S.cerevisiae - Yeastract

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Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

LOC1

Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -835 -781 -778 -649 -632 -612 -584 -578 -564 -455 -185 -145 -138

>LOC1    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
GGCCTGTTTACGAAATGGCAAATGATATACCATTATTGTTATATGATTGTAAATTTCCTG
AAATGGATTGGCAAGAACCTACTGTAGATGACTATAAGGCAATAAAATTCACGACAGCTA
CTGAAGCATTGACGTTACACTACGAACTTAAGGCCGCAGTATGCAATATTTTTAAAGATG
TTTTGCCCACAGCAAATACAAACAACTTCTCAAAGACAATTATTAan>ATTTGGGCGATGGAA
GAGGTAAAGTAGTCGGTACCTATGTGAAACTAGAGGATAGAAGCGTTATGGAACCTGTCG
AAGTTGTTAATGCTAAATACTCCAAGAAAAAGAACAACAAAAATAAGTAAAATAATATAT
AAACCTGTATAATATAACCTTGAAGACTATATTTCTTTTCATCACGTGCTATAAAAATAA
TTATAATTTAAATTTTTTAATATAAATATATAAATTAAAAATAGAAAGTAAAAAAAGAAA
TTAAAGAAAAAATAGTTTTTGTTTTCCGAAGATGTAAAATAGGTTGAAAGTTAGAAATTA
GTATTATAATAGCAAAAAAAATTTAAAGTTAGAAATTAGAATTTAAGGCTCTACACACGT
TTACGATGATATTGGACGACCGACACGAAAAGACAGTTTTAGGCTTTCTTTTGTCTTGCT
CTTGCGTTGAAAGTACGTAATTTCCATTCGATTACTTACTCAACACTTGATATAGAGACC
AACTATAAAATAAACTGTTTGGGAAGGAAAGCAGAACTCTTGTAATTACCTCATCTCATT
ATCAAGAAGCAAAATTTTAACTATGTATTTTGACCTTATTTTTGTACTCCACTTTTTTTT
TTTAGTTTTTTTTAGTTATTTTTTAATTTTGAAGTAACGGCGATGAGGTGAAGTTTTTTT
TAAACTGAAAAAGAAGATCGAATGCAAACCATAAATTAGAGATCTAATTGAGGTAAAATT
ATAAGGTTAGATATCTGTAAATCTATACAATTAAGGAAAG

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -6 -38 -267 -453 -516 -542 -551 -557 -576 -580 -625 -642 -645 -654 -774 -777

>LOC1	Upstream Sequence Complementary Strand
CCGGACAAATGCTTTACCGTTTACTATATGGTAATAACAATATACTAACATTTAAAGGAC
TTTACCTAACCGTTCTTGGATGACATCTACTGATATTCCGTTATTTTAAGTGCTGTCGAT
GACTTCGTAACTGCAATGTGATGCTTGAATTCCGGCGTCATACGTTATAAAAATTTCTAC
AAAACGGGTGTCGTTTATGTTTGTTGAAGAGTTTCTGTTAATAan>ATTAAACCCGCTACCTT
CTCCATTTCATCAGCCATGGATACACTTTGATCTCCTATCTTCGCAATACCTTGGACAGC
TTCAACAATTACGATTTATGAGGTTCTTTTTCTTGTTGTTTTTATTCATTTTATTan>ATATA
TTTGGACATATTATATTGGAACTTCTGATATAAAGAAAAGTAGTGCACGATATTTTTATT
AATATTAAATTTAAAAAATTATATTTATATATTTAATTTTTATCTTTCATTTTTTTCTTT
AATTTCTTTTTTATCAAAAACAAAAGGCTTCTACATTTTATCCAACTTTCAATCTTTAAT
CATAATATTATCGTTTTTTTTAAATTTCAATCTTTAATCTTAAATTCCGAGATGTGTGCA
AATGCTACTATAACCTGCTGGCTGTGCTTTTCTGTCAAAATCCGAAAGAAAACAGAACGA
GAACGCAACTTTCATGCATTAAAGGTAAGCTAATGAATGAGTTGTGAACTATATCTCTGG
TTGATATTTTATTTGACAAACCCTTCCTTTCGTCTTGAGAACATTAATGGAGTAGAGTAA
TAGTTCTTCGTTTTAAAATTGATACATAAAACTGGAATAAAAACATGAGGTGAAAAAAAA
AAATCAAAAAAAATCAATAAAAAATTAAAACTTCATTGCCGCTACTCCACTTCAAAAAAA
ATTTGACTTTTTCTTCTAGCTTACGTTTGGTATTTAATCTCTAGATTAACTCCATTTTAA
TATTCCAATCTATAGACATTTAGATATGTTAATTCCTTTC