Yeastract
Please fill in here our
user satisfaction survey
Thank you!
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name OLI1
Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -975 -957 -955 -953 -951 -736 -734 -717 -682 -652 -643 -641 -639 -609 -595 -574 -566 -564 -562 -560 -549 -359 -357 -355 -353 -351 -349 -317 -254 -252 -250 -226 -224 -105 -103 -98 -90 -88 -80 -78 -76 -74 -72 -70 -54 -52 -50 -48 -43
>OLI1    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AATAAAATAAACTTAATTAAATATTATATATTTATTTACAATTATATAan>TAan>TAan>TATTACTC
ATAATTAAATTAAATTAAGATGCAATTCAATACGGTTGTATTATATTATTCATCAAATAT
TGTTAATATTGATACCTACAGAGATATTTAATATTTTTATTATTATTATCCATTACTTTT
TTTATTATATTTTAATTATTTATTTATTTATTTATTTATAATAATAATATTTCATATTAT
CAATTATTATTTTTTTTTTTTATAATATAan>TAATTAAATTATTTATATAGTTCCCCGAAAG
GAGAATAAATAAAATATTATATAAATATTTATATCTTTATTAATATTAATATAAGTAATA
TATAan>TA
GTTTATGATATTTAATTTTATCATAATATAATAATAATTATATAAATCTTATAC
ACATTTATATAAGTATATAan>TAan>TAan>TATTATTAATATAATGAACATCTATTAAATAAAATAA
TTGTAAATCTCAAGTAAATTATTATTATTTTATTTTTAATAATAATTTATGATTTATAAT
TAATAAATAAAAGAGTAATTATATGATAAAAAAGGTAATAAATAAAATTTATAGTTCCGG
GGCCCGGCCACGGGAGCCGGAACCCCGAAAGGAGTTTATTTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TATGAA
TTAATATTTAATAATAAATAATAATATAATTAATAATATTATTATTATTATAATTTTTTT
ATTTATAATATTAATAAAATATTATTATATAan>TAan>TATTATAATAATATTAATAAGATATAan>T
A
AATAAGTCCCTTTTTTTTTATTTAAAATAAAGAAAGAATAATTAAATAATATTTTAATA
ATTTAATTAAATAGTGTATTAAAAGATAATAAAAAGTAATATTAATATGTTAATTATATA
>
TAATATATTTATATAan>TAATTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAAATAATAATAAATATAan>TAan>TAan>TAATA
TA
AAAATAAGAATAGATTAAATATTTAATAAATAAATATT
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -44 -46 -48 -66 -68 -70 -72 -74 -76 -84 -86 -92 -99 -101 -220 -244 -246 -248 -250 -343 -345 -347 -349 -351 -353 -355 -436 -554 -556 -558 -560 -562 -570 -591 -635 -637 -666 -678 -713 -730 -810 -894 -945 -947 -949 -951 -953 -969 -971
>OLI1	Upstream Sequence Complementary Strand
TTATTTTATTTGAATTAATTTATAATATAan>TAAATAAATGTTAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAATGAG
TATTAATTTAATTTAATTCTACGTTAAGTTATGCCAACATAATATAATAAGTAGTTTATA
ACAATTATAACTATGGATGTCTCTATAAATTATAAAAATAATAATAATAGGTAATGAAAA
AAATAATATAAAATTAATAAATAAATAAATAAATAAATATTATTATTATAAAGTATAATA
GTTAATAATAAAAAAAAAAAATATTATATATTAATTTAATAAATATATCAAGGGGCTTTC
CTCTTATTTATTTTATAATATATTTATAAATATAGAAATAATTATAATTATATTCATTAT
ATAan>TA
TCAAATACTATAAATTAAAATAGTATTATATTATTATTAATATATTTAGAATATG
TGTAAATATATTCATATAan>TAan>TAan>TAan>TAATAATTATATTACTTGTAGATAATTTATTTTATT
AACATTTAGAGTTCATTTAATAATAATAAAATAAAAATTATTATTAAATACTAAATATTA
ATTATTTATTTTCTCATTAATATACTATTTTTTCCATTATTTATTTTAAATATCAAGGCC
CCGGGCCGGTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTTCCTCAAATAAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TACTT
AATTATAAATTATTATTTATTATTATATTAATTATTATAATAATAATAATATTAAAAAAA
TAAATATTATAATTATTTTATAATAATATAan>TAan>TAan>TAATATTATTATAATTATTCTATATA
TTTATTCAGGGAAAAAAAAATAAATTTTATTTCTTTCTTATTAATTTATTATAAAATTAT
TAAATTAATTTATCACATAATTTTCTATTATTTTTCATTATAATTATACAATTAATATAan>T
A
TTATATAAATATAan>TATTAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TATTTATTATTATTTATATAan>TAan>TATTAT
ATTTTTATTCTTATCTAATTTATAAATTATTTATTTATAA
w3c xhtml validator w3c css validator