Yeastract
Please fill in here our
user satisfaction survey
Thank you!
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name SLX4
Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -792 -766 -663 -649 -646 -642 -627 -622 -540 -417 -378 -367 -337 -165 -126 -57 -37 -34 -6
>SLX4    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AGTTGACTCAAGACAAGGACTTCCAAGACAACTCTAAGATTAGAATGATTGAAGTTATGT
TGCCAGTCTTTGATGCTCCACAAAACTTGGTTAAACAAGCTCAATTGACTGCCGCTACTA
ACGCTAAACAATAAGCTAATTAACATAAAACTCATGATTCAACGTTTGTGTATTTTTTTA
CTTTTGAAGGTTATAGATGTTTAGGTAAATAATTGGCATAGATATAGTTTTAGTATAATA
AATTTCTGATTTGGTTTAAAATATCAACTATTTTTTTTCACATATGTTCTTGTAATTACT
TTTCTGTCCTGTCTTCCAGGTTAAAGATTAGCTTCTAATATTTTAGGTGGTTTATTAan>TTT
AATT
TTATGCTGATTAATT>TATTTACTTTCGTATTCGGTTTTGTACCTTTAGCTATGATC
TTAGCTAATTGAAGAGGGTGGTGTGATCTTTAACCATACCTTATTATCTTTCAGCTGCTT
ACCATTTTCTTATATTGATTTTTAGCGAAAGATTTTTATTCACAAGCTTTTTTTATCCTT
AATGCTCGAATACTACAACAAAACAAAAAACATTAAACAGTTTTTAATTTTGTGAACAAA
CTGAATTACAAGGCCTTACATCTTATTTAGAATATATTAAGAAACAGAGGCCAACATGCC
TTCTTAATTATATTGATATGGACCTCTGTCCTTCCTAAAAACGGGTTTTTGTTCGATGAA
AAATCACCAGTAGAGCACCATATATGAATTTACAATCATTGTAGGGAAAAGAAAACTTGT
TCTGCTTCGCCAATTGATTTCATTTCTTTTTTTCCTTTGTTTTTGTTGTATACTATTAAT
A
TGCGTAGTTCTTTGTCACTTAGTGGTTTTTTGTTTAATTTATAACGCGAAAGCTGCATA
CTAAAAATATAGAGATGAATGGAACTCCGAACAAGCAAGAGAGATATTATCTATCTCTGT
TCCATAATAan>ATAACCAGTAGTTCAGTTGGGGAACTTAATA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -27 -30 -50 -90 -158 -161 -329 -360 -533 -642 -659 -736 -759 -788 -857
>SLX4	Upstream Sequence Complementary Strand
TCAACTGAGTTCTGTTCCTGAAGGTTCTGTTGAGATTCTAATCTTACTAACTTCAATACA
ACGGTCAGAAACTACGAGGTGTTTTGAACCAATTTGTTCGAGTTAACTGACGGCGATGAT
TGCGATTTGTTATTCGATTAATTGTATTTTGAGTACTAAGTTGCAAACACATAAAAAAAT
GAAAACTTCCAATATCTACAAATCCATTTATTAACCGTATCTATATCAAAATCATATTAT
T
TAAAGACTAAACCAAATTTTATAGTTGATAAAAAAAAGTGTATACAAGAACATTAATGA
AAAGACAGGACAGAAGGTCCAATTTCTAATCGAAGATTATAAAATCCACCAAATAATAAA
TTAAAATACGACTAATTAAATAAATGAAAGCATAAGCCAAAACATGGAAATCGATACTAG
AATCGATTAACTTCTCCCACCACACTAGAAATTGGTATGGAATAATAGAAAGTCGACGAA
TGGTAAAAGAATATAACTAAAAATCGCTTTCTAAAAATAAGTGTTCGAAAAAAATAGGAA
TTACGAGCTTATGATGTTGTTTTGTTTTTTGTAATTTGTCAAAAATTAAAACACTTGTTT
GACTTAATGTTCCGGAATGTAGAATAAATCTTATATAATTCTTTGTCTCCGGTTGTACGG
AAGAATTAATATAACTATACCTGGAGACAGGAAGGATTTTTGCCCAAAAACAAGCTACTT
TTTAGTGGTCATCTCGTGGTATATACTTAAATGTTAGTAACATCCCTTTTCTTTTGAACA
AGACGAAGCGGTTAACTAAAGTAAAGAAAAAAAGGAAACAAAAACAACATATGATAATTan>A
TA
CGCATCAAGAAACAGTGAATCACCAAAAAACAAATTAAATATTGCGCTTTCGACGTAT
GATTTTTATATCTCTACTTACCTTGAGGCTTGTTCGTTCTCTCTATAATAGATAGAGACA
AGGTATTATTan>ATTGGTCATCAAGTCAACCCCTTGAATTAT
w3c xhtml validator w3c css validator