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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name FCF1
Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -971 -774 -750 -485 -461 -165 -20
>FCF1    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
CCAAGTTATCAAATTTAATGGAATCTGAAATATAAAGATTGATAATGTGATAGGGTAATG
AAAACCATAAAAAACAAAAGGAGAAATAATCGTAATATTATAATGTAGAAATACCGATTT
TCTTTACAATGGAATCCCAACAATTATCAAATTGAGAATTGGGTGAATTTTGAGATAATT
GTTGGGATTCCATTGTCGATAAAGGCTATAATATTAGGTATACAGAATATACTAGAAATT
CTCCTCGAGGATATAGGAATCCCAAAATGGAATCTATATTTCTATACACTAATATTACGA
TTATTCCTCATTCCGTTTTATATGTTTCATTATCCTATTACATTATCAATCCTTGCACTT
CAGCTTCCCCTAACTTCGATGACAGCTTCTCATAACTTATGTCATAATCTAACACCGTAT
ATGATAGTATATTGATACTATAACTATTAGTTGACAGACGATAGTGAATTTTTATTCCAA
CACTTCTTTCCATGATTTTATTCCTAATCAAGAAAATATAGATTTTCACCATAGTAATGA
TATA
GAAAACTAGAAACACTTTCACTTCAAAGTGTTTCAGTCCCAGTGGCCGAGTGGTTA
AGGCGATGCCTGCTATTTCCTCAGAAAAGCAATTAGGCATTGGGTTTTACCTGCGCAGGT
TCGAATCCTGTCTGTGACGCACTTTATTTTTTCTACATCCACTATTTTAAAGCTTGATTT
TTTTGATTGTGAGCCACCTTCATGTACCTATCGTTTGTGGACTATTGCCATTAATTGCTT
ATTCACTTGCAATGATTTTATAAACATTACTCAAACTATCGGTTCCTACTGGAAGATATA
ACAAAAAAATTTGGCATATTTCTAAAGGTATCATTATGAACGGCTAAAATTTTTCAGCTT
GCTACTATTCTTGAATGATGCCTCTTTAAACATTACTGTGCATTAACACACAATAACAGT
GACTTGTAACGGAAATATCGATATACTACAACAGTTAATT
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -568 -578 -677 -721
>FCF1	Upstream Sequence Complementary Strand
GGTTCAATAGTTTAAATTACCTTAGACTTTATATTTCTAACTATTACACTATCCCATTAC
TTTTGGTATTTTTTGTTTTCCTCTTTATTAGCATTATAATATTACATCTTTATGGCTAAA
AGAAATGTTACCTTAGGGTTGTTAATAGTTTAACTCTTAACCCACTTAAAACTCTATTAA
CAACCCTAAGGTAACAGCTATTTCCGATATTATAATCCATATGTCTTATATGATCTTTAA
GAGGAGCTCCTATATCCTTAGGGTTTTACCTTAGATATAAAGATATGTGATTATAATGCT
AATAAGGAGTAAGGCAAAATATACAAAGTAATAGGATAATGTAATAGTTAGGAACGTGAA
GTCGAAGGGGATTGAAGCTACTGTCGAAGAGTATTGAATACAGTATTAGATTGTGGCATA
TA
CTATCATATAACTATGATATTGATAATCAACTGTCTGCTATCACTTAAAAATAAGGTT
GTGAAGAAAGGTACTAAAATAAGGATTAGTTCTTTTATATCTAAAAGTGGTATCATTACT
ATATCTTTTGATCTTTGTGAAAGTGAAGTTTCACAAAGTCAGGGTCACCGGCTCACCAAT
TCCGCTACGGACGATAAAGGAGTCTTTTCGTTAATCCGTAACCCAAAATGGACGCGTCCA
AGCTTAGGACAGACACTGCGTGAAATAAAAAAGATGTAGGTGATAAAATTTCGAACTAAA
AAAACTAACACTCGGTGGAAGTACATGGATAGCAAACACCTGATAACGGTAATTAACGAA
TAAGTGAACGTTACTAAAATATTTGTAATGAGTTTGATAGCCAAGGATGACCTTCTATAT
TGTTTTTTTAAACCGTATAAAGATTTCCATAGTAATACTTGCCGATTTTAAAAAGTCGAA
CGATGATAAGAACTTACTACGGAGAAATTTGTAATGACACGTAATTGTGTGTTATTGTCA
CTGAACATTGCCTTTATAGCTATATGATGTTGTCAATTAA
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