S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

YNCQ0005W

Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -997 -994 -991 -988 -985 -982 -963 -928 -918 -915 -911 -908 -905 -896 -892 -889 -869 -861 -858 -854 -851 -844 -820 -811 -807 -792 -769 -766 -763 -760 -757 -754 -751 -748 -743 -740 -683 -680 -676 -662 -655 -644 -640 -635 -632 -609 -604 -591 -581 -554 -530 -527 -524 -520 -514 -510 -502 -498 -493 -490 -433 -430 -422 -415 -408 -405 -398 -393 -390 -381 -359 -351 -348 -345 -342 -339 -335 -330 -327 -322 -309 -303 -300 -294 -291 -284 -277 -274 -270 -267 -264 -261 -256 -185 -162 -159 -156 -148 -145 -140 -125 -112 -107 -56 -52 -49 -43 -37 -34 -31 -25 -19

>YNCQ0005W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TTTATATTAan>TTAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATTTATAAATATTGTTATAATAAACATTTATATAAATAA
ATATAAATTACCATAATAAGATATATTAan>TTTn>ATTAan>ATAan>ATAAAAATATTTn>ATTAan>ATAAAT
AAGAAATATATATATTATGATAATAan>TTTn>ATTAan>ATAAATAATAAATTCTTTATATATAAAT
ATATTAAATATATTTn>AATTGAACACAATATAATTTTTATTGTATTATTCATTTAATAan>ATA
>TTAan>ATAan>TTAan>ATAan>TTAan>ATA>TAATAan>TTAGTGAACATCTCCTTTCGGGGTTCCGGCTCCCGTG
GCCGGGCCCCGGAACTATTAATAan>TTTn>AATAAAATATATATAATTTATAATTTTCATATAA
TTn>AATA>TAATAan>ATTAGGTTTATAAATAAATTATAATA>TATTATAACAATATAATAAAATA
TATTATAAATCTATCTATCTATCTATATAATATATAAATTTATATATACATTAATAan>ATAan>T
TTn>AATTATAATTn>ATTTAAATATTTn>AATT>TATTAan>ATATTCCCCGCGGGCGCCAATCCGGTT
GTTCACCGGATTGGTCCCGCGGGGTTTATATTAan>TTTAAATATTAAATATTAAATAATAan>AT
TTATATTA>TATTAan>ATAAATATAATAAATTAAAAATATATGATTAATTATATAATAan>ATAan>AT
AATAan>ATTn>ATTT>TAATAan>TTA>TAATTTATAAAATTAATTATATTAan>ATTATATTAan>ATTCTTAT
TATATAATAan>ATTn>ATTAan>ATAan>ATAan>ATT>TATTTTAAGAAAGGAGTGAGGGACCCCCTCCCGTT
AGGGAGGGGGACCGAACCCCGAAGGAGAAAATAAATTAATAAAAGTTTAAAAGTTCTTAT
ATTAan>ATAan>ATTATATAATAan>TTA>TATTAAAGATTTTTATAATATATATATATAATA>TATTTA
TAGTTCCGGGGCCCGGCCACGGGAGCCGGAACCCCGAAAGGAGTTTATTTn>AATAan>TTTATA
TTTATATTAan>ATAan>TTTATATTTATATTTATATTCCTCTTAA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -27 -30 -45 -105 -118 -133 -138 -141 -148 -152 -155 -178 -181 -186 -257 -260 -263 -266 -270 -277 -287 -292 -296 -301 -305 -320 -323 -331 -335 -338 -341 -344 -351 -363 -369 -374 -379 -383 -386 -391 -401 -404 -408 -411 -415 -418 -426 -483 -486 -498 -506 -512 -520 -523 -547 -574 -579 -584 -597 -602 -607 -612 -628 -633 -636 -664 -669 -676 -679 -736 -741 -744 -747 -750 -753 -756 -759 -762 -773 -809 -813 -818 -837 -840 -844 -847 -854 -862 -871 -878 -882 -885 -892 -898 -901 -904 -911 -921 -936 -940 -956 -967 -978 -981 -984 -987 -990

>YNCQ0005W	Upstream Sequence Complementary Strand
AAATATAATAan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTAAATATTTATAACAATATTATTTGTAAATATATTTATT
TATATTTAATGGTATTATTCTATATAATAAATAATTan>ATTan>ATTTTTATAAATAATTan>ATTn>TA
TTCTTTATATATATAATACTATTATAAATAATTan>ATTn>TATTan>ATTTAAGAAATATATATTTA
TA>TAATTn>TATATAAATTAACTTGTGTTATATTAAAAATAACATAATAAGTAAATTATTan>AT
AATTan>ATAan>ATTan>ATAan>ATTan>ATA>TTATAATCACTTGTAGAGGAAAGCCCCAAGGCCGAGGGCAC
CGGCCCGGGGCCTTGATAATTan>ATAAATTATT>TTATATATATTAAATATTAAAAGTATATT
AATTan>ATA>TTATTAATCCAAATATTTATT>TAATA>TTATA>TAATATTGTTATATTATT>TTAT
A>TAATATTTAGATAGATAGATAGATATATTATATATTTAAATATATATGTAATTATTan>ATA
AATTAATATTAATAAATTTATAAATTAAATAATTan>ATAAGGGGCGCCCGCGGTTAGGCCAA
CAAGTGGCCTAACCAGGGCGCCCCAAATATAATAAATTTATAan>ATTn>TATAan>ATTn>TATTan>ATTA
AATATAATA>TAATTan>ATTn>TATA>TTATT>TAATTTTTATATACTAATTAATATATTATTan>ATTan>A
TTATTn>AATAAAATTATAan>ATATTAAATATTTTAATTn>AATA>TAATTn>AATA>TAATTAAGAATA
ATATATTATTn>AATAan>ATTan>ATTan>ATTAAATAAAATTCTTTCCTCACTCCCTGGGGGAGGGCAA
TCCCTCCCCCTGGCTTGGGGCTTCCTCTTTTATT>TAATTan>ATTTTCAAATTTTCAAGAATA
TAATTan>ATTn>AATATATTATAan>ATA>TAATTTCTAAAAATATTATATATATATATTATATAAAT
ATCAAGGCCCCGGGCCGGTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTTCCTCAAATAAATTATAAATAT
AAATATAATTan>ATAAATATAAATATAAATATAAGGAGAATT