Yeastract
Please fill in here our
user satisfaction survey
Thank you!
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name Q0032
Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -941 -925 -875 -706 -562 -529 -482 -480 -478 -476 -420 -418 -416 -414 -412 -410 -408 -406 -404 -402 -383 -374 -363 -361 -359 -354 -352 -339 -337 -321 -274 -205 -9
>Q0032    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ATTATATCTTATTAATGATAAATTATAATTATTATTAAAATAATAATTTACTTCTTTTGA
TATA
AAAATAAAATAATATAGTTCCGGGGCCCGGCCACGGGAGCCGGAACCCCGGAAGGA
GATAAATATATTATATTTTTATTCCTACCTATTAAAGGTAAAGACTCGATTCTCATAATT
AAATTTATATCCTTCGGCCGGATTAATTTATTTTATTTATATTTATATTTATAGTGAATA
CCTTTTTTAATATTTATTTTTAATATTTATTTTTAATATTTTATTTTTAATAAAATATAA
TCTTGTAAGTAAGAAAAGAATTTCGGTGATTGGAACCTTGAAAGGATAAATTTCTTATTT
ATTATAATATTTATATTAATAGTTCCGGGGCCCGGCCACGGGAGCCGGAACCCCGAAAGG
AGTATTATTAAACATTTAATATATTATATTAATATTTAATTTAAATGATTAATATATTAT
TATAATAATATTTATTTTATATTAAAATATTATAATTAATATAan>TAan>TAan>TATTTATTTTAAT
AATATTATTATTATTATTATTAAAATTATTATTTTTATAAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>T
ATA
TTATTTTTATTCTTATATAAATTATATAAAAAAAATATAan>TAan>TAATATAan>TAATTAATT
AATATAan>TATTATTTAAATTATATATTATTTAAAATACTTTTTATATTATATCTTCTTTAA
ATTAAAATATAATTATTATTTATATTATAATTATTTATGAAATATTATTATTAAAATAAA
AAAGAGGTTTAGACTATATATTTATTATTTATAAACTTATTATATTATTTATTATTAATA
GTTCCGGGGCCCGGCCACGGGAGCCGGAACCCCGAAAGGAGAAATAAATAAAATAAAAAA
TAATAAATATTAATATTATTAAATATTATTTATAATAAATATTAATATTATTAAATATTA
TTCATATTAATAAATTTTATTATTATTTGTAATATATTAA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -3 -175 -199 -201 -255 -289 -294 -315 -317 -331 -333 -348 -355 -357 -370 -379 -396 -398 -400 -402 -404 -406 -408 -410 -412 -414 -470 -472 -474 -476 -498 -523 -551 -556 -624 -772 -778 -810 -864 -869 -993
>Q0032	Upstream Sequence Complementary Strand
TAATATAGAATAATTACTATTTAATATTAATAATAATTTTATTATTAAATGAAGAAAACT
ATATTTTTATTTTATTATATCAAGGCCCCGGGCCGGTGCCCTCGGCCTTGGGGCCTTCCT
CTATTTATATAATATAAAAATAAGGATGGATAATTTCCATTTCTGAGCTAAGAGTATTAA
TTTAAATATAGGAAGCCGGCCTAATTAAATAAAATAAATATAAATATAAATATCACTTAT
GGAAAAAATTATAAATAAAAATTATAAATAAAAATTATAAAATAAAAATTATTTTATATT
AGAACATTCATTCTTTTCTTAAAGCCACTAACCTTGGAACTTTCCTATTTAAAGAATAAA
TAATATTATAAATATAATTATCAAGGCCCCGGGCCGGTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTTCC
TCATAATAATTTGTAAATTATATAATATAATTATAAATTAAATTTACTAATTATATAATA
ATATTATTATAAATAAAATATAATTTTATAATATTAATTATATAan>TAan>TAan>TAAATAAAATTA
TTATAATAATAATAATAATAATTTTAATAATAAAAATATTTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TA
>
TATAATAAAAATAAGAATATATTTAATATATTTTTTTTATATAan>TATTATATATTAATTAA
TTATATAan>TAATAAATTTAATATAan>TAATAAATTTTATGAAAAATATAATATAGAAGAAATT
TAATTTTATATTAATAATAAATATAATATTAATAAATACTTTATAATAATAATTTTATTT
TTTCTCCAAATCTGATATAan>TAAATAATAAATATTTGAATAATATAATAAATAATAATTAT
CAAGGCCCCGGGCCGGTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTTCCTCTTTATTTATTTTATTTTTT
ATTATTTATAATTATAATAATTTATAATAAATATTATTTATAATTATAATAATTTATAAT
AAGTATAATTATTTAAAATAATAATAAACATTATATAATT
w3c xhtml validator w3c css validator