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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name SET6
Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -600 -62 -60 -58 -56 -54 -52 -50 -48 -46 -35
>SET6    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ACAGTATAGGAAAAACCATAACAGATTTTTCAATATCAAGATCTGTCCTGGCAAAATATG
AAGTGATTAATCAAGTAGATAAAAAATTTATTCTCATACGTTGTTTAGACCAATCTATTC
ATAATTGCCCACTATTAGTTCTAGTTGATCAACATGCTTGCGATGAGAGGATAAGACTAG
AAGAGCTATTTTATAGCCTGTTGACAGAAGTTGTAACCGGAACTTTTGTTGCACGAGACC
TCAAGGATTGTTGCATTGAAGTTGATCGTACTGAGGCTGACTTATTTAAGCATTATCAAA
GTGAATTTAAAAAGTGGGGAATTGGCTATGAAACAATTGAGGGAACAATGGAAACCTCAC
TTTTGGAAATTAAAACACTGCCTGAGATGTTAACTTCCAAATATAACGGGGATAAAGACT
ACTTAAAAATGGTCTTGCTGCAACATGCTCATGACCTGAAGGATTTCAAAAAACTTCCAA
TGGATTTATCCCATTTCGAAAACTACACTTCGGTTGATAAATTATATTGGTGGAAGTACT
CAAGCTGCGTTCCAACGGTCTTTCATGAAATTCTTAACAGCAAGGCATGCAGATCTGCTG
TTATGTTTGGAGATGAATTAACCCGGCAAGAGTGCATAATTTTAATTAGCAAGCTCTCGC
GATGCCATAACCCATTCGAATGCGCCCACGGGAGACCTTCTATGGTACCCATTGCAGAAT
TGAAGTAAAGAGAACCTTAATCCTGGAACAAGGTTTGTCGCCTGCATTTTAAATTGCGCG
GATATGCAAAACAGAAGATTACCTCATCACGTTGTCAAAACCTGGAAAAATTTAAAAAAC
AAAAACAAAAAAGAAACGTGCGATACAATACTGCTCCACTGTTGCATTACCGTTTTATGT
ATCTCTGATATTATAAATGTAGCCCTAGATTTATATGAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAC
CATTTATATATGCAAACACAAAATAACCTAAAATTTAAAA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -29 -31 -42 -44 -46 -48 -50 -52 -54 -56 -64 -473
>SET6	Upstream Sequence Complementary Strand
TGTCATATCCTTTTTGGTATTGTCTAAAAAGTTATAGTTCTAGACAGGACCGTTTTATAC
TTCACTAATTAGTTCATCTATTTTTTAAATAAGAGTATGCAACAAATCTGGTTAGATAAG
TATTAACGGGTGATAATCAAGATCAACTAGTTGTACGAACGCTACTCTCCTATTCTGATC
TTCTCGATAAAATATCGGACAACTGTCTTCAACATTGGCCTTGAAAACAACGTGCTCTGG
AGTTCCTAACAACGTAACTTCAACTAGCATGACTCCGACTGAATAAATTCGTAATAGTTT
CACTTAAATTTTTCACCCCTTAACCGATACTTTGTTAACTCCCTTGTTACCTTTGGAGTG
AAAACCTTTAATTTTGTGACGGACTCTACAATTGAAGGTTTATATTGCCCCTATTTCTGA
TGAATTTTTACCAGAACGACGTTGTACGAGTACTGGACTTCCTAAAGTTTTTTGAAGGTT
ACCTAAATAGGGTAAAGCTTTTGATGTGAAGCCAACTATTTAATATAACCACCTTCATGA
GTTCGACGCAAGGTTGCCAGAAAGTACTTTAAGAATTGTCGTTCCGTACGTCTAGACGAC
AATACAAACCTCTACTTAATTGGGCCGTTCTCACGTATTAAAATTAATCGTTCGAGAGCG
CTACGGTATTGGGTAAGCTTACGCGGGTGCCCTCTGGAAGATACCATGGGTAACGTCTTA
ACTTCATTTCTCTTGGAATTAGGACCTTGTTCCAAACAGCGGACGTAAAATTTAACGCGC
CTATACGTTTTGTCTTCTAATGGAGTAGTGCAACAGTTTTGGACCTTTTTAAATTTTTTG
TTTTTGTTTTTTCTTTGCACGCTATGTTATGACGAGGTGACAACGTAATGGCAAAATACA
TAGAGACTATAATATTTACATCGGGATCTAAATATACTTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TATG
GTAAATATAan>TACGTTTGTGTTTTATTGGATTTTAAATTTT
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