Yeastract
Please fill in here our
user satisfaction survey
Thank you!
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name COX3
Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -986 -984 -979 -972 -970 -958 -956 -954 -935 -933 -926 -921 -904 -902 -900 -898 -896 -894 -892 -886 -884 -882 -880 -863 -763 -761 -759 -757 -710 -708 -693 -600 -578 -527 -452 -436 -434 -432 -427 -422 -413 -237 -235 -225 -223 -221 -219 -207 -205 -175 -154 -91 -31 -29 -27 -22 -20 -18 -16
>COX3    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AAATTATTAAATAAATATAan>TAATATATTATATAan>TAATTTATAATATAan>TAan>TATTATAAATA
TTATTATATAan>TAAAATATAATATACTACTTATAAAAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAAATATAan>T
ATAan>TA
AATAAATATTTTATATATTAAATTAAATAATTATTAATAAATTTAATTATAAAGT
ATAATTTTCAATAGGAATATTTATAAGATTATAATAATTATATGAATTATTATAATTATA
TATAan>TAan>TA
AATAAATAAAATAATAATTATAATAATTAATAAGAGTTTTGGATATAan>TATCT
GTGGAGTATATATTTTATAAAGGAGATTAGCTTAATTGGTATAGCATTCGTTTTACACAC
GAAAGATTATAGGTTCGAACCCTATATTTCCTAAATCTAGATATAATATTATATCTATCT
TAATATAATAATATTTATTTATTAAATAAAAAAAAAATAAATAATATTAATTAATATAAG
ATTCTTTTTTAATTATAATAATAAATAAATAAAAAGAAGATATTATCAATGATTTATATT
AATAATAAATATAAATAATAAAAAATATAan>TAan>TAATATAATATAATAAATATATTTCCTTT
AATATTAATAAATTAATAATAATAATAATAATAATAATAAAATATTTAAATAAATTATAT
TCAATACAAATTAATTATTTATATTATTAATAATTGAATAAATAATCCGGTCGAAAGAGA
TATTAATTCGATTATATTATTTATTTAATTATATTTAATTTAAATATAan>TAAATTAATATA
>
TATAan>TATTGAATTATATAan>TAAATTTATTTTATAATTTTATAAATAATATATTATTATAAA
TATTTAATATAATTTATATTATTATTAAATAAAAGATTTATTAAATTAATATTATTATTT
AATTTTATTATATAGTTTAAGGGATAATATTTTATTAATATTTTTTTTATTTATTTATTT
AATTATATTATATAan>TAan>TAATATAan>TAan>TAan>TAACAATAAATTT
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -12 -14 -16 -23 -25 -27 -32 -87 -141 -169 -201 -203 -213 -215 -217 -219 -231 -246 -263 -316 -340 -407 -428 -430 -461 -586 -613 -687 -689 -702 -704 -753 -755 -757 -759 -777 -857 -859 -876 -878 -880 -888 -890 -892 -894 -896 -898 -929 -931 -948 -950 -952 -966 -968 -973 -980
>COX3	Upstream Sequence Complementary Strand
TTTAATAATTTATTTATATATTATATAATATAan>TATTAAATATTATATAan>TAan>TAATATTTAT
AATAATATAan>TATTTTATATTATATGATGAATATTTTTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TATTTATATA
>
TATATTTATTTATAAAATATAan>TAATTTAATTTATTAATAATTATTTAAATTAATATTTCA
TATTAAAAGTTATCCTTATAAATATTCTAATATTATTAATATACTTAATAATATTAATAT
ATAan>TAan>TA
TTTATTTATTTTATTATTAATATTATTAATTATTCTCAAAACCTATATAan>TAGA
CACCTCATATAan>TAAAATATTTCCTCTAATCGAATTAACCATATCGTAAGCAAAATGTGTG
CTTTCTAATATCCAAGCTTGGGATATAAAGGATTTAGATCTATATTATAATATAGATAGA
ATTATATTATTATAAATAAATAATTTATTTTTTTTTTATTTATTATAATTAATTATATTC
TAAGAAAAAATTAATATTATTATTTATTTATTTTTCTTCTATAATAGTTACTAAATATAA
TTATTATTTATATTTATTATTTTTTATATAan>TATTATATTATATTATTTATATAAAGGAAA
TTATAATTATTTAATTATTATTATTATTATTATTATTATTTTATAAATTTATTTAATATA
AGTTATGTTTAATTAATAAATATAATAATTATTAACTTATTTATTAGGCCAGCTTTCTCT
ATAATTAAGCTAATATAATAAATAAATTAATATAAATTAAATTTATATATTTAATTATAT
ATAan>TAan>TA
ACTTAATATAan>TATTTAAATAAAATATTAAAATATTTATTATATAATAATATTT
ATAAATTATATTAAATATAATAATAATTTATTTTCTAAATAATTTAATTATAATAATAAA
TTAAAATAATATATCAAATTCCCTATTATAAAATAATTATAAAAAAAATAAATAAATAAA
TTAATATAATATAan>TAan>TATTATATAan>TAan>TATTGTTATTTAAA
w3c xhtml validator w3c css validator