S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

Q0143

Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -997 -975 -970 -964 -955 -952 -948 -944 -931 -927 -922 -919 -916 -911 -852 -847 -844 -835 -831 -818 -794 -747 -743 -740 -737 -732 -729 -725 -686 -680 -677 -672 -665 -662 -655 -635 -630 -623 -620 -599 -590 -455 -435 -432 -428 -416 -413 -410 -384 -357 -338 -331 -310 -299 -279 -276 -270 -263 -260 -257 -253 -249 -242 -238 -153 -147 -116 -113 -110 -107 -104 -101 -98 -95 -92 -70 -66 -62 -57 -34 -12

>Q0143    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
CATATAATTATATAAAAATAAAATTATAATT>TATTTATATTAAAAATATTAan>ATTn>AATTn>AA
TTTTTTTATATAATTn>ATTA>TAATAan>ATAan>ATT>TAATTAAAAATAAATATCAAATAAAATTAT
AAATTAATCCTACTTTTGGATCCTATTTATATTT>TATTAan>TTATAAATAATTn>ATTATTGAT
AGTTAATTAAATAAAAATATATATATATATTACTCCTTCGGGGTCCGCCCCGCAGGGGGC
GGGCCGGACTATTATAATTn>ATTAan>TTAan>ATA>TATTAan>ATTn>ATTAAATTATATAAACCGCCCCC
GCGGGGGCGGTTAGTTATTTATATTAan>ATA>TATTTTATATTAan>ATATATAATACTCTTTTTT
CTATTATATTT>TAATATATAATAan>TTAAAAAAAATAAATAAAATAATATTCTTAATTTTTA
TTCTTTATCTTCTTTAACCAAACTCCTTCGGGGTTCGGTCCCCCTCCCATTAGGTTAGGG
AGGGGGTCCCTCACTCCTTCGGGGTCCGCCCCCCCCCGCGGGGGCGGGCCGGACTATTTT
AAATTTTAATTTAAATTTTATAAATATAATAan>TTTn>AATTATAAATTTAATAan>ATAan>ATATATA
AAAAATATATATATGGTTAATATATATAAAGATTATAATCTTTTTATTAAATAAAGGAAA
ATTTATTATATAATTTTTCTCTATAGTTATATATTTAAAACTTATTTTTTTTTTTTTATA
AATAATAan>ATTATAATAAATAATAan>TTAan>ATTn>ATTTn>ATTATATAATTn>AATTGGCCCCCATGCT
GGGTTCCGGAACTCCTCCTTCTCGCGAGGTTAACACCTATTATATAACTATAACTATAAC
TATAACTATAATTATAATTATAACTATAACTATAAATATTCATTTTAATAan>ATAan>ATAan>ATAan>A
TAATAan>ATAan>TTAan>ATATAAATAGTCGAAGAATATATTTn>ATTTn>ATTT>TAATATAAATAAAAAG
TTTCAATTAATTTGAATTTGGAATTAAATTATTACTTCAT

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -8 -13 -30 -44 -50 -85 -88 -91 -94 -97 -100 -103 -106 -109 -121 -139 -145 -177 -234 -242 -249 -253 -256 -259 -263 -268 -272 -275 -331 -346 -350 -377 -392 -403 -406 -409 -420 -428 -433 -592 -595 -600 -604 -613 -616 -623 -633 -655 -658 -670 -673 -713 -718 -721 -725 -730 -733 -736 -739 -745 -800 -806 -810 -824 -827 -831 -837 -840 -873 -880 -886 -893 -897 -903 -912 -915 -920 -923 -940 -944 -948 -951 -957 -973 -979 -989

>Q0143	Upstream Sequence Complementary Strand
GTATATTAATATATTTTTATTTTAATATTAAATAAATATAATTTTTATAan>ATTn>AATTn>AATT
AAAAAAATATATTAATAan>ATA>TTATTan>ATTAAATTAATTTTTATTn>TATAGTTTATTTTAATA
TTTAATTAGGATGAAAACCTAGGATAAATATAAAATAATAan>ATATTTATTn>AATAan>ATAACTA
TCAATTAATTn>TATTTTTATATATATATATAATGAGGAAGCCCCAGGCGGGGCGTCCCCCG
CCCGGCCTGATAATATTAATAan>ATAan>ATTan>ATA>TAATTn>AATAan>ATT>TAATATATTTGGCGGGGG
CGCCCCCGCCAATCAATAAATATAATTan>ATATAAAATATAATTan>ATATATTATGAGAAAAAA
GATAATATAAAATTATATATTATAan>ATTTTTTTTATTn>TATT>TTATTan>ATAAGAATTAAAAAT
AAGAAATAGAAGAAATTGGTTTGAGGAAGCCCCAAGCCAGGGGGAGGGTAATCCAATCCC
TCCCCCAGGGAGTGAGGAAGCCCCAGGCGGGGGGGGGCGCCCCCGCCCGGCCTGATAAAA
TTTAAAATTAAATTTAAAATATTTATA>TTATAAATTAATATTTAAATTATTan>ATTan>ATATAT
TTTTTATATATATACCAATTATATATATTTCTAATATTAGAAAAATAATTn>TATTTCCTTT
TAAATAATATATTAAAAAGAGATATCAATATATAAATTTTGAATAAAAAAAAAAAAATAT
TTATTan>ATTn>AATA>TTATTn>TATTan>ATAan>ATTn>AATAAATAATATATTAATTAACCGGGGGTACGA
CCCAAGGCCTTGAGGAGGAAGAGCGCTCCAATTGTGGATAATATATTGATATTGATATTG
ATATTGATATTAATATTAATATTGATATTGATATTTATAAGTAAAATTATTan>ATTan>ATTan>ATT
>ATTan>ATTan>ATAan>ATTan>ATATTTATCAGCTTCTTATATAAATAAATAAAATTATATTTATTTTTC
AAAGTTAATTAAACTTAAACCTTAATT>TAATAATGAAGTA