Yeastract
Please fill in here our
user satisfaction survey
Thank you!
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

Back to top top

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name AI5_BETA
Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -996 -992 -988 -984 -980 -976 -971 -967 -964 -917 -901 -859 -800 -744 -726 -723 -720 -717 -714 -699 -689 -678 -668 -663 -639 -636 -616 -613 -601 -592 -585 -582 -411 -408 -403 -372 -365 -355 -315 -301 -279 -272 -248 -245 -242 -196 -192 -189 -181 -152 -141 -134 -98 -95 -92 -84 -40 -23 -20 -17 -7 
>AI5_BETA    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ATGATTAATTn>AATTn>AATTn>AATTn>AATTn>AATT>TATTTn>ATTAan>TTTACTTTTTTGATATATATA
GAGGCAAACTCGAGGAAAACCATATAATTAGAATAAGTAATAATTATATGACAACCGTCG
AACTAAATCATATTCAAGAAATTAATATGTAAAAGCGTAGAGATTAGACGCCTCTGGTTA
TCTAAGTAATATATATATATATATTATATGATAACATAAGGTATAATCCAATGAGATCAG
TAATGATTTTAAAACAATAATTTTGTTTTAAGTATTAATAan>ATAan>ATAan>TTAan>ATATTCGACCT
CTTAATTGAGGATATTATAATCATAATTTTTTATATTA>TAATATAAAATTTAACTAGCTA
GATAATAan>TTATATAAAAAAAAAAAATAATAan>TTATATAAATTAATTAAAATAATTTTTATT
AATTGAAACTGAAATGTTTTAAAGTTAAATAAAAGAGCTCTAATCCATGGTGGTTCAATT
AGATTAGCACTACCTATGTTATATGCAATTGCATTCTTATTCTTATTCACAATGGGTGGT
TTAACTGGTGTTGCCTTAGCTAACGCCTCATTAGATGTAGCATTCCACGATATTAan>ATT>TA
ATAAGTGTCGTGCTTAAAATTCACTAAAATAATATATAATAAATTATAATAAATATATAA
AAAAAATAAAAAAAATAAAAAAAAATTAATATCTTATGATTAATTTTATATAAATAAAAA
TTTATTAAATATTATTGGTTATATATATATATATATTAan>ATAan>ATAAAAAAATATATATATA
TATATAGCTAACGGGGAAACTCTTATAATTn>ATTAan>TTTATATAATAAATAAGACAATCCCG
TGATAACTTTAATATATATATATTATATATTAAAGTATTGTAGAGACTAAACGTGAATGA
TTTTAATAan>TTAan>TTTAAATATTAAAATTAAGAGATAGTCCAATCTTATATGTAAATATAAG
TTAATACCAAAAAAAAAATAATAan>TTAan>TTTTGACTTATTAT
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: 0 -13 -16 -19 -43 -71 -77 -80 -88 -91 -127 -134 -145 -170 -174 -185 -188 -227 -235 -238 -241 -265 -268 -272 -283 -308 -311 -322 -331 -344 -348 -353 -358 -365 -368 -396 -404 -548 -578 -588 -593 -597 -606 -609 -612 -629 -632 -656 -661 -682 -707 -710 -713 -716 -719 -722 -793 -808 -852 -855 -893 -897 -960 -972 -976 -980 -984 -988 
>AI5_BETA	Upstream Sequence Complementary Strand
TACTAATTAATTn>AATTn>AATTn>AATTn>AATTAAATAAATAATAAATGAAAAAACTATATATAT
CTCCGTTTGAGCTCCTTTTGGTATATTAATCTTATTCATTATTn>AATATACTGTTGGCAGC
TTGATTTAGTATAAGTTCTTTAATTan>ATACATTTTCGCATCTCTAATCTGCGGAGACCAAT
AGATTCATTATATATATATATATAATATACTATTGTATTCCATATTAGGTTACTCTAGTC
ATTACTAAAATTTTGTTATTAAAACAAAATTCATAATTan>ATTan>ATTan>ATAan>ATTan>ATAAGCTGGA
GAATTAACTCCTATAATATTAGTATTAAAAAATATAATA>TTATATTTTAAATTGATCGAT
CTATTATAan>ATATATTTTTTTTTTTTATTan>ATAan>ATATATTTAATTn>AATT>TTATTAAAAATAA
TTAACTTTGACTTTACAAAATTTCAATTTATTTTCTCGAGATTAGGTACCACCAAGTTAA
TCTAATCGTGATGGATACAATATACGTTAACGTAAGAATAAGAATAAGTGTTACCCACCA
AATTGACCACAACGGAATCGATTGCGGAGTAATCTACATCGTAAGGTGCTATAATTAAAT
TATTCACAGCACGAATTTTAAGTGATTTTATTan>ATATATTATT>TAATA>TTATTn>TATATATT
TTTTTTATTTTTTTTATTTTTTTTTAATTan>ATAGAATACTAATTAAAATATATTTATTTTT
AAATAATTn>TATAan>ATAACCAATATATATATATATATAATTan>ATTan>ATTTTTTTATATATATAT
ATATATCGATTGCCCCTTTGAGAATATTAATAan>ATAAATATATTATTn>TATTCTGTTAGGGC
ACTATTGAAATTATATATATATAATATATAATTTCATAACATCTCTGATTTGCACTTACT
AAAATTATAan>ATAAATTTATAan>ATTTTAATTCTCTATCAGGTTAGAATATACATTTATATTC
AATTATGGTTTTTTTTTTATTan>ATAan>ATAAAACTGAATAATA
w3c xhtml validator w3c css validator