Yeastract
Please fill in here our
user satisfaction survey
Thank you!
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name YNCQ0022W
Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -983 -942 -940 -920 -872 -865 -863 -861 -859 -857 -855 -770 -737 -720 -718 -710 -702 -700 -698 -594 -541 -539 -494 -492 -463 -461 -424 -422 -410 -400 -398 -396 -326 -290 -288 -286 -284 -282 -280 -278 -276 -274 -257 -226 -219 -210 -117
>YNCQ0022W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TTATATTATATTTATTGATATATTTATTGATATTTATTAATTTAAGATTATTCATTAAAT
ATAan>TA
ATTATTAATAATTTAATATATTTTATAATTTTTATTATATTTTATGTAAGAAGAA
ACTATTTTATATATTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAATTTTTATAAAATGATAAATTTTATATTAT
AAATATTATTAAAATATTTTTATAAATATTTAAATTATTTATAAAAAGGTATATAATAAT
AATTATTAATATTATATTATATTATATATTTATTTATATTATATAan>TAATAATATATTTAT
ATAan>TAan>TA
TTAATTAATAAATTAAATAAGTATCTATATTTTATATTATATTATATTATTTT
ATTTTATTAATTCCGGAAGGAGAATAAAAAGTATTCTAAAGAAATTATATATTTATTATT
TTTATTAATATGTTATAAATTAATAAAAAATAAATATGTATATAan>TAAATTATATTTATTA
TGTTTAATTATTTATAATTTATTATAATATAan>TAGTATAAGATATCTTATTTATATTTATA
TATA
ATAAAGAATATTATTAAACTAACACCTATATTATATAan>TATTATATTATATAATATT
ATATAan>TAan>TATTAATTACTAAGAATAAATTTATAATTAGATAATATTTATATTTATTTATT
TATTTAATTAACAAATATATTAATATTTTTAATTAATTAATAATACCTTTATATAan>TAan>TAan>T
ATAan>TAan>TAan>TAan>TA
TTAATTTTAATTATATAATTATCTTTTTTATTAATAATTATAAATATAT
TATATATTTTATATAATAAGATTATAATTTTATAATTATTTTATTTTTTATTAAAAATTA
TTATTATTATAATTATTATATTATAATTATAAATTATTAAAGAATATATTTATTAATATT
TTAATAATTAATATCTTTTATTTATATTTATAAAATAAGGTATAAATATTGATAATAAAG
AGTAAATATTGTATTAATTATAATAATAATTATAATTAAG
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -73 -111 -139 -206 -213 -215 -220 -253 -268 -270 -272 -274 -276 -278 -280 -282 -284 -286 -320 -349 -390 -392 -394 -396 -406 -411 -416 -418 -420 -425 -457 -459 -465 -488 -526 -535 -537 -588 -590 -646 -651 -656 -663 -692 -694 -696 -698 -704 -714 -716 -721 -731 -733 -738 -743 -766 -823 -851 -853 -855 -857 -859 -861 -866 -868 -895 -914 -936 -977 -989 -994
>YNCQ0022W	Upstream Sequence Complementary Strand
AATATAATATAAATAACTATATAAATAACTATAAATAATTAAATTCTAATAAGTAATTTA
TATA
TTAATAATTATTAAATTATATAAAATATTAAAAATAATATAAAATACATTCTTCTT
TGATAAAATATAan>TAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TATTAAAAATATTTTACTATTTAAAATATAATA
TTTATAATAATTTTATAAAAATATTTATAAATTTAATAAATATTTTTCCATATATTATTA
TTAATAATTATAATATAATATAATATAan>TAAATAAATATAATATAan>TATTATTATATAAATA
TATAan>TAan>TA
ATTAATTATTTAATTTATTCATAGATATAAAATATAATATAATATAATAAAA
TAAAATAATTAAGGCCTTCCTCTTATTTTTCATAAGATTTCTTTAATATAan>TAAATAATAA
AAATAATTATACAATATTTAATTATTTTTTATTTATACATATAan>TATTTAATATAAATAAT
ACAAATTAATAAATATTAAATAATATTATATATCATATTCTATAGAATAAATATAAATAT
ATA
TTATTTCTTATAATAATTTGATTGTGGATATAATATAan>TAan>TAATATAATATATTATAA
TATAan>TAan>TAan>TA
ATTAATGATTCTTATTTAAATATTAATCTATTATAAATATAAATAAATAA
ATAAATTAATTGTTTATATAATTATAAAAATTAATTAATTATTATGGAAATATAan>TAan>TAan>TA
>
TATAan>TAan>TAan>TAan>TAATTAAAATTAATATATTAATAGAAAAAATAATTATTAATATTTATATA
ATATAan>TAAAATATATTATTCTAATATTAAAATATTAATAAAATAAAAAATAATTTTTAAT
AATAATAATATTAATAATATAATATTAATATTTAATAATTTCTTATATAAATAATTATAA
AATTATTAATTATAGAAAATAAATATAAATATTTTATTCCATATTTATAACTATTATTTC
TCATTTATAACATAATTAATATTATTATTAATATTAATTC
w3c xhtml validator w3c css validator