S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

YNCQ0012W

Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -999 -996 -987 -972 -874 -865 -779 -774 -765 -762 -744 -724 -721 -717 -713 -710 -700 -680 -670 -667 -664 -661 -658 -649 -646 -643 -608 -603 -598 -593 -586 -582 -572 -565 -562 -547 -543 -534 -508 -503 -498 -494 -489 -483 -472 -438 -425 -407 -404 -398 -393 -379 -360 -357 -348 -345 -341 -338 -335 -317 -291 -287 -282 -277 -273 -270 -263 -259 -256 -252 -249 -245 -242 -187 -145 -142 -138 -134 -130 -112 -107 -103 -72 -69 -66 -19

>YNCQ0012W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TATATTAan>TTTTTTTTAATAACTATCTAATTAATAGCTATTTTGGTGGAATTGGTAGACAC
GATACTCTTAAGATGTATTACTTTACAGTATGAAGGTTCAAGTCCTTTAAATAGCAATAA
ATATATATAATATATATAATATATATAAATGAGTCGTAGACTAATAGGTAAGTTACCAAA
ATTTGAGTTTGGAGTTTGTTTGTTCGAATCAAACCGATTCAATATTA>TAATATATATATT
ATTTATATATAAATATATAATTATACTCCTATTTTTATATTAan>ATTn>AATTn>AATAan>ATATATG
ATAATATAAAAATTATTGAATTATTAACTCTTATTAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAATCATAATAan>ATA
>ATATATATATATATAGTATATATATAAAAGTTTTATTA>TATTA>TATTA>TATTATATATTT
ATTTATATATAATTCTTATTAan>ATTGAAAAAAGAATAATTn>AATAATCTTATTAAAAAAATA
AATACTTTCATTTTATTT>TATTT>TATTTn>AATT>TAATTATAATATATAAATATTAAAAAAA
GGATATAAGTTTTTTATAAGATATAATATATATATATATTAAATATAAAGAAGTTAATAan>T
TTATATTT>TAATTATAAAATGTTAATACTCCTTTGGGGACTTATTAan>ATTAAATTATTAan>AT
TAATAan>ATAan>ATTTATGATTTATAAATAATAAATAAAGGAATAAGTATCAATTAATTn>AATA>T
ATTA>TATTTn>AATAan>TTTTATATTTn>AATAan>TTTn>AATAan>TTTn>AATAan>TTTTAAGTTCCGGGGCCCG
GCCACGGGAGCCGGAACCCCGAAAGGAGTAGTATTAATTATGGATAGTGAGGGTGGATTT
AATCCTTTTGTTATGTTATTAan>ATTn>AATTn>AATTn>AATTTATATATATAAAATATTT>TAATTn>A
ATTTTTATATAAATATATATATATATATATATTAan>ATAan>ATAGTCCGGCCCGCCCCGTGGGG
CGGACCCCAAAGGAGTAATATATATTATGTATAAACAATA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -12 -19 -62 -65 -84 -99 -108 -126 -130 -134 -138 -179 -183 -238 -245 -252 -266 -275 -280 -283 -287 -306 -310 -313 -331 -334 -337 -341 -344 -349 -353 -385 -400 -414 -418 -431 -465 -468 -476 -481 -519 -527 -536 -539 -558 -586 -591 -596 -601 -636 -639 -642 -651 -654 -657 -660 -663 -673 -676 -684 -693 -703 -706 -709 -713 -717 -736 -744 -758 -767 -772 -858 -867 -876 -968 -980 -992

>YNCQ0012W	Upstream Sequence Complementary Strand
ATATAATAAAAAAAATTATTGATAGATTAATTATCGATAAAACCACCTTAACCATCTGTG
CTATGAGAATTCTACATAATGAAATGTCATACTTCCAAGTTCAGGAAATTTATCGTTATT
TATATATATTATATATATTATATATATTTACTCAGCATCTGATTATCCATTCAATGGTTT
TAAACTCAAACCTCAAACAAACAAGCTTAGTTTGGCTAAGTTATAATA>TTATATATATAA
TAAATATATATTTATATATTAATATGAGGATAAAAATATAATTn>AATTn>AATTan>ATTan>ATATAC
TATTATATTTTTAATAACTTAATAan>ATTGAGAATAATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTAGTATTATTan>AT
TATATATATATATATCATATATATATTTTCAAAATAATA>TAATA>TAATA>TAATATATAAA
TAAATATATATTAAGAATAATTAACTTTTTTCTTATTAATTan>ATTAGAATAATTTTTTTAT
TTATGAAAGTAAAATAAAATAAAATAAATTAAATTAATA>TTATATATTTATAan>ATTTTTTT
CCTATATTCAAAAAATATTCTATATTATATATATATATAATTn>TATATTTCTTCAATTATA
AATATAAAATTAATATTTTACAATTATGAGGAAACCCCTGAATAATTn>AATT>TAATAan>ATTn>A
ATTan>ATTan>ATTAAATACTAAATATTTATTan>ATTn>TATTTCCTTATTCATAGTTAATTn>AATTan>ATA
</span>TAATATAAATTATAAAATATAAATTATAAATTATAAATTATAAAATTCAAGGCCCCGGGC
CGGTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTTCCTCATCATAATTn>AATACCTATCACTCCCACCTAAA
TTAGGAAAACAATACAATAATTn>AATTn>AATTn>AATTAAATATATATATTTTATAAAATTAAT
TAAAAATATATTTATATATATATATATATATAATTan>ATTATCAGGCCGGGCGGGGCACCCC
GCCTGGGGTTTCCTCATTATATATAATACATATTTGTTAT