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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name SCEI
Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -937 -822 -806 -804 -799 -797 -788 -786 -779 -777 -772 -693 -691 -662 -660 -653 -651 -622 -601 -425 -267 -208 -158 -150 -148 -39 -37
>SCEI    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TCAGCATATTAAGTAATCCTATTATTAGGTAATCGTTTAGATATTAATGAGATACTTATT
ATAATATAATGATAATTCTAATCTTATAAATAATTATTATTATTATTATTAATAATAATA
ATATGCTTTCAAGCATAGTGATAAAACATATTTATATGATAATCACTTTACTTAATAGAT
ATA
ATTCTTAAGTAATATAan>TAATATAan>TATTTTATATAan>TATTATATAan>TAATATAAGAGACA
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CCGGAACTTAAATAAAAATGGAAAGAATTAAATTAATATAATGGTATAACTGTGCGATAA
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TTGTAAAGGTTATTGATAACGAATAAAAGTTACGCTAGGGATAATTTACCCCCTTGTCCC
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TCATATATGTATATAan>TACGGTTATAAGAACGTTCAACGACTAGATGATGAGTGGAGTTAA
CAATAATTCATCCACGAGCGCCCAATGTCGAATAAATAAAATATTAAATAAATATCAAAG
GATATAan>TAAAGATTTTTAATAAATCAAAAAATAAAATAAA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -33 -144 -146 -152 -273 -595 -608 -618 -645 -647 -649 -654 -656 -687 -773 -775 -780 -782 -784 -791 -793 -800 -843
>SCEI	Upstream Sequence Complementary Strand
AGTCGTATAATTCATTAGGATAATAATCCATTAGCAAATCTATAATTACTCTATGAATAA
TATTATATTACTATTAAGATTAGAATATTTATTAATAATAATAATAATAATTATTATTAT
TATACGAAAGTTCGTATCACTATTTTGTATAAATATACTATTAGTGAAATGAATTATCTA
TATTAAGAATTCATTATATATTATATAan>TAAAATATAan>TAan>TAATATAan>TATTATATTCTCTGT
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TATTTAACTTTATACAAATATATTTAAATATAAATAACTTATATAAAATCATTATCTATT
TTTATACATGTCATTTTAACATTCCTTTTGTTATTATTGAAAGAGGAGAGAGCCACCCCC
AAGTGTGGATAAAAATTATCCACACTTGGGGAGAAGCCCCAAGGCCAAGGGAAAGCCCAG
GGCCTTGAATTTATTTTTACCTTTCTTAATTTAATTATATTACCATATTGACACGCTATT
AACATTGTGTTTGCTCACTTTGTTCATGCATTCATACCGTATTACTTGTTTATTGTGACT
AACATTTCCAATAACTATTGCTTATTTTCAATGCGATCCCTATTAAATGGGGGAACAGGG
TAATATAACTTTTTATATTAATAAGTTAATTAATAAATTAACTTCATTTAACCCACTTAA
CGAATCTATAGGTATATCTATTTTTATTACCTGTTATTCGTCGCTTCGAATATTGTTGAA
AGTATATACATATAan>TATGCCAATATTCTTGCAAGTTGCTGATCTACTACTCACCTCAATT
GTTATTAAGTAGGTGCTCGCGGGTTACAGCTTATTTATTTTATAATTTATTTATAGTTTC
CTATATATTTCTAAAAATTATTTAGTTTTTTATTTTATTT
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