S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

YNCQ0010W

Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -990 -987 -982 -977 -974 -955 -950 -939 -908 -905 -888 -884 -880 -876 -872 -868 -847 -832 -823 -820 -801 -792 -789 -778 -763 -752 -727 -722 -702 -697 -689 -669 -663 -646 -637 -628 -625 -622 -619 -616 -610 -593 -589 -583 -565 -553 -537 -534 -520 -501 -492 -489 -486 -482 -474 -468 -456 -440 -437 -434 -421 -416 -413 -410 -350 -345 -342 -335 -331 -328 -279 -276 -273 -253 -250 -237 -232 -226 -216 -141 -135 -132 -126 -123 -120 -117 -114 -111 -107 -102 -97 -92 -88 -82 -75 -72 -69 -66 -62 -55 -51 -42 -33 -30 -21 -6

>YNCQ0010W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
GCCGGACTATTTATTAan>TTA>TAATA>TAATAan>TTTAATCAATAGATTTATAATT>TATTTAATG
AATATTTTATAAATATATAAAACAATTCCTTTTTATTAan>TTATAAATTTTTCATTATTTn>AT
TTn>ATTTn>ATTTn>ATTTn>ATTTATTCAATATATAAAAATAATTATAAAAAGATTATTAAAAATA
ATAan>ATTTAATGATAAATATATATTATATATATTAan>ATATAAAAATAATAAATATAAATATA
TTATGTAAATATTATATAAATTTGTATATGTATATATTA>TAATAATGTTATATAAGTAAT
AATA>TAATAAAATATTTTATGTAATTTATATATATTTATAATTATAAAATAAAAATATTA
TAAATAATAAAATTAATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATTTTAATAAAATAAATTATATATTTn>AATTTTA
TTATGAAGTTTATACTTAATATAAATTATATTTCCTTTATAAATTATTAan>ATATATCCTTT
TTAATTAAATAAAATAAAAATATTATAAATATTAan>ATAan>ATTn>AATTTTTTATTTATATTTAT
ATATATATTAAAGATTAAATATATTAan>TTAan>ATACTAATTTATAATT>TATTAan>TTAan>ATAAATA
GTCCGGCCCGCCCCCTGCGGGGCGGACCCCGAAGGAGTTCGACTTAAATTATAATT>TAAT
AATTTTTATTTn>ATTAan>ATAGTTTCGGGGCCCGGCCACGGGAGTCGGAACCCCGAAAGGAGT
TTTATTAan>TTAan>ATATAAAAAGAGTAAGGATAATAan>ATAAATTCTTTTAATT>TATTTTTAATA
AAATATAATTTTAAAATAGTTTTTATAGTCCGGCCCGCCCCGCGGGGGGGGGCGGACCCC
GAAGGAGTTCGGTCTGGCATTAATTATAATAan>ATTATATTAan>ATAan>TTAan>TTAan>TTAan>TTTn>ATTA>T
ATTA>TAATA>TATTTn>ATTTATATTTTATAATAan>TTAan>ATAan>ATTn>ATTTTATATTTn>AATAAATAT
AATATATATATTAan>TTTTTTTTAATAACTATCTAATTAATA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -2 -14 -26 -35 -40 -44 -58 -62 -65 -68 -90 -95 -100 -107 -110 -113 -116 -119 -124 -128 -133 -214 -219 -243 -246 -266 -269 -272 -324 -338 -348 -403 -406 -409 -430 -433 -438 -449 -478 -482 -485 -488 -494 -497 -503 -508 -512 -527 -530 -533 -551 -558 -576 -593 -598 -603 -612 -615 -618 -621 -624 -630 -633 -639 -642 -648 -655 -685 -690 -695 -698 -715 -720 -745 -748 -756 -761 -767 -771 -774 -782 -785 -794 -801 -816 -819 -825 -839 -843 -898 -901 -924 -970 -975 -980 -983

>YNCQ0010W	Upstream Sequence Complementary Strand
CGGCCTGATAAATAATAan>ATA>TTATA>TTATAAATTAGTTATCTAAATATTAAATAAATTAC
TTATAAAATATTTATATATTTTGTTAAGGAAAAATAATAan>ATATTTAAAAAGTAATAAATA
AATAAATAAATAAATAAATAAGTTATATATTTTTATTn>AATATTTTTCTAATAATTTTTAT
TATTAAATTACTATTTATATATAATATATATAATTan>ATATTTTTATTan>ATTn>TATATTTATA>T
AATACATTTATAan>ATATATTTAAACATATACATATATAATA>TTATTACAATATATTCATTA
TTATA>TTATT>TTATAAAATACATTAAATATATATAAATATTAATATTTTATTTTTATAan>AT
ATTTATTan>ATTTTAATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTAAAATTATT>TTATT>TAATATATAAATTAAAAT
AATACTTCAAATATGAATTATATTTAATATAAAGGAAATATTTAATAan>ATTan>ATATAGGAAA
AATTAATTn>TATT>TTATTTTTATAan>ATATTTATAan>ATTan>ATTn>AATTAAAAAATAAATATAAATA
TATATATAATTTCTAATTTATA>TAATAan>ATTATGATTAAATATTAAATAATAan>ATTan>ATTTAT
CAGGCCGGGCGGGGGACGCCCCGCCTGGGGCTTCCTCAAGCTGAATTTAATATTAAATTA
TTAAAAATAAATAATTATCAAAGCCCCGGGCCGGTGCCCTCAGCCTTGGGGCTTTCCTCA
AAATAATAan>ATTan>ATATTTTTCTCATTCCTATTATTan>ATTTAAGAAAATTAAATAAAAATTAT
T>TTATATTAAAATTTTATCAAAAATATCAGGCCGGGCGGGGCGCCCCCCCCCGCCTGGGG
CTTCCTCAAGCCAGACCGTAATTAATA>TTATTn>AATA>TAATTan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAAATAATA
</span>TAATA>TTATATAAATAAATATAAAATATTATAan>ATTan>ATTn>AATAAAATATAAATTATTn>TATA
</span>TTATATATATAATAAAAAAAATTATTGATAGATTAATTAT