Yeastract
Please fill in here our
user satisfaction survey
Thank you!
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

Back to top top

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name AI5_ALPHA
Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -996 -992 -961 -930 -927 -912 -902 -895 -892 -880 -876 -864 -861 -858 -855 -852 -842 -839 -835 -817 -814 -811 -807 -802 -793 -788 -784 -769 -744 -736 -730 -720 -717 -702 -686 -675 -670 -665 -629 -618 -615 -612 -602 -597 -592 -589 -575 -558 -551 -546 -540 -492 -489 -482 -454 -451 -448 -445 -442 -439 -436 -423 -420 -417 -414 -389 -359 -344 -329 -324 -295 -277 -258 -253 -250 -247 -243 -199 -182 -179 -175 -172 -149 -134 -129 -126 -103 -99 -74 -70 -48 -45 -42 -39 -36 -33 -24 
>AI5_ALPHA    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TTATATATTTn>AATACTAAAAATATAACTACATTACTTTTTTAATATATATAACAATATAT
ATATATATATATATTAan>ATTATATAAAATATAATACTCTATATTAAATATTAan>TTTTTATCA
ATATTTn>ATTTATATATATAATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAATCAATATTAan>ATTn>ATTTATATATATA
AGATTAATAan>TTAan>TTTn>AATA>TATTATGAATAATT>TAATTn>AATAAATCTTTAAATATTATCA
TAAAAATATAAATTAAATAATTTCTTATTTATAATAAAGAATAATAan>ATATATATAAATAT
AATAAAGAATGTAAATAATATATATATAATA>TAATA>TAATATAAAAAATATATATATATA
TAAATATATATATAATATATAGATAATAan>ATAan>TTTTTATATAATT>TATTT>TATTAan>TTAAGT
AATAAATAATAAAAAAATCAATATATTAAATAATA>TATTTATATTAGTTCGGTTTAGTTG
GTATTTTGTAATGAGTAAAAAGTAATATATAATAan>TTAAATAATAAGTATTGATATAAGTA
ATAGATATAATAan>ATAan>ATAan>TTAan>TTAan>ATAan>TTTTATATAAATAATAan>TTAan>ATAan>ATATAGATTAT
GAAAGAGAGTATTAATATCATTAAATATATATATATGTTATATAATTTAAATGATTTTAA
TATATATATATATATTA>TATTATAGATTATGATACATTTATATAAATAATATATATATAA
AAATTAATTATACTATTACTTTATAATA>TAATAan>ATAan>TTTn>ATTTATAAAGATATAAAAGAA
TTGTTTAAAGTTATAACTAAAATATTATATAGTATTCATTAATAan>ATTn>AATAan>TTATAAATT
CAACTATTGTTATATTTATAAATAGAATAATA>TATTAan>TTATCCTTTAAGATATAACAATA
ATTn>ATTTAAATTAAATTAAATTAAATTTAATTn>AATTTTTTTTTTTAATGAATATAATAan>AT
AATAan>ATAan>TTAan>TTAAAATTAATATATAAAAAAAAAGTAAAA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -17 -20 -26 -29 -32 -35 -38 -41 -66 -76 -81 -86 -95 -119 -122 -127 -165 -168 -171 -175 -192 -195 -243 -246 -251 -269 -273 -288 -291 -317 -322 -337 -372 -382 -385 -407 -410 -413 -416 -419 -432 -435 -438 -441 -444 -447 -475 -478 -482 -485 -492 -544 -547 -551 -568 -571 -575 -582 -585 -608 -611 -622 -633 -649 -658 -663 -668 -679 -682 -695 -700 -710 -713 -723 -740 -744 -751 -762 -765 -777 -780 -795 -800 -807 -810 -831 -835 -845 -848 -851 -854 -857 -888 -891 -895 -910 -919 -923 -954 -976 
>AI5_ALPHA	Upstream Sequence Complementary Strand
AATATATAAATTATGATTTTTATATTGATGTAATGAAAAAATTATATATATTGTTATATA
TATATATATATATAATTn>AATATATTTTATATTATGAGATATAATTn>TATAan>ATAAAAATAGT
TATAAATAAATATATATATTATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTAGTTATAATTn>AATAAATATATATAT
TCTAATTATAan>ATAAATTATA>TAATACTTATTAAATTAATTan>ATTTAGAAATTTATAan>ATAGT
ATTTTTATATTTAATTn>TATTAAAGAATAAATATTATTTCTTATTATTan>ATATATATTTATA
</span>TTATTTCTTACATTTATTan>ATATATATATTATA>TTATA>TTATATTTTTTATATATATATAT
ATTTATATATATATTATATATCTATTATTan>ATAAAAATATATTAAATAAAATAATAan>ATTCA
TTATTn>TATTan>ATTTTTTTAGTTATATAATTn>TATTan>ATATAAATATAATCAAGCCAAATCAAC
CATAAAACATTACTCATTTTTCATTATATATTATAan>ATTn>TATTan>ATTCATAACTATATTCAT
TATCTATATTATTan>ATTan>ATAan>ATAan>ATTan>ATAAAATATATTTATTan>ATAan>ATTan>ATTan>ATATCTAATA
CTTTCTCTCATAATTan>ATAGTAATTTATATATATATACAATATATTAAATTTACTAAAATT
ATATATATATATATAATA>TAATATCTAATACTATGTAAATATATTTATTan>ATATATATATT
TTTAATTn>AATATGATAATGAAATATTATA>TTATTan>ATAAATAAATATTTCTATATTTTCTT
AACAAATTTCAATATTGATTTTATAan>ATATATCATAAGTAATTATTn>AATTan>ATAan>ATATTTAA
GTTGATAACAATATAAATATTTATCTTATTATA>TAATAan>ATAGGAAATTCTATATTGTTAT
TAATAAATTTAATT>TAATT>TAATTTAAATTAATTAAAAAAAAAAATTACTTATATTATTan>A
TTATTan>ATAan>ATAan>ATTTTAATTan>ATATATTTTTTTTTCATTTT
w3c xhtml validator w3c css validator