S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

VAR1

Promoter Sequence

Consensus
GAGGGG: -917

>VAR1    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TTAATTATATTAATTCTTATTATATAATAATTATTAATAATAATTTATTTTAAGAAAGGA
GTGAGGGACCCCCTCCCGTTAGGGAGGGGGACCGAACCCCGAAGGAGAAAATAAATTAAT
AAAAGTTTAAAAGTTCTTATATTAATAATTATATAATATTATATTAAAGATTTTTATAAT
ATATATATATAATATATTTATAGTTCCGGGGCCCGGCCACGGGAGCCGGAACCCCGAAAG
GAGTTTATTTAATATTTATATTTATATTAATATTTATATTTATATTTATATTCCTCTTAA
GGATGGTTGACTGAGTGGTTTAAAGTGTGATATTTGAGCTATCATTAGTCTTTATTGGCT
ACGTAGGTTCAAATCCTACATCATCCGTAATAATACATATATATAATAATAATTTTAATA
TTATTCCTATAAAAATAAAATAAATAAATAAATAATAATAATTAATTAATTAATTAATTT
TAATAAATATAAAATATATAAAAATAATAATAATAATAATTATTATTTTAATAATATTAT
TTATATAATAGTCCGGTCCGACCCTTTTTATTCTTAAGAAGGGATTTTATTTTATTAATT
AATAATAATATATTAAAAATTATAAATAATTAATAATTCTTTATATTTATATATATATAT
ATATATTTATATATTTATATATATATTTTAATAATATTATGATATATTTTATTTTAATAA
TATTTTTATTTTTATATATAAAATTATAATATTTTATTTTATAAATTATTTATATATAAA
TTATTAATAATAATTATTTTTTTTTATTTGGGATTTATATTATTATTATAAAGAATATAA
TGTTATTAATAACTGCAAAAAATATCTAATATATTATTATTTATAATAATAAATAATATT
ATAATAAGGATGCATATTATATATATATATATATTTCTATTTATATTAATATTAATATTA
ATATGTATATATAATAGATAAAAAGTAAAAATAAAAAATA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
GAGGGG: -925

>VAR1	Upstream Sequence Complementary Strand
AATTAATATAATTAAGAATAATATATTATTAATAATTATTATTAAATAAAATTCTTTCCT
CACTCCCTGGGGGAGGGCAATCCCTCCCCCTGGCTTGGGGCTTCCTCTTTTATTTAATTA
TTTTCAAATTTTCAAGAATATAATTATTAATATATTATAATATAATTTCTAAAAATATTA
TATATATATATTATATAAATATCAAGGCCCCGGGCCGGTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTTC
CTCAAATAAATTATAAATATAAATATAATTATAAATATAAATATAAATATAAGGAGAATT
CCTACCAACTGACTCACCAAATTTCACACTATAAACTCGATAGTAATCAGAAATAACCGA
TGCATCCAAGTTTAGGATGTAGTAGGCATTATTATGTATATATATTATTATTAAAATTAT
AATAAGGATATTTTTATTTTATTTATTTATTTATTATTATTAATTAATTAATTAATTAAA
ATTATTTATATTTTATATATTTTTATTATTATTATTATTAATAATAAAATTATTATAATA
AATATATTATCAGGCCAGGCTGGGAAAAATAAGAATTCTTCCCTAAAATAAAATAATTAA
TTATTATTATATAATTTTTAATATTTATTAATTATTAAGAAATATAAATATATATATATA
TATATAAATATATAAATATATATATAAAATTATTATAATACTATATAAAATAAAATTATT
ATAAAAATAAAAATATATATTTTAATATTATAAAATAAAATATTTAATAAATATATATTT
AATAATTATTATTAATAAAAAAAAATAAACCCTAAATATAATAATAATATTTCTTATATT
ACAATAATTATTGACGTTTTTTATAGATTATATAATAATAAATATTATTATTTATTATAA
TATTATTCCTACGTATAATATATATATATATATAAAGATAAATATAATTATAATTATAAT
TATACATATATATTATCTATTTTTCATTTTTATTTTTTAT