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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name JIP3
Promoter Sequence

Consensus
YTGAT: -389 -242 -163 -107
>JIP3    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TCAAATGGCTGTCAGGTCCTACTATCATACTATTACAATTTTTTTTAAAATGTAATTAAT
GTTAACTTTTTTTAATTAGAGGGTATGTAATGCTAATCCTACATAAGAAGGTGATAATAT
TTGTAAAAATACTAATGAAGTCCACCTACTCAATATCAGAAATATAATTAAGATGGTCAA
TTTACAATAATTGAGGAATGAAAAGTAGCCATAAGCACTAAATGATATGAATGGATATGA
TTAATAATTTCGTGGTGATAATTCGTTACCTTGTTCATCATAGAATTTTTCTTCTATTAT
GTCATTTGACGCAACGCTACTATTTATAGGCTCTCCACCGCTATTGGTATTATTATGGTC
GGCGGTGTTGGCGTTTGGTAATACGCTATCGCTATCTCTTATTCTGACGTCGAAAAGGGA
GCTTTGCTCCATCACATCATCTGCTTCATCTAGGTCTAAACCACCTGCGGACGATGCACT
ACCACCTAATGGTGAATCGGAGTGGTATTCATCACTAACTTTCTTACCCAAAAGCATATA
CCACCATTTCGTAAATTTGTTAGCTCTATATGCCGTAACGACCTTACCATCTGAGTCAAT
AAAGTCCGTCCTTGATGATTGGATACAAAACATGTAAATTAAAGCCAGTATCACCAGAAT
CAGTGGTACACCAATACCAACCACACAACCAATGACGATGTTTCTATTTTTTTTAGAAAG
ACCCGAACTTTTGGATTTATTGCTTGAATCAGCGGTTGCTGATGGTGTGTACGTAACGGT
AGTATAATGATTTGAGAGAATCGTCTTACCGTTAATAATACTGGTGATAGTGCTTCCTTG
AT
TATAGGCAGTAGTGGATGGTGTGGAGGAGGTTGAAGGTGCAGAAGTGATTGTTGATGG
GGATGATGAAGAGGACGGCGTTGACGACAGTGAGGATGAAGATGATGTTGACGTTTGCGT
AGAAGACGTCGATGATTCAGAAGTTGCGGATGTCGAAGAG
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
YTGAT: -248 -337 -841
>JIP3	Upstream Sequence Complementary Strand
AGTTTACCGACAGTCCAGGATGATAGTATGATAATGTTAAAAAAAATTTTACATTAATTA
CAATTGAAAAAAATTAATCTCCCATACATTACGATTAGGATGTATTCTTCCACTATTATA
AACATTTTTATGATTACTTCAGGTGGATGAGTTATAGTCTTTATATTAATTCTACCAGTT
AAATGTTATTAACTCCTTACTTTTCATCGGTATTCGTGATTTACTATACTTACCTATACT
AATTATTAAAGCACCACTATTAAGCAATGGAACAAGTAGTATCTTAAAAAGAAGATAATA
CAGTAAACTGCGTTGCGATGATAAATATCCGAGAGGTGGCGATAACCATAATAATACCAG
CCGCCACAACCGCAAACCATTATGCGATAGCGATAGAGAATAAGACTGCAGCTTTTCCCT
CGAAACGAGGTAGTGTAGTAGACGAAGTAGATCCAGATTTGGTGGACGCCTGCTACGTGA
TGGTGGATTACCACTTAGCCTCACCATAAGTAGTGATTGAAAGAATGGGTTTTCGTATAT
GGTGGTAAAGCATTTAAACAATCGAGATATACGGCATTGCTGGAATGGTAGACTCAGTTA
TTTCAGGCAGGAACTACTAACCTATGTTTTGTACATTTAATTTCGGTCATAGTGGTCTTA
GTC
ACCATGTGGTTATGGTTGGTGTGTTGGTTACTGCTACAAAGATAAAAAAAATCTTTC
TGGGCTTGAAAACCTAAATAACGAACTTAGTCGCCAACGACTACCACACATGCATTGCCA
TCATATTACTAAACTCTCTTAGCAGAATGGCAATTATTATGACCACTATCACGAAGGAAC
TAATATCCGTCATCACCTACCACACCTCCTCCAACTTCCACGTCTTCACTAACAACTACC
CCTACTACTTCTCCTGCCGCAACTGCTGTCACTCCTACTTCTACTACAACTGCAAACGCA
TCTTCTGCAGCTACTAAGTCTTCAACGCCTACAGCTTCTC
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