATTTTGATAAGGTACAAATATAGGTTCAATCCCTGTTAGTTTCATATTATATA
TCATTAATATAan>TAAAATATAAATATAan>TAan>TATTATAATAATAATAATAATAAATATAAATA
TAATTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAAATAAATAATTATTTAATTTATAATAAATATAan>TAan>TA
GTTCCCGCGAAGCGGGAACCCCATAAGGAGTTTTATTATTAATTATATTTAATAAATATT
AATTATTAATTTTATATTTATAAATAAATTTATTACTCCTTCTTAATTAAGAATAAAAAG
GGATGCGGTTCCCATGGGGTCCCGCACTCCTTCGGGGTCCGCCCCCTCCCCTGCGGGAGG
GGAGCGGACTATTTTATTAAAAATATTATAATTAAATAATAATATAAATAATTTATAATA
TAATAATATAan>TACTTATAAATAATATTTAAATCTTATTATTAATTTATAAATCATAAATT
ATTATTAATAAATATCTCTTTTAGATAAGATAAATTGAACTTATATTTATATTATATAan>TA
>TATAGATATAAATCTTAAATAGAGTAAATATATTATAATAATTATATAAATATAan>TAan>TAan>TA
TTATATTAAGATAATAATATAan>TAan>TAan>TAan>TATTAATATAan>TAA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -2 -10 -12 -14 -16 -18 -34 -39 -41 -43 -45 -53 -67 -97 -99 -101 -103 -108 -114 -209 -383 -412 -461 -463 -497 -499 -501 -503 -505 -507 -509 -511 -549 -551 -553 -568 -579 -581 -693 -723 -746 -828 -850 -852 -854 -856 -858 -860 -862 -864 -866 -879 -881 -883 -890 -895

>YNCQ0020W	Upstream Sequence Complementary Strand
TATTATATTTATATTTATATTACCCCAATATCAATTTAAACCATCTTGCTGACGCAACGT
ACGTAAATTATACTCAAGTTCAGAGTAATTGAGGTTATTAATATAATATATTATATAan>TAan>T
AATTATTTAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TATTTATAATTTATTTATAATATAATTATTTA
TTATATTTAATAGATTAGCTTCCTCTATAAATATTATATTATATTTATAAAATTATTTAA
TTATTTATAATATAATTATTTATTAATTATTTATATATTTAATATTATTTAAAATTATAA
TAATATATTTAATTAATTTATATTATTAATTACTTTATCTTTGATATTAAGTTAACCAAT
CTTATCATAAAACTATTCCATGTTTATATCCAAGTTAGGGACAATCAAAGTATAATATAan>T
AGTAATTATATATTTTATATTTATATAan>TAan>TAATATTATTATTATTATTATTTATATTTAT
ATTAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TATTTATTTATTAATAAATTAAATATTATTTATATAan>TAT
CAAGGGCGCTTCGCCCTTGGGGTATTCCTCAAAATAATAATTAATATAAATTATTTATAA
TTAATAATTAAAATATAAATATTTATTTAAATAATGAGGAAGAATTAATTCTTATTTTTC
CCTACGCCAAGGGTACCCCAGGGCGTGAGGAAGCCCCAGGCGGGGGAGGGGACGCCCTCC
CCTCGCCTGATAAAATAATTTTTATAATATTAATTTATTATTATATTTATTAAATATTAT
ATTATTATATATGAATATTTATTATAAATTTAGAATAATAATTAAATATTTAGTATTTAA
TAATAATTATTTATAGAGAAAATCTATTCTATTTAACTTGAATATAAATATAATATAan>TAan>T
ATATCTATATTTAGAATTTATCTCATTTATATAATATTATTAATATATTTATATAan>TAan>TAan>T
AATATAATTCTATTATTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAATTATATATT