S.cerevisiae - Yeastract

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Standard Name

GDE1

Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -868 -695 -531 -528 -499 -442 -413 -398 -395 -330 -294 -268 -246

>GDE1    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
GGCGATTTACTCGATCAAATGCTTAGTATGGTAAGGTCGCACCATGTTAGAATGGAGTCC
GACTTTGTTTCCGTGGTGGTCGCTATTTTACTTCTAGAGGGTATTGGACGCCAGTTAGAT
CCAAACTTGGACTTATTTGAAAGGTTCGTATTTTACGCATGGATTAACGGTTTTAAAGAA
TAACATCAATTTTTTAAAACCCTTTTCTATTGCTTTTTTTTGCTTTTTATTGCTACTAAA
GAAATTCTTTTACTAACAAAAATACCCACATCTTGTAACTTCTCTTCGTAAACAGTTCGC
TGCCTATATTACGTGAATTCGGGTTTAAGCGGGAAGCCAAAAGTCTCTTGAAAGATGCAA
GCACATTATCAATGCTCAAGATATGGGTTGGTTTAGAAGTGCGTCAATTAATGCATCTCT
CGATGAAGCAAATATACGATCTTGTCAGGACTGATCAATTGTGTCCTAATTATTAan>ATATT
CTTTCTTTTTATGCATCTTTTATAATTGCGACTTCCACGTGTTCGCAGGTGGAGCAATGT
TACACACGCTGTCCCAACATATTAGCTCTCCAAAAAAACGACCAAGTTTATTTAAGTGAC
AAATAATAan>ATTTGCTGTTGCTCTAGCTGAAATTTAGACCAGTGCTGTCATTATCGACTCG
TAGTGTTCTTTTAATAGTAAATTTCGTCAAAACGTTTCTAATTCACTTAATAGCGCCAAC
TGAATAAGAGAATTATTTTTAGAACGTGCACATTATATTAAAAAGAGAGCGTTGGCTGAC
AGAAGTAAAAAATAAATTATTGTCTTACAAAGTGAGACTATTAAAGAGTTTAAGTTTTGC
AATTAGTGCTTCATTGAACAATAAGGCAACGGTAGCAAAAAATTTAAACCCAACTAAGAA
GGGAACCCTCATCAAATTACACAAAAATAGCCACTATCTCCAACTAAGGTGACAAACTAC
TGAAACTGTAAGGTCTTTATATAATCAAACAATATAATCA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -176 -200 -205 -239 -264 -391 -394 -521 -524 -527 -565 -589

>GDE1	Upstream Sequence Complementary Strand
CCGCTAAATGAGCTAGTTTACGAATCATACCATTCCAGCGTGGTACAATCTTACCTCAGG
CTGAAACAAAGGCACCACCAGCGATAAAATGAAGATCTCCCATAACCTGCGGTCAATCTA
GGTTTGAACCTGAATAAACTTTCCAAGCATAAAATGCGTACCTAATTGCCAAAATTTCTT
ATTGTAGTTAAAAAATTTTGGGAAAAGATAACGAAAAAAAACGAAAAATAACGATGATTT
CTTTAAGAAAATGATTGTTTTTATGGGTGTAGAACATTGAAGAGAAGCATTTGTCAAGCG
ACGGATATAATGCACTTAAGCCCAAATTCGCCCTTCGGTTTTCAGAGAACTTTCTACGTT
CGTGTAATAGTTACGAGTTCTATACCCAACCAAATCTTCACGCAGTTAATTACGTAGAGA
GCTACTTCGTTTATATGCTAGAACAGTCCTGACTAGTTAACACAGGATTAATAan>ATTan>ATAA
GAAAGAAAAATACGTAGAAAATATTAACGCTGAAGGTGCACAAGCGTCCACCTCGTTACA
ATGTGTGCGACAGGGTTGTATAATCGAGAGGTTTTTTTGCTGGTTCAAATAAATTCACTG
TTTATTan>ATTAAACGACAACGAGATCGACTTTAAATCTGGTCACGACAGTAATAGCTGAGC
ATCACAAGAAAATTATCATTTAAAGCAGTTTTGCAAAGATTAAGTGAATTATCGCGGTTG
ACTTATTCTCTTAATAAAAATCTTGCACGTGTAATATAATTTTTCTCTCGCAACCGACTG
TCTTCATTTTTTATT>TAATAACAGAATGTTTCACTCTGATAATTTCTCAAATTCAAAACG
TTAATCACGAAGTAACTTGTTATTCCGTTGCCATCGTTTTTTAAATTTGGGTTGATTCTT
CCCTTGGGAGTAGTTTAATGTGTTTTTATCGGTGATAGAGGTTGATTCCACTGTTTGATG
ACTTTGACATTCCAGAAATATATTAGTTTGTTATATTAGT