Yeastract
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

Back to top top

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name YNCQ0014W
Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -1000 -993 -989 -979 -972 -969 -954 -950 -941 -915 -910 -905 -901 -896 -890 -879 -845 -832 -814 -811 -805 -800 -786 -767 -764 -755 -752 -748 -745 -742 -724 -698 -694 -689 -684 -680 -677 -670 -666 -663 -659 -656 -652 -649 -594 -552 -549 -545 -541 -537 -519 -514 -510 -479 -476 -473 -426 -336 -333 -320 -302 -299 -296 -286 -283 -280 -275 -259 -254 -251 -248 -245 -242 -239 -236 -233 -226 -223 -220 -216 -210 -207 -204 -201 -198 -193 -188 -184 -181 -174 -171 -134 -122 -119 -83 -78 -75 -54 -36 -24 -21 -9 -6 
>YNCQ0014W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ATATTATATATTTn>ATTTATATATAATTCTTATTAan>ATTGAAAAAAGAATAATTn>AATAATCT
TATTAAAAAAATAAATACTTTCATTTTATTT>TATTT>TATTTn>AATT>TAATTATAATATATA
AATATTAAAAAAAGGATATAAGTTTTTTATAAGATATAATATATATATATATTAAATATA
AAGAAGTTAATAan>TTTATATTT>TAATTATAAAATGTTAATACTCCTTTGGGGACTTATTAan>A
TTAAATTATTAan>ATTn>AATAan>ATAan>ATTTATGATTTATAAATAATAAATAAAGGAATAAGTATC
AATTAATTn>AATA>TATTA>TATTTn>AATAan>TTTTATATTTn>AATAan>TTTn>AATAan>TTTn>AATAan>TTTTAA
GTTCCGGGGCCCGGCCACGGGAGCCGGAACCCCGAAAGGAGTAGTATTAATTATGGATAG
TGAGGGTGGATTTAATCCTTTTGTTATGTTATTAan>ATTn>AATTn>AATTn>AATTTATATATATAA
AATATTT>TAATTn>AATTTTTATATAAATATATATATATATATATATTAan>ATAan>ATAGTCCGGC
CCGCCCCGTGGGGCGGACCCCAAAGGAGTAATATATATTATGTATAAACAATAGAGAATA
TTGTTTAATGGTAAAACAGTTGTCTTTTAAGCAACCCATGCTTGGTTCAACTCCAGCTAT
TCTCATAATAan>TTATATATATATATTTCCCTTTCTAAAAATAATAan>ATAan>ATTATATATAATA
>ATAan>ATA>TAATTATATATATATATATTA>TAATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAAATAATA
>ATAan>ATTn>ATTTTTATTAan>ATAan>ATAan>TTAan>ATA>TATTA>TAATTn>ATTAan>ATAAATATTAan>ATAAAAAT
AGCTCTCTTAGCTTAATGGTTAAAGCATAATACTTCTAATATTAan>ATATTCCATGTTCAAA
TCATGGAGAGAGTAATTATATTA>TATTAan>ATAATCCCCCCCCCATTTTTAATTAAATTAAG
AAGTTTAATTTACTATTTAATAan>ATAAATGAAATAATAan>ATA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -2 -5 -14 -17 -41 -46 -68 -71 -76 -81 -112 -115 -118 -164 -167 -170 -174 -177 -180 -186 -191 -194 -197 -200 -203 -212 -216 -219 -222 -226 -229 -232 -235 -238 -241 -244 -247 -252 -267 -273 -276 -279 -288 -292 -295 -298 -326 -329 -419 -426 -469 -472 -491 -506 -515 -533 -537 -541 -545 -586 -590 -645 -652 -659 -673 -682 -687 -690 -694 -713 -717 -720 -738 -741 -744 -748 -751 -756 -760 -792 -807 -821 -825 -838 -872 -875 -883 -888 -926 -934 -943 -946 -965 -993 
>YNCQ0014W	Upstream Sequence Complementary Strand
TATAATATATAAATAAATATATATTAAGAATAATTAACTTTTTTCTTATTAATTan>ATTAGA
ATAATTTTTTTATTTATGAAAGTAAAATAAAATAAAATAAATTAAATTAATA>TTATATAT
TTATAan>ATTTTTTTCCTATATTCAAAAAATATTCTATATTATATATATATATAATTn>TATAT
TTCTTCAATTATAAATATAAAATTAATATTTTACAATTATGAGGAAACCCCTGAATAATT
AATT>TAATAan>ATTn>AATTan>ATTan>ATTAAATACTAAATATTTATTan>ATTn>TATTTCCTTATTCATAG
TTAATTn>AATTan>ATA>TAATATAAATTATAAAATATAAATTATAAATTATAAATTATAAAATT
CAAGGCCCCGGGCCGGTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTTCCTCATCATAATTn>AATACCTATC
ACTCCCACCTAAATTAGGAAAACAATACAATAATTn>AATTn>AATTn>AATTAAATATATATATT
TTATAAAATTAATTAAAAATATATTTATATATATATATATATATAATTan>ATTATCAGGCCG
GGCGGGGCACCCCGCCTGGGGTTTCCTCATTATATATAATACATATTTGTTATCTCTTAT
AACAAATTACCATTTTGTCAACAGAAAATTCGTTGGGTACGAACCAAGTTGAGGTCGATA
AGAGTATTATAan>ATATATATATATAAAGGGAAAGATTTTTATTan>ATTan>ATTn>AATATATATTAT
TATTan>ATATTAATATATATATATATAATA>TTATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTn>TATTan>AT
TATTn>AATAAAAATAATTan>ATTan>ATAan>ATTan>ATA>TAATATTAATAan>ATTan>ATTn>TATAan>ATTan>ATTTTTA
TCGAGAGAATCGAATTACCAATTTCGTATTATGAAGATTATAan>ATTan>ATAAGGTACAAGTTT
AGTACCTCTCTCATTAATA>TAATA>TAATTan>ATTAGGGGGGGGGTAAAAATTAATT>TAATTC
TTCAAATTAAATGATAAATTATTan>ATTTACTTTATTan>ATTAT
w3c xhtml validator w3c css validator