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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name VAR1
Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -979 -850 -822 -820 -818 -816 -814 -809 -604 -602 -600 -514 -507 -505 -458 -393 -352 -350 -348 -346 -344 -342 -340 -332 -324 -322 -320 -299 -267 -265 -229 -227 -166 -132 -82 -80 -78 -76 -74 -72 -34 -32
>VAR1    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TTAATTATATTAATTCTTATTATATAATAATTATTAATAATAATTTATTTTAAGAAAGGA
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ATATGTATATAan>TAATAGATAAAAAGTAAAAATAAAAAATA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -28 -30 -54 -66 -68 -70 -72 -74 -76 -78 -126 -180 -223 -225 -261 -263 -293 -314 -316 -318 -320 -326 -328 -334 -336 -338 -340 -342 -344 -346 -348 -354 -387 -454 -501 -596 -598 -709 -715 -721 -733 -739 -803 -810 -812 -814 -816 -836 -846 -858 -975 -990
>VAR1	Upstream Sequence Complementary Strand
AATTAATATAATTAAGAATAATATATTATTAATAATTATTATTAAATAAAATTCTTTCCT
CACTCCCTGGGGGAGGGCAATCCCTCCCCCTGGCTTGGGGCTTCCTCTTTTATTTAATTA
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