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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name ECM10
Promoter Sequence

Consensus
YTGAT: -884 -217 -81 -70
>ECM10    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
CATTAGGAGTAACAAAGGTATGTATTATGGTTTATTGGGTGTGACAGGTTTGGCACTTGC
AAGTGCTACTGAATTTTTACCTGAGCTAAACGAAGCCATGAAGTTTGTGCCAATGACTGA
T
GACTTTAAGATTAAGTTGACCCTAACATTATTGCTCGATTTCTTTGGTAGTTGGGGTGT
CGAGCATTTTTTCAAGTTTTTCTTCATGGACGACAAACCATCAGACATTTCTGTGCAACA
GGTCAAGATTGCCTCTAAATGATAAATCTTTTATGTAGTACCCCTTTTTGTATTTATATA
CTTATATTACCCATTCATATAGATCTTTTTTAATGGGTGTATTGTTAAGTTTATGAAAGT
GCTGTATTATTTGTAAAACAGCTTCTAAGTATACGAAAATTATAATAGCTTCAAGTTTAT
ATTTTGTTGCTAGCGTTACGGTTATGTTTTTACGATACATATCGCCTAAGCAGGTCTCTG
CGCCTAAAAAAAGTAAACATATAAATTGGGAAAGCAATATAATTAAACATACTGCTATAG
TAAATTCATTACTAGGCCAATTTAACCGTGCCTTATTATGATATGAAATACCAGTCAACA
AGTCCCGCTTAAATGCACTCTAGTAAAGCTACAGGTGGTTAACAAAAATTAAGAAAACAG
AACAACCACGAGATTCTTTGAACACGGTCTGTCAAAGATCTTGACTTGGACTAGTTACAC
AATTTATTTTCCAACTGAGTGGTTTAGCACAGGAATAGTTTAATCGGGTCTTAAATTTTT
ACTTTGATTTTTGCAGGGGAGATGCTAAGTCAAATTGCAGCACCCTTTAAAGGGTCAGAC
GTAGAACATCAAAAAAAGAACAAATCTCAAAAATGATTATTTAACTAAGATTAGCAAACT
TCAAAATCATGGCGATTAATTGATACCCTATTGATTTTTTTACCGAAGAGCATTTGTAAC
TATTTCACTGGTCATAATTAAGAACTTAAATTCAAGTAAC
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
YTGAT: -148 -776
>ECM10	Upstream Sequence Complementary Strand
GTAATCCTCATTGTTTCCATACATAATACCAAATAACCCACACTGTCCAAACCGTGAACG
TTCACGATGACTTAAAAATGGACTCGATTTGCTTCGGTACTTCAAACACGGTTACTGACT
ACTGAAATTCTAATTCAACTGGGATTGTAATAACGAGCTAAAGAAACCATCAACCCCACA
GCTCGTAAAAAAGTTCAAAAAGAAGTACCTGCTGTTTGGTAGTCTGTAAAGACACGTTGT
CCAGTTCTAACGGAGATTTACTATTTAGAAAATACATCATGGGGAAAAACATAAATATAT
GAATATAATGGGTAAGTATATCTAGAAAAAATTACCCACATAACAATTCAAATACTTTCA
CGACATAATAAACATTTTGTCGAAGATTCATATGCTTTTAATATTATCGAAGTTCAAATA
TAAAACAACGATCGCAATGCCAATACAAAAATGCTATGTATAGCGGATTCGTCCAGAGAC
GCGGATTTTTTTCATTTGTATATTTAACCCTTTCGTTATATTAATTTGTATGACGATATC
ATTTAAGTAATGATCCGGTTAAATTGGCACGGAATAATACTATACTTTATGGTCAGTTGT
TCAGGGCGAATTTACGTGAGATCATTTCGATGTCCACCAATTGTTTTTAATTCTTTTGTC
TTGTTGGTGCTCTAAGAAACTTGTGCCAGACAGTTTCTAGAACTGAACCTGATCAATGTG
TTAAATAAAAGGTTGACTCACCAAATCGTGTCCTTATCAAATTAGCCCAGAATTTAAAAA
TGAAACTAAAAACGTCCCCTCTACGATTCAGTTTAACGTCGTGGGAAATTTCCCAGTCTG
CATCTTGTAGTTTTTTTCTTGTTTAGAGTTTTTACTAATAAATTGATTCTAATCGTTTGA
AGTTTTAGTACCGCTAATTAACTATGGGATAACTAAAAAAATGGCTTCTCGTAAACATTG
ATAAAGTGACCAGTATTAATTCTTGAATTTAAGTTCATTG
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