S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

YNCQ0001W

Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -997 -992 -989 -986 -961 -943 -820 -817 -775 -772 -753 -747 -742 -727 -723 -707 -702 -697 -694 -691 -684 -673 -670 -666 -663 -655 -606 -603 -599 -596 -588 -585 -582 -579 -575 -571 -568 -537 -480 -476 -472 -468 -464 -460 -456 -453 -442 -432 -423 -413 -410 -399 -391 -375 -371 -354 -351 -337 -334 -331 -328 -325 -322 -313 -310 -307 -289 -181 -167 -153 -139 -125 -111 -87 -70 -67 -64 -61 -58 -55 -52 -48 -44 -39 -33 -30 -25 -16 -9 -6

>YNCQ0001W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AAATTAATA>TAATAan>TTAan>ATAAAGTAATTAGTATAAATAAATAATATGAAAATAAAACTTA
ATAAATATATAAATATAGTCCGGCCCGCCCCCCCGCGGCGGGCGGACCCCGAAGGAGTGA
GGGACCCCTCCCTAATGGGAGGGGGACCGAACCCCTTTTTAAGAAGGAGTCCATATATAT
ATATTAan>ATAAAAAAAAGTAATATATATATATATATTGGAATAGTTATATTAan>TTATACAGA
AATATGCTTAATTATAATA>TAATATCCATATTCATAATTn>AATTTTTTATATATATATTA>T
ATTA>TAATAan>TTAan>ATTTATATTATAAAAATAATAan>TTTn>ATTAan>TTAAAATATTTATTCTCCTT
TCGGGGTTCCGGCTCCCGTGGCCGGGCCCCGGAATTATTAan>ATTn>AATAan>ATAAATTATTAan>TT
AATAan>ATTn>ATTTn>ATTAan>TTTTATCATTAAAATATATAAATAAAAAATATTAAAAAGATAAAA
AAAATAATGTTTATTCTTTATATAAATTATATATATATATATAATTn>AATTn>AATTn>AATTn>AA
TTn>AATTn>AATAan>ATAAAAATATAATTATAAATAATATAAATATTATTCTTTATTAan>ATAAATA
TATATTTATATATTATAAAAGTATCTTAATTn>AATAAAAATAAACATTTAATAan>ATATGAAT
TATATATTAan>TTAan>TTAan>TTAan>TTAan>ATAAAATTATTAan>ATAan>ATAATCAATATGAAATTAATAAAA
ATCTTATAAAAAAGTAATGAATACTCCTTTTTAAAAATAAAAAGGGGTTCGGTCCCCCCC
CTTCCGTATACTTACGGGAGGGGGGTCCCTCACTCCTTCTTAATTAAATTATCTTAATTA
AATTATCTTAATTAAATTATCTTAATTAAATTATCTTAATTAAATTATCTTAATTAAATT
AAAAGGGGACTTTATATTTATAAAGTAATTATATTAan>TTAan>TTAan>TTAan>TTAan>TTAan>TTTn>ATTTn>AT
TT>TATTTTTATTAan>TTT>TATTATATATATTATATATTAan>ATA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -2 -9 -18 -26 -48 -51 -54 -57 -60 -63 -68 -98 -103 -112 -117 -126 -131 -140 -145 -154 -159 -168 -173 -240 -282 -285 -300 -303 -306 -309 -315 -318 -321 -324 -327 -330 -337 -344 -347 -358 -364 -367 -384 -399 -403 -406 -416 -419 -425 -428 -434 -440 -446 -449 -452 -456 -460 -464 -468 -472 -490 -513 -530 -533 -540 -548 -564 -571 -575 -578 -581 -584 -589 -592 -595 -599 -602 -651 -656 -659 -666 -669 -677 -687 -690 -695 -700 -719 -735 -740 -745 -755 -765 -768 -797 -810 -813 -924 -932 -936 -946 -954 -957 -961 -979 -982 -985 -990 -993

>YNCQ0001W	Upstream Sequence Complementary Strand
TTTAATTan>ATA>TTATAan>ATTan>ATTTCATTAATCATATTTATTn>TATTan>ATACTTTTATTTTGAAT
TATTn>TATATATTTATATCAGGCCGGGCGGGGGGGCGCCGCCCGCCTGGGGCTTCCTCACT
CCCTGGGGAGGGATTACCCTCCCCCTGGCTTGGGGAAAAATTCTTCCTCAGGTATATATA
TATAATTan>ATTTTTTTTCATTATATATATATATATAACCTTATCAATATAATAan>ATATGTCT
TTATACGAATTAATA>TTATA>TTATAGGTATAAGTATTAATTAAAAAATATATATATAATA
</span>TAATA>TTATAan>ATTAAATATAATATTTTTATTan>ATAAATAATAan>ATT>TTATAAATAAGAGGAA
AGCCCCAAGGCCGAGGGCACCGGCCCGGGGCCTTAATAan>ATTn>AATTan>ATTan>ATT>TAATAan>ATAan>A
TTATTn>AATAAATAATAAAATAGTAATTTTATATATTTATTTTTTATAan>ATTTTTCTATTTT
TTTTATTACAAATAAGAAATATATTTAATATATATATATATATTAATTn>AATTn>AATTn>AATT
AATTn>AATTan>ATTan>ATTTTTATATTAATATTTATTan>ATATTTATAan>ATAAGAAATAATTan>ATTn>TAT
ATATAAATATATAATATTTTCATAGAATTAATTan>ATTTTTATTTGTAAATTATTan>ATACTTA
ATATATAATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATTan>ATTTTAATAan>ATTan>ATTan>ATTAGTTATACTTTAATTan>ATTTT
TAGAATATTTTTTCATTACTTATGAGGAAAAATTTTTATTTTTCCCCAAGCCAGGGGGGG
GAAGGCATATGAATGCCCTCCCCCCAGGGAGTGAGGAAGAATTAATT>TAATAGAATTAAT
T>TAATAGAATTAATT>TAATAGAATTAATT>TAATAGAATTAATT>TAATAGAATTAATT>TAA
TTTTCCCCTGAAATATAAATATTTCATTAATA>TAATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAAATAAATA
AAATAAAAATAATAAAATAATATATATAATATATAATTAT