Yeastract
Please fill in here our
user satisfaction survey
Thank you!
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

Back to top top

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name YNCQ0001W
Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -994 -936 -934 -928 -828 -826 -824 -822 -801 -799 -797 -795 -793 -791 -744 -713 -711 -709 -552 -550 -501 -492 -490 -488 -486 -484 -482 -444 -429 -403 -401 -393 -339 -20 -18 -11 
>YNCQ0001W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AAATTAATATAATATTAATAAAGTAATTAGTATAAATAAATAATATGAAAATAAAACTTA
ATAAATATAan>TAAATATAGTCCGGCCCGCCCCCCCGCGGCGGGCGGACCCCGAAGGAGTGA
GGGACCCCTCCCTAATGGGAGGGGGACCGAACCCCTTTTTAAGAAGGAGTCCATATAan>TAan>T
ATATTAATAAAAAAAAGTAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TATTGGAATAGTTATATTATTATACAGA
AATATGCTTAATTATAATATAATATCCATATTCATAATTAATTTTTTATATAan>TAan>TATTAT
ATTATAATATTAATTTATATTATAAAAATAATATTTATTATTAAAATATTTATTCTCCTT
TCGGGGTTCCGGCTCCCGTGGCCGGGCCCCGGAATTATTAATTAATAATAAATTATTATT
AATAATTATTTATTATTTTATCATTAAAATATAan>TAAATAAAAAATATTAAAAAGATAAAA
AAAATAATGTTTATTCTTTATATAAATTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAATTAATTAATTAATTAA
TTAATTAATAATAAAAATATAATTATAAATAATATAAATATTATTCTTTATTAATAAATA
TATATTTATATATTATAAAAGTATCTTAATTAATAAAAATAAACATTTAATAATATGAAT
TATATATTATTATTATTATTAATAAAATTATTAATAATAATCAATATGAAATTAATAAAA
ATCTTATAAAAAAGTAATGAATACTCCTTTTTAAAAATAAAAAGGGGTTCGGTCCCCCCC
CTTCCGTATACTTACGGGAGGGGGGTCCCTCACTCCTTCTTAATTAAATTATCTTAATTA
AATTATCTTAATTAAATTATCTTAATTAAATTATCTTAATTAAATTATCTTAATTAAATT
AAAAGGGGACTTTATATTTATAAAGTAATTATATTATTATTATTATTATTATTTATTTAT
TTTATTTTTATTATTTTATTATATAan>TATTATATATTAATA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -5 -7 -12 -14 -16 -66 -83 -333 -335 -387 -389 -395 -397 -478 -480 -482 -484 -486 -488 -497 -546 -680 -698 -703 -705 -707 -709 -771 -785 -787 -789 -791 -793 -795 -816 -818 -820 -822 -930 
>YNCQ0001W	Upstream Sequence Complementary Strand
TTTAATTATATTATAATTATTTCATTAATCATATTTATTTATTATACTTTTATTTTGAAT
TATTTATATATTTATATCAGGCCGGGCGGGGGGGCGCCGCCCGCCTGGGGCTTCCTCACT
CCCTGGGGAGGGATTACCCTCCCCCTGGCTTGGGGAAAAATTCTTCCTCAGGTATATAan>TA
>TATAATTATTTTTTTTCATTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAACCTTATCAATATAATAATATGTCT
TTATACGAATTAATATTATATTATAGGTATAAGTATTAATTAAAAAATATAan>TAan>TAan>TAATA
TAATATTATAATTAAATATAATATTTTTATTATAAATAATAATTTTATAAATAAGAGGAA
AGCCCCAAGGCCGAGGGCACCGGCCCGGGGCCTTAATAATTAATTATTATTTAATAATAA
TTATTAATAAATAATAAAATAGTAATTTTATATATTTATTTTTTATAATTTTTCTATTTT
TTTTATTACAAATAAGAAATATATTTAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TATTAATTAATTAATTAATT
AATTAATTATTATTTTTATATTAATATTTATTATATTTATAATAAGAAATAATTATTTAT
ATAan>TAAATATAan>TAATATTTTCATAGAATTAATTATTTTTATTTGTAAATTATTATACTTA
ATATAan>TAATAATAATAATAATTATTTTAATAATTATTATTAGTTATACTTTAATTATTTT
TAGAATATTTTTTCATTACTTATGAGGAAAAATTTTTATTTTTCCCCAAGCCAGGGGGGG
GAAGGCATATGAATGCCCTCCCCCCAGGGAGTGAGGAAGAATTAATTTAATAGAATTAAT
TTAATAGAATTAATTTAATAGAATTAATTTAATAGAATTAATTTAATAGAATTAATTTAA
TTTTCCCCTGAAATATAAATATTTCATTAATATAATAATAATAATAATAATAAATAAATA
AAATAAAAATAATAAAATAATATAan>TAan>TAATATAan>TAATTAT
w3c xhtml validator w3c css validator