S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

YNCQ0016W

Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -995 -992 -989 -984 -972 -969 -966 -960 -957 -935 -906 -903 -900 -897 -894 -870 -808 -798 -780 -767 -764 -759 -755 -752 -749 -741 -733 -730 -727 -724 -717 -714 -711 -697 -693 -674 -670 -665 -662 -659 -656 -653 -649 -646 -639 -614 -609 -604 -513 -505 -501 -498 -495 -492 -488 -471 -468 -454 -450 -441 -434 -419 -399 -378 -371 -368 -359 -347 -344 -340 -329 -324 -319 -309 -304 -299 -294 -289 -284 -281 -278 -275 -272 -269 -263 -257 -250 -246 -230 -222 -217 -214 -210 -203 -194 -189 -176 -172 -168 -164 -157 -154 -106 -94 -88 -83 -78 -73 -70 -65 -62 -57 -54 -49 -45 -42 -37 -34 -29 -25 -22 -17 -8

>YNCQ0016W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TATATATATTAan>TTAan>ATA>TATTAAATTTTATAATAan>ATAan>ATTATAATAan>ATAGTAGTAGGTAT
AAATTTTAATAAAGAGTTTTATTCCAATGGAGTAATAATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAAAATAAAG
GATCTGTAGCTTAATAGTAAAGTACCATTTTGTCATAATGGAGGATGTCAGTGCAAATCT
GATTAGATTCGTATATTTATACTTAATATAAAAAAAATAAATAATAATCTTTTTTATTAan>T
TA>TATTTn>ATTAan>ATAan>ATAAATTATTTTGTTATTAan>TTAan>TTAan>ATTTATATTAan>ATAan>TTTTATAT
AAATTATTTn>ATTTAATCTTTCATTATATATTTn>AATA>TATTAan>TTAan>ATAan>TTAan>ATTn>AATAan>TTT
TATAATAAATAAATAAAATAAAATAAATATTT>TAATA>TAATACTCCTTCGGGGTTCGGTC
CCCCTCCCATTAGTATAGTATAGGGAGGGGTCCCTCACTCCTTCGGGGTCCCCGCCGGGG
CGGGGACTTATTTTTATATTTn>ATTAan>ATAan>ATAan>ATTn>AATTTTTATATAAATTTATTAan>TTTCT
TACAATATATTTn>ATTACTATTATTTTTTAATAATCTTATATATAATATATAAAATATATA
TATATTATATATATATATAAATATAATATATATTAan>TTATAAATATTTATAATCTTATTAan>A
TTn>AATTAGATTATATTA>TATTA>TATTAGATCATATTA>TATTA>TATTA>TATTA>TATTA>TAT
TATTAan>TTAan>TTAan>ATAan>TTTTTATTTTTATTTTATATTTn>AATAGTAAAAAATCATAATTTTAT
AATT>TATTAan>ATTn>ATTATATAATTTCATTAATA>TATTTCTTCTTTTTATTTn>ATTTn>ATTTn>AT
TACTTATTAan>ATAGTTCCGGGGCCCGGCCACGGGAGCCGGAACCCCGAAAGGAAAATAATA
TAAAAAATAATTATAATT>TATTA>TAATT>TATTAan>ATT>TATTAan>ATT>TATTAan>ATT>TATTTn>ATT
AATT>TATTAan>ATT>TATTTn>ATTAan>TTA>TATTTTTTTTAATAAA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -1 -15 -18 -30 -38 -50 -58 -66 -76 -86 -90 -99 -102 -150 -187 -203 -206 -210 -265 -268 -271 -274 -277 -282 -287 -292 -297 -302 -317 -322 -336 -340 -355 -361 -364 -371 -376 -392 -403 -412 -427 -437 -464 -484 -488 -491 -494 -602 -610 -614 -619 -624 -628 -632 -642 -645 -649 -652 -655 -658 -663 -693 -707 -710 -720 -723 -726 -737 -742 -745 -748 -757 -760 -773 -776 -780 -791 -882 -887 -890 -893 -896 -899 -902 -928 -953 -958 -962 -965 -977 -982 -985 -988

>YNCQ0016W	Upstream Sequence Complementary Strand
ATATATATAATAan>ATTan>ATA>TAATTTAAAATATTATTan>ATTn>AATA>TTATTATCATCATCCATA
TTTAAAATTATTTCTCAAAATAAGGTTACCTCATTATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATT>TTATTTC
CTAGACATCGAATTATCATTTCATGGTAAAACAGTATTACCTCCTACAGTCACGTTTAGA
CTAATCTAAGCATATAAATATGAATTATATTTTTTTTATTn>TATTan>ATTAGAAAAAATAATA
>ATATAAATAATTan>ATTan>ATT>TAATAAAACAATAATAan>ATAan>ATTAAATATAATTan>ATAAAATATA
TTTAATAAATAAATTAGAAAGTAATATATAAATTATA>TAATAan>ATTan>ATAan>ATTn>AATTan>ATAAA
ATATTATTn>TATTn>TATT>TTATT>TTATTn>TATAAAATTATATTATGAGGAAGCCCCAAGCCAG
GGGGAGGGTAATCATATCATATCCCTCCCCAGGGAGTGAGGAAGCCCCAGGGGCGGCCCC
GCCCCTGAATAAAAATATAAATAATTan>ATTan>ATTn>AATTAAAAATATATTTAAATAATAAAGA
ATGTTATATAAATAATGATAATAAAAAATTATTAGAATATATATTATATATTTTATATAT
ATATAATATATATATATATTTATA>TTATATATAATAan>ATATTTATAAATATTAGAATAATT
AATTAATCTAATATAATA>TAATATAATCTAGTATAATA>TAATA>TAATA>TAATA>TAATA>TA
ATAan>ATAan>ATAan>ATTan>ATAAAAATAAAAATAAAATATAAATTATCATTTTTTAGTATTAAAATA
TTAAATAATTn>AATAan>ATATATTAAAGTAATTATATAAAGAAGAAAAATAAATAAATAAATA
ATGAATAATTATCAAGGCCCCGGGCCGGTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTTCCTTTTATTan>AT
ATTTTTTATTn>AATATTAAATAATATTAAATAATTAAATAATTAAATAATTAAATAAATAA
TTAAATAATTAAATAAATAATAan>ATATAAAAAAAATTATTT